Effect of N-o-nitrobenzylation on conformation and membrane permeability of linear peptides
作者:Zhihan Huang、Mayumi Ishii、Eri Watanabe、Kayoko Kanamitsu、Kempei Tai、Hiroyuki Kusuhara、Tomohiko Ohwada、Yuko Otani
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107220
日期:2024.4
on the passive membrane permeability by means of parallel artificial membrane permeability assay (PAMPA). Photoreaction of peptides containing one or two NB groups proceeded cleanly in moderate to high yields, releasing the unprotected parent linear peptide. The NB-modified peptides showed a cis/trans conformational equilibrium, while after photolysis, the unprotected linear peptides showed only the
在这项研究中,我们通过实验和计算研究探索了光可去除的硝基苯甲基(NB)基团作为操纵膜渗透性和调节线性肽构象的工具的潜力。我们发现,与相应的未修饰肽相比,引入一个或多个 NB 基团显着增加了渗透性并改变了构象。我们通过平行人工膜通透性测定(PAMPA)彻底研究了肽长度、NB基团数量NB插入位置以及N端和C端保护基团的引入对被动膜通透性的影响。含有一个或两个 NB 基团的肽的光反应以中等到高产率干净地进行,释放出未受保护的母体线性肽。 NB修饰的肽表现出顺/反构象平衡,而光解后,未保护的线性肽仅表现出α-酰胺构象。此外,对NB修饰肽和甲基化肽进行了全面比较,包括构象分析和理化性质。 -取代的肽有利于折叠状结构,这可能有助于改善渗透性。