电荷中性嵌入剂选择性嵌入 GG 和 CG 步骤:HOMO-LUMO 相互作用对序列选择性药物嵌入 DNA 的意义
摘要:
我们已经从 D-异抗坏血酸及其三种非对映异构体合成了萘并吡喃酮环氧化物 4。包含 5'XGT3' 和 5'TGY3' 的 ODN 被 4(11R、13R)的 DNA 烷基化,其中 X 和 Y 是任何核苷酸碱基,发生在所有 G 残基上,除了 5'TGC3' 序列的 G。相比之下,4 的其他三种非对映异构体仅表现出微弱的 G 烷基化活性。4-G 加合物的微分 (1) H NMR NOE 证实了在 4 的环氧化物碳上发生了 G-N7 烷基化,伴随着环氧化物的 S(N)2 开环。4的G烷基化效率的定量HPLC分析显示G烷基化敏感性的顺序为TGGT,大约为CGT>>TGA>AGT>TGT>>TGC。该顺序与报告的黄曲霉毒素 B(1) 氧化物和卡普霉素 A(3) 的顺序完全一致,表明对这些 DNA 烷化剂观察到的序列选择性不依赖于结构,而很可能是由于 DNA 序列的固有特性。我们发现 4 获得的 G 烷基化敏感性的顺序与计算的含
电荷中性嵌入剂选择性嵌入 GG 和 CG 步骤:HOMO-LUMO 相互作用对序列选择性药物嵌入 DNA 的意义
摘要:
我们已经从 D-异抗坏血酸及其三种非对映异构体合成了萘并吡喃酮环氧化物 4。包含 5'XGT3' 和 5'TGY3' 的 ODN 被 4(11R、13R)的 DNA 烷基化,其中 X 和 Y 是任何核苷酸碱基,发生在所有 G 残基上,除了 5'TGC3' 序列的 G。相比之下,4 的其他三种非对映异构体仅表现出微弱的 G 烷基化活性。4-G 加合物的微分 (1) H NMR NOE 证实了在 4 的环氧化物碳上发生了 G-N7 烷基化,伴随着环氧化物的 S(N)2 开环。4的G烷基化效率的定量HPLC分析显示G烷基化敏感性的顺序为TGGT,大约为CGT>>TGA>AGT>TGT>>TGC。该顺序与报告的黄曲霉毒素 B(1) 氧化物和卡普霉素 A(3) 的顺序完全一致,表明对这些 DNA 烷化剂观察到的序列选择性不依赖于结构,而很可能是由于 DNA 序列的固有特性。我们发现 4 获得的 G 烷基化敏感性的顺序与计算的含