methyl (S)-2-amino-3-((S)-2-oxopiperidin-3-yl)propanoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl (S)-2-amino-3-((S)-2-oxopiperidin-3-yl)propanoate
• 英文别名: Methyl (S)-2-amino-3-((S)-2-oxopiperidin-3-yl)propanoate；methyl (2S)-2-amino-3-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]propanoate
• 化学式: C₉H₁₆N₂O₃
• 分子量: 200.238
• InChiKey: BMMICNDLOITWKA-BQBZGAKWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.6
• 重原子数：
  14
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  81.4
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (S)-2-amino-3-((S)-2-oxopiperidin-3-yl)propanoate 在 sodium tetrahydroborate 、 1-羟基苯并三唑 、 戴斯-马丁氧化剂 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 31.0h， 生成 (S)-2-cinnamamido-3-methyl-N-((S)-1-oxo-3-((S)-2-oxopiperidin-3-yl)propan-2-yl)butanamide
  参考文献：
  名称：

  基于结构的 SARS-CoV-2 3C 类蛋白酶拟肽抑制剂设计作为有效的抗病毒候选药物

  摘要：

  严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 作为 2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 的病原体，已感染数百万人并夺去数十万人的生命。不幸的是，缺乏预防或治疗 COVID-19 的有效药物。SARS-CoV-2 的3C 样蛋白酶 (3CL Pro ) 对病毒复制和转录至关重要，是开发抗 SARS-CoV-2 药物的有吸引力的靶标。针对3CL Pro，我们筛选了我们的蛋白酶抑制剂库，得到了化合物10a作为弱抑制SARS-CoV-2 3CL Pro的靶标，并确定了10a的共晶结构和蛋白酶。基于对 hit 与 SARS-CoV-2 3CL Pro之间的蛋白配体复合物的深入理解，我们设计了一系列拟肽抑制剂，对 SARS-CoV-2 3CL Pro 具有突出的抑制活性，对 SARS-CoV-2 3CL Pro具有出色的抗病毒效力SARS-CoV-2。X 射线共晶研究明确描述了其他关键抑制剂与

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2022.114458
• 作为产物：
  描述：

  谷氨酸二甲酯 在 sodium tetrahydroborate 、 cobalt(II) chloride hexahydrate 、 三乙胺 、 三氟乙酸 、 lithium hexamethyldisilazane 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 methyl (S)-2-amino-3-((S)-2-oxopiperidin-3-yl)propanoate
  参考文献：
  名称：

  Cyanohydrin as an Anchoring Group for Potent and Selective Inhibitors of Enterovirus 71 3C Protease

  摘要：

  Cyanohydrin derivatives as enterovirus 71 (EV71) 3C protease (3C(pro)) inhibitors have been synthesized and assayed for their biochemical and antiviral activities. Compared with the reported inhibitors, cyanohydrins (1S,2S,2'S,5S)-16 and (1R,2S,2'S,5S)-16 exhibited significantly improved activity and attractive selectivity profiles against other proteases, which were a result of the specific interactions between the cyanohydrin moiety and the catalytic site of 3C(pro). Cyanohydrin as an anchoring group with high selectivity and excellent inhibitory activity represents a useful choice for cysteine protease inhibitors.

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.5b01013

文献信息

• Synthesis and structure–activity relationship of α-keto amides as enterovirus 71 3C protease inhibitors
  作者：Debin Zeng、Yuying Ma、Rui Zhang、Quandeng Nie、Zhengjie Cui、Yaxin Wang、Luqing Shang、Zheng Yin

  DOI：10.1016/j.bmcl.2016.02.039

  日期：2016.4

  α-Keto amide derivatives as enterovirus 71 (EV71) 3C protease (3Cpro) inhibitors have been synthesized and assayed for their biochemical and antiviral activities. structure–activity relationship (SAR) study indicated that small moieties were primarily tolerated at P1′ and the introduction of para-fluoro benzyl at P2 notably improved the potency of inhibitor. Inhibitors 8v, 8w and 8x exhibited satisfactory

  已经合成了作为肠病毒71（EV71）3C蛋白酶（3C pro）抑制剂的α-酮酰胺衍生物，并对其生化和抗病毒活性进行了测定。结构-活性关系（SAR）研究表明，在P1'处主要耐受小部分，在P2处引入对氟苄基可显着提高抑制剂的效力。抑制剂8v，8w和8x表现出令人满意的活性（IC 50分别 为1.32±0.26μM，1.88±0.35μM和1.52±0.31μM）和良好的CC 50值（CC 50  > 100μM）。α-酮酰胺可能是EV71 3C pro抑制剂的弹头的不错选择。
• [EN] PEPTIDOMIMETICS FOR THE TREATMENT OF CORONAVIRUS AND PICORNAVIRUS INFECTIONS<br/>[FR] PEPTIDOMIMÉTIQUES POUR LE TRAITEMENT D'INFECTIONS PAR CORONAVIRUS ET PICORNAVIRUS
  申请人：UNIV EMORY

  公开号：WO2020247665A1

  公开（公告）日：2020-12-10

  Compounds, compositions and methods for preventing, treating or curing a coronavirus, picornavirus, and/or Hepeviridae virus infection in human subjects or other animal hosts. Specific viruses that can be treated include enteroviruses. In one embodiment, the compounds can be used to treat an infection with a severe acute respiratory syndrome virus, such as human coronavirus 229E, SARS, MERS, SARS-CoV-1 (OC43), and SARS-CoV- 2. In another embodiment, the methods are used to treat a patient co-infected with two or more of these viruses, or a combination of one or more of these viruses and norovirus.

  用于预防、治疗或治愈人类主体或其他动物宿主中的冠状病毒、小RNA病毒和/或肝炎病毒感染的化合物、组合物和方法。可治疗的特定病毒包括肠病毒。在一个实施例中，这些化合物可用于治疗严重急性呼吸综合征病毒感染，如人类冠状病毒229E、SARS、MERS、SARS-CoV-1（OC43）和SARS-CoV-2。在另一个实施例中，这些方法用于治疗患有两种或更多这些病毒的患者，或一种或多种这些病毒与诺如病毒的组合。
• 3D-quantitative structure-activity relationship study for the design of novel enterovirus A71 3C protease inhibitors
  作者：Quandeng Nie、Xiaoyi Xu、Qi Zhang、Yuying Ma、Zheng Yin、Luqing Shang

  DOI：10.1111/cbdd.13344

  日期：2018.10

  three novel compounds (I–III) were designed and evaluated for their biochemical activity against 3C protease and anti‐enterovirus A71 activity in vitro. III exhibited excellent inhibitory activity (IC50 = 0.031 ± 0.005 μM, EC50 = 0.036 ± 0.007 μM). Thus, this study provides a useful quantitative structure‐activity relationships model to develop potent inhibitors for enterovirus A71 3C protease.

  本研究建立了肠道病毒A71 3C蛋白酶抑制剂的三维定量构效关系模型。分析了蛋白质-配体相互作用的指纹，以生成药效团模型。基于AutoGPA的Flexible Alignment建立了可预测的，可靠的三维定量构效关系模型。此外，设计并评估了三种新型化合物（I – III）在体外对3C蛋白酶的抗生化活性和抗肠道病毒A71的活性。III表现出优异的抑制活性（IC 50  = 0.031±0.005μM，EC 50 = 0.036±0.007μM）。因此，本研究提供了有用的定量构效关系模型，以开发有效的肠道病毒A71 3C蛋白酶抑制剂。
• Inhibitors of cysteine proteases and methods of use thereof
  申请人：Pardes Biosciences, Inc.

  公开号：US11124497B1

  公开（公告）日：2021-09-21

  The disclosure provides compounds with warheads and their use in treating medical diseases or disorders, such as viral infections. Pharmaceutical compositions and methods of making various compounds with warheads are provided. The compounds are contemplated to inhibit proteases, such as the 3C, CL- or 3CL-like protease. Exemplary compounds provided include Formula II-I, where R3, RB are provided herein:

  该披露提供了具有战斗头的化合物及其在治疗医学疾病或紊乱，如病毒感染方面的用途。提供了制药组合物和制备各种带有战斗头的化合物的方法。这些化合物被认为能够抑制蛋白酶，如3C、CL-或3CL样蛋白酶。提供的示例化合物包括Formula II-I，其中R3、RB如下所示：
• [EN] ANTI-VIRAL COMPOUNDS FOR TREATING CORONAVIRUS, PICORNAVIRUS, AND NOROVIRUS INFECTIONS<br/>[FR] COMPOSÉS ANTIVIRAUX POUR LE TRAITEMENT D'INFECTIONS À CORONAVIRUS, PICORNAVIRUS ET NOROVIRUS
  申请人：ALIGOS THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2021252491A1

  公开（公告）日：2021-12-16

  Provided herein are compounds of Formula (I), or pharmaceutically acceptable salts thereof, pharmaceutical compositions that include a compound described herein (including pharmaceutically acceptable salts of a compound described herein) and methods of synthesizing the same. Also provided herein are methods of treating coronavirus, Picomavirus and Norovims infections with a compound of Formula (I), or a pharmaceutically acceptable salt thereof.

  本文提供了式（I）的化合物或其药用盐，包括包含本文描述的化合物（包括本文描述的化合物的药用盐）的药物组合物以及合成这些化合物的方法。本文还提供了使用式（I）的化合物或其药用盐治疗冠状病毒、皮科病毒和诺如病毒感染的方法。