Z-Phe-L-Phe(OMe)-OMe

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Z-Phe-L-Phe(OMe)-OMe
• 英文别名: (S)-methyl 2-((S)-2-(((benzyloxy)carbonyl)amino)-3-phenylpropanamido)-3-(4-methoxyphenyl)propanoate；Cbz-Phe-Tyr(Me)-OMe；methyl (2S)-3-(4-methoxyphenyl)-2-[[(2S)-3-phenyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)propanoyl]amino]propanoate
• 化学式: C₂₈H₃₀N₂O₆
• 分子量: 490.556
• InChiKey: FVOOYLXRAYMKHY-DQEYMECFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.7
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.25
• 拓扑面积：
  103
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Z-Phe-L-Phe(OMe)-OMe 在 sodium hydroxide 、 盐酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 N-benzyloxycarbonyl-L-phenylalanyl-O-methyl-L-tyrosine
  参考文献：
  名称：

  呋喃基肽作为20S蛋白酶体抑制剂的合成，生物活性，对接和分子动力学研究

  摘要：

  蛋白酶体抑制剂是用于许多疗法的有前途的化合物，包括心血管疾病和眼病，糖尿病和癌症。我们先前报道了一系列基于呋喃的肽抑制剂，它们对蛋白酶体β5亚基具有中等效力，并假设C末端呋喃酮基序可以与催化残基苏氨酸1形成共价键。在这种情况下，我们描述了进一步的优化方法设计并合成了一系列基于呋喃的肽，并设计了一系列二肽和三肽抑制剂，旨在提高效能和更好的溶解度。在酶和细胞分析中，大多数三肽抑制剂均表现出作为β5亚基抑制剂的增强的效能和选择性，并且在各种肿瘤细胞系中也观察到了良好的抗肿瘤活性。然而，没有观察到对二肽化合物有抑制作用，这使我们推测采用了非共价结合方式。进行了对接研究和分子动力学模拟，以验证这一推测，结果表明，呋喃基酮基序和Thr1之间的距离略长，无法形成共价键。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201402484
• 作为产物：
  描述：

  Boc-L-酪氨酸甲酯 在 N-甲基吗啉 、 potassium carbonate 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 Z-Phe-L-Phe(OMe)-OMe
  参考文献：
  名称：

  呋喃基肽作为20S蛋白酶体抑制剂的合成，生物活性，对接和分子动力学研究

  摘要：

  蛋白酶体抑制剂是用于许多疗法的有前途的化合物，包括心血管疾病和眼病，糖尿病和癌症。我们先前报道了一系列基于呋喃的肽抑制剂，它们对蛋白酶体β5亚基具有中等效力，并假设C末端呋喃酮基序可以与催化残基苏氨酸1形成共价键。在这种情况下，我们描述了进一步的优化方法设计并合成了一系列基于呋喃的肽，并设计了一系列二肽和三肽抑制剂，旨在提高效能和更好的溶解度。在酶和细胞分析中，大多数三肽抑制剂均表现出作为β5亚基抑制剂的增强的效能和选择性，并且在各种肿瘤细胞系中也观察到了良好的抗肿瘤活性。然而，没有观察到对二肽化合物有抑制作用，这使我们推测采用了非共价结合方式。进行了对接研究和分子动力学模拟，以验证这一推测，结果表明，呋喃基酮基序和Thr1之间的距离略长，无法形成共价键。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201402484

文献信息

• Relationship between the Hydrophobicity of Dipeptides and the Michaelis–Menten Constant<i>K</i>_mof Their Hydrolysis by Carboxypeptidase-Y and Carboxypeptidase-A
  作者：Yoshifumi Kanosue、Satoshi Kojima、Yoshikazu Hiraga、Katsuo Ohkata

  DOI：10.1246/bcsj.77.1187

  日期：2004.6

  The enzymatic hydrolysis of dipeptides by carboxypeptidase-Y and carboxypeptidase-A was investigated. In the enzymatic hydrolysis of the dipeptides, a good linear relationship (r = 0.997 and 0.999) was found between the Michaelis–Menten constant (Km) and the hydrophobicity of the substrates evaluated from relative elution volume in reversed-phase HPLC. The correlation suggests that the hydrophobicity of the C-terminal amino acid is a major factor in governing the stability of the enzyme–substrate complex. The difference in the slope of the linear-regression lines seems to reflect the degree of relative hydrophobicity of the binding pockets in carboxypeptidase-Y and carboxypeptidase-A.

  研究了羧肽酶Y和羧肽酶A对二肽的酶解水解作用。在二肽的酶解水解过程中，发现米氏常数（Km）与通过反相高效液相色谱的相对洗脱体积评估的底物疏水性之间存在良好的线性关系（r = 0.997 和 0.999）。这种相关性表明，C端氨基酸的疏水性是影响酶-底物复合体稳定性的主要因素。线性回归线的斜率差异似乎反映了羧肽酶Y和羧肽酶A结合口袋的相对疏水性程度。