4-chloro-N-(6-(4-methylpiperazin-1-yl) pyridin-3-yl)-3-(2-oxopyrrolidin-1-yl)benzamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 4-chloro-N-(6-(4-methylpiperazin-1-yl) pyridin-3-yl)-3-(2-oxopyrrolidin-1-yl)benzamide
• 英文别名: 4-chloro-N-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl]-3-(2-oxopyrrolidin-1-yl)benzamide
• 化学式: C₂₁H₂₄ClN₅O₂
• 分子量: 413.907
• InChiKey: DGRJAVIJBVHSKW-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  68.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3-氨基-4-氯苯甲酸甲酯 在 lithium hydroxide monohydrate 、 sodium hydride 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 10.0h， 生成 4-chloro-N-(6-(4-methylpiperazin-1-yl) pyridin-3-yl)-3-(2-oxopyrrolidin-1-yl)benzamide
  参考文献：
  名称：

  发现新型 TrkA 变构抑制剂：基于结构的虚拟筛选、生物学评估和初步 SAR 研究

  摘要：

  原肌球蛋白受体激酶 A (TrkA) 是治疗多种肿瘤类型和慢性疼痛的潜在治疗靶点。然而，大多数报道的 TrkA 抑制剂是缺乏亚型选择性的 ATP 竞争性泛 Trks 抑制剂。选择性 TrkA 抑制剂可提供有价值的治疗益处。在这里，我们描述了通过基于结构的虚拟筛选发现新型 TrkA 变构抑制剂。选择了一个有希望的命中（D5261， TrkA 细胞 IC 50  = 3.32 μM）进行进一步研究。计算了 TrkA 和D5261之间的结合自由能。此外，对D5261的初步构效关系 (SAR) 研究进行了调查。结果表明D5261可作为开发 TrkA 变构抑制剂的起点。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2021.114022

文献信息

• Discovery of novel TrkA allosteric inhibitors: Structure-based virtual screening, biological evaluation and preliminary SAR studies
  作者：Jing Guo、Shuang Xiang、Jie Wang、Yang Zhou、Zuqin Wang、Zhang Zhang、Ke Ding、Xiaoyun Lu

  DOI：10.1016/j.ejmech.2021.114022

  日期：2022.1

  numerous tumor types and chronic pain. However, most of the reported TrkA inhibitors are ATP competitive pan-Trks inhibitors that lack subtype selectivity. A selective TrkA inhibitor may provide valuable therapeutic benefits. Here, we described the discovery of novel TrkA allosteric inhibitors by structure-based virtual screening. A promising hit (D5261, TrkA cell IC50 = 3.32 μM) was selected for further

  原肌球蛋白受体激酶 A (TrkA) 是治疗多种肿瘤类型和慢性疼痛的潜在治疗靶点。然而，大多数报道的 TrkA 抑制剂是缺乏亚型选择性的 ATP 竞争性泛 Trks 抑制剂。选择性 TrkA 抑制剂可提供有价值的治疗益处。在这里，我们描述了通过基于结构的虚拟筛选发现新型 TrkA 变构抑制剂。选择了一个有希望的命中（D5261， TrkA 细胞 IC 50  = 3.32 μM）进行进一步研究。计算了 TrkA 和D5261之间的结合自由能。此外，对D5261的初步构效关系 (SAR) 研究进行了调查。结果表明D5261可作为开发 TrkA 变构抑制剂的起点。