6-oxo-6-(prop-2-ynylamino)hexan-1-aminium trifluoroacetate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: 6-oxo-6-(prop-2-ynylamino)hexan-1-aminium trifluoroacetate
• 英文别名: [6-Oxo-6-(prop-2-ynylamino)hexyl]azanium;2,2,2-trifluoroacetate；[6-oxo-6-(prop-2-ynylamino)hexyl]azanium;2,2,2-trifluoroacetate
• 化学式: C₂HF₃O₂*C₉H₁₆N₂O
• 分子量: 282.263
• InChiKey: KEFPDYVPHSQCMF-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.16
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  96.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-oxo-6-(prop-2-ynylamino)hexan-1-aminium trifluoroacetate 、 (+)生物素-N-琥珀酰亚胺基酯 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 14.0h， 生成 6-[5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamido]-N-(prop-2-yn-1-yl)hexanamide
  参考文献：
  名称：

  基于左戊酰基酯的可裂解接头，用于基于活性的蛋白质谱分析

  摘要：

  获得连接：标题连接子在各种生物学条件下均稳定，可以用肼化学选择性切割（请参阅方案）。在基于活动的富集和鉴定细胞提取物中蛋白酶体活性亚基中证明了其用途。

  DOI：

  10.1002/anie.201001767
• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl (6-oxo-6-(prop-2-yn-1-ylamino)hexyl)carbamate 、 三氟乙酸 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 6-oxo-6-(prop-2-ynylamino)hexan-1-aminium trifluoroacetate
  参考文献：
  名称：

  基于左戊酰基酯的可裂解接头，用于基于活性的蛋白质谱分析

  摘要：

  获得连接：标题连接子在各种生物学条件下均稳定，可以用肼化学选择性切割（请参阅方案）。在基于活动的富集和鉴定细胞提取物中蛋白酶体活性亚基中证明了其用途。

  DOI：

  10.1002/anie.201001767

文献信息

• Photocleavable linker methods and compositions
  申请人：The Board of Trustees of the Leland Stanford Junior University

  公开号：US07923562B2

  公开（公告）日：2011-04-12

  Bifunctional linkers are provided that comprise a photocleavable moiety flanked by two different amine reactive moieties. In some embodiments the photocleavable moiety is a dimethoxynitrobenzyl moiety. In other embodiments the photocleavable moiety is 8-bromo-7-hydroxyquinoline. In other embodiments the photocleavable moiety is nitrodibenzofuran. In other embodiments the photocleavable moiety is 6-bromo-7-hydroxycoumarin-4-ylmethyl. The linkers find use in synthetic methods, including the generation of photocleavable oligonucleotides, e.g. caged morpholinos.

  提供了含有光解离基团的双功能连接剂，该基团被两种不同的胺反应基团所包围。在某些实施例中，光解离基团是二甲氧基硝基苯基基团。在其他实施例中，光解离基团是8-溴-7-羟基喹啉。在其他实施例中，光解离基团是硝基二苯呋喃。在其他实施例中，光解离基团是6-溴-7-羟基香豆素-4-基甲基。这些连接剂在合成方法中发挥作用，包括生成光解离寡核苷酸，例如被光遮蔽的吗啉寡核苷酸。
• PHOTOCLEAVABLE LINKER METHODS AND COMPOSITIONS
  申请人：Chen James K.

  公开号：US20100022761A1

  公开（公告）日：2010-01-28

  Bifunctional linkers are provided that comprise a photocleavable moiety flanked by two different amine reactive moieties. In some embodiments the photocleavable moiety is a dimethoxynitrobenzyl moiety. In other embodiments the photocleavable moiety is 8-bromo-7-hydroxyquinoline. In other embodiments the photocleavable moiety is nitrodibenzofuran. In other embodiments the photocleavable moiety is 6-bromo-7-hydroxycoumarin-4-ylmethyl. The linkers find use in synthetic methods, including the generation of photocleavable oligonucleotides, e.g. caged morpholinos.

  提供了双官能团连接剂，其包含一个光解离基团，两侧分别为两种不同的胺反应性官能团。在某些实施例中，光解离基团是二甲氧基硝基苯基基团。在其他实施例中，光解离基团是8-溴-7-羟基喹啉。在其他实施例中，光解离基团是硝基二苯并呋喃。在其他实施例中，光解离基团是6-溴-7-羟基香豆素-4-基甲基。这些连接剂可用于合成方法，包括生成光解离寡核苷酸，例如被笼罩的形态诱导物。
• Photocleavable Linker Methods and Compositions
  申请人：Chen James K.

  公开号：US20110178281A1

  公开（公告）日：2011-07-21

  Bifunctional linkers are provided that comprise a photocleavable moiety flanked by two different amine reactive moieties. In some embodiments the photocleavable moiety is a dimethoxynitrobenzyl moiety. In other embodiments the photocleavable moiety is 8-bromo-7-hydroxyquinoline. In other embodiments the photocleavable moiety is nitrodibenzofuran. In other embodiments the photocleavable moiety is 6-bromo-7-hydroxycoumarin-4-ylmethyl. The linkers find use in synthetic methods, including the generation of photocleavable oligonucleotides, e.g. caged morpholinos.

  提供了双功能连接剂，其包括一个光解性基团，其两侧分别为两种不同的胺反应性基团。在某些实施例中，光解性基团是二甲氧基硝基苯基团。在其他实施例中，光解性基团是8-溴-7-羟基喹啉。在其他实施例中，光解性基团是硝基二苯并呋喃。在其他实施例中，光解性基团是6-溴-7-羟基香豆素-4-基甲基。这些连接剂在合成方法中发挥作用，包括光解性寡核苷酸的生成，例如笼罩型Morpholinos。
• US7923562B2
  申请人：——

  公开号：US7923562B2

  公开（公告）日：2011-04-12
• A Cleavable Linker Based on the Levulinoyl Ester for Activity-Based Protein Profiling
  作者：Paul P. Geurink、Bogdan I. Florea、Nan Li、Martin D. Witte、Joeri Verasdonck、Chi-Lin Kuo、Gijs A. van der Marel、Herman S. Overkleeft

  DOI：10.1002/anie.201001767

  日期：2010.9.10

  Get linked: The title linker is stable under various biological conditions and can be cleaved chemoselectively with hydrazine (see scheme). Its use is demonstrated in the activity‐based enrichment and identification of proteasome active subunits from cell extracts.

  获得连接：标题连接子在各种生物学条件下均稳定，可以用肼化学选择性切割（请参阅方案）。在基于活动的富集和鉴定细胞提取物中蛋白酶体活性亚基中证明了其用途。