4-chloro-7-(2-deoxy-3,5-di-O-benzoyl-β-D-arabinofuranosyl)-5-fluoro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine | 909101-46-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 4-chloro-7-(2-deoxy-3,5-di-O-benzoyl-β-D-arabinofuranosyl)-5-fluoro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine
• 英文别名: 4-Chloro-5-fluoro-7-(2-deoxy-2-fluoro-3,5-di-O-benzoyl-beta-D-arabinofuranosyl)-7H-pyrrolo[2.3-d]pyrimidine；[(2R,3R,4S,5R)-3-benzoyloxy-5-(4-chloro-5-fluoropyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-4-fluorooxolan-2-yl]methyl benzoate
• CAS: 909101-46-8
• 化学式: C₂₅H₁₈ClF₂N₃O₅
• 分子量: 513.885
• InChiKey: ZORLGXRNIODWEQ-RKCFAAOBSA-N

物化性质

• 熔点：
  144 °C(Solv: methanol (67-56-1))
• 沸点：
  657.9±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.50±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  92.5
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-chloro-7-(2-deoxy-3,5-di-O-benzoyl-β-D-arabinofuranosyl)-5-fluoro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine 在 吡啶 、 三甲基氯硅烷 、 氨 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 N-[5-fluoro-7-(3-fluoro-4-hydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]-benzamide
  参考文献：
  名称：

  6-氮杂嘧啶和 7-脱氮杂嘌呤 2'-脱氧-2'-氟代阿拉伯糖核苷：寡核苷酸的合成、构象和性质

  摘要：

  描述了 2'-脱氧-2'-氟-β-d-阿拉伯呋喃糖基核苷（1b、2b 和 3b）的合成，并确定了它们在溶液和固态中的构象。除此之外，还制备了结构单元 10a、b 和 13a、b 并将其用于固相寡核苷酸合成。对于化合物 1a 和 1b，内酰胺质子被保护以避免其亚磷酰胺 10a、b 未解决的降解。已进行紫外线熔化研究以评估含有化合物 1a、b 和 3a、b 的寡核苷酸的热稳定性。

  DOI：

  10.1081/ncn-200059181
• 作为产物：
  描述：

  2-脱氧-2-氟-1,3,5-三苯甲酰基-alpha-D-阿拉伯呋喃糖 在 三(3,6-二氧杂庚基)胺 、 氢溴酸 、 溶剂黄146 、 potassium hydroxide 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 0.42h， 生成 4-chloro-7-(2-deoxy-3,5-di-O-benzoyl-β-D-arabinofuranosyl)-5-fluoro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine
  参考文献：
  名称：

  Sugar-modified derivatives of cytostatic 6-(het)aryl-7-deazapurine nucleosides: 2′-C-methylribonucleosides, arabinonucleosides and 2′-deoxy-2′-fluoroarabinonucleosides

  摘要：

  一系列新型糖基修饰的细胞毒性6-杂环-7-脱氮嘌呤核苷衍生物：2'-C-甲基核糖核苷、阿拉伯核苷和带有烷基、芳基和杂芳基团的位置6的2'-脱氧-2'-氟阿拉伯核苷，通过钯催化的相应（受保护的）6-氯（7-氟）-7-脱氮嘌呤核苷与（杂）芳基硼、杂芳基锡烷和三甲基铝的交叉偶联反应制备，最终通过去保护反应得到。关键中间体6-氯-7-脱氮嘌呤2'-C-甲基-β-D-核糖呋喃苷通过具有立体选择性的核碱基负离子糖基化与对甲苯基保护的1,2-脱氧-2'-C-甲基核糖呋喃糖制备而成。1,2-脱氧糖在3步合成，起始原料为易得的2-C-甲基核糖内酯。6-氯-7-脱氮嘌呤阿拉伯呋喃苷中间体通过从3′,5′-保护的6-氯-7-脱氮嘌呤核糖苷经2'-羟基氧化再还原而获得。所有制备的化合物均未显示出明显的细胞毒性或抗病毒活性。

  DOI：

  10.1135/cccc2011082

文献信息

• Fluorinated Pyrrolo[2,3-<i>d</i>]pyrimidine Nucleosides: 7- Fluoro-7-deazapurine 2′-Deoxyribofuranosides and 2′-Deoxy-2′-fluoroarabinofuranosyl Derivatives
  作者：Frank Seela、Kuiying Xu、Padmaja Chittepu

  DOI：10.1055/s-2006-942400

  日期：2006.6

  7-deaza-7-fluoro- 2¢-deoxyinosine (3a) and 7-deaza-7-fluoro- 2¢-deoxyguanosine (3c) as well as of the 2¢-deoxy-2¢-fluoroarabino- furanosyl derivatives 1b, 3b are described. Starting materials were 6-chloro-7-fluoro-7-deazapurine (4-chloro-5-fluoropyrrolo(2,3- d)pyrimidine, 4b) and 2-pivaloylamino-6-chloro-7-fluoro-7-deaza- purine (2-pivaloylamino-4-chloro-5-fluoropyrrolo(2,3-d)pyrimi- dine, 6). Nucleobase anion

  7-deaza-7-fluoro-2¢-deoxyadenosine (1a)、7-deaza-7-fluoro-2¢-deoxyinosine (3a) 和 7-deaza-7-fluoro-2¢-deoxyguanosine (3c) 的合成以及 2¢-deoxy-2¢-fluoroarabino-furanosyl 衍生物 1b、3b 的描述。起始原料是 6-chloro-7-fluoro-7-deazapurine (4-chloro-5-fluoropyrrolo(2,3-d)pyrimidine, 4b) 和 2-pivaloylamino-6-chloro-7-fluoro-7-deaza-嘌呤 (2-pivaloylamino-4-chloro-5-fluoropyrrolo(2,3-d)pyrimidine, 6)。4b 或 6 与卤代糖 7 或 9 的核碱基阴离子糖基化提供受保护的
• Synthesis and anti-HIV-1 activity of 4-substituted-7-(2′-deoxy-2′-fluoro-4′-azido-β-d-ribofuranosyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidine analogues
  作者：Xiaohe Guo、Yujiang Li、Le Tao、Qiang Wang、Shuyang Wang、Weidong Hu、Zhenliang Pan、Qinghua Yang、Yanmei Cui、Zhaopeng Ge、Lihong Dong、Xuejun Yu、Haoyun An、Chuanjun Song、Junbiao Chang

  DOI：10.1016/j.bmcl.2011.09.040

  日期：2011.11

  Three novel 4-subsituted-7-(2'-deoxy-2'-fluoro-4'-azido-beta-D-ribofuranosyl)pyrrolo[2,3-d] pyrimidine analogues were designed, synthesized, and tested for their anti-HIV-1 activity. Initial biological studies indicated that among these pyrrolo[2,3-d] pyrimidine ribonucleoside analogues, 4-amino-7-(2'-deoxy-2'- fluoro-4'-azido-beta-D-ribofuranosyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidine 10 exhibited the most potent anti-HIV-1 activity (EC50 = 0.5 +/- 0.3 mu M), while 4-hydroxy-7-(2'-deoxy-2'-fluoro-4'-azido-beta-D-ribofuranosyl)pyrrolo[ 2,3-d]pyrimidine 9 and 4-amino-5-fluoro-7-(2'-deoxy-2'-fluoro-4'-azido-beta-D-ribofuranosyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidine 11 showed moderate activity (EC50 = 13 +/- 8 and 5.4 +/- 0.3 mu M, respectively). The cytotoxicity of these compounds has also been assessed. No significant cytotoxicities were found for any of these compounds with concentrations up to 25 mu M. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.