1-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(aminomethyl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione | 1250424-78-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(aminomethyl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• 英文别名: 5’-amino-5’-deoxy-2’,3’-O-isopropylidene-5-methyluridine
• CAS: 1250424-78-2
• 化学式: C₁₃H₁₉N₃O₅
• 分子量: 297.311
• InChiKey: PNLANFPUMUEKFF-TURQNECASA-N

物化性质

• 密度：
  1.288±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.78
• 重原子数：
  21.0
• 可旋转键数：
  2.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  108.57
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(aminomethyl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 在 palladium on carbon 、 水 、 氢气 、 sodium cyanoborohydride 、 溶剂黄146 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 5’-deoxy-{2-(thymine 1-yl)-6-[2-(thymine 1-yl)-6-azidomethylmorpholine-4-yl methyl-(2-(thymine-1-yl))morpholine-4-ylmethyl]morpholine-4-yl methyl}-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  紧密连接的吗啉代核苷嵌合体：新型、紧凑的阳离子寡核苷酸类似物

  摘要：

  核酸的聚阴离子磷酸二酯主链导致高核酸酶敏感性和低细胞摄取，因此是天然寡核苷酸的生物应用的主要障碍。主链修饰，特别是电荷改变是一种经过验证的策略，可以提供具有改进特性的人工寡核苷酸。在这里，我们描述了由吗啉代和核糖或脱氧核糖核苷组成的新型寡核苷酸类似物的合成，其中核苷单元的5'-氨基提供吗啉环的氮。该合成方案与三苯甲基和二甲氧基三苯甲基保护基团和叠氮基官能团兼容，并扩展到高级低聚物的合成。由于吗啉单元的N-烷基化叔胺结构，嵌合体在水介质中带正电荷。

  DOI：

  10.1039/d1ob01174j
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(p-toluenesulfonyl)-5-methyluridine 在 sodium azide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 1-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(aminomethyl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  通过无配体铜催化的分子内胺化反应合成1-芳基-1H-吲唑

  摘要：

  描述了由邻卤代的芳基醛或酮和芳基肼合成1-芳基-1- H-吲唑的一般方法。该方案包括分子间缩合和无配体的铜催化的分子内Ullmann型偶联反应。该方法适用于多种底物，以高收率生产吲唑产品。

  DOI：

  10.1002/cjoc.201190224

文献信息

• Deploying solid-phase synthesis to access thymine-containing nucleoside analogs that inhibit DNA repair nuclease SNM1A
  作者：Christine A. Arbour、Ellen M. Fay、Joanna F. McGouran、Barbara Imperiali

  DOI：10.1039/d3ob00836c

  日期：——

  Nucleoside analogs show useful bioactive properties. A versatile solid-phase synthesis that readily enables the diversification of thymine-containing nucleoside analogs is presented. The utility of the approach is demonstrated with the preparation of a library of compounds for analysis with SNM1A, a DNA damage repair enzyme that contributes to cytotoxicity. This exploration provided the most promising

  核苷类似物显示出有用的生物活性特性。提出了一种通用的固相合成方法，可以轻松实现含胸腺嘧啶核苷类似物的多样化。该方法的实用性通过制备用于 SNM1A 分析的化合物库来证明，SNM1A 是一种有助于细胞毒性的 DNA 损伤修复酶。这项探索提供了迄今为止最有前途的 SNM1A 核苷衍生抑制剂，IC 50为 12.3 μM。
• Synthesis and antitumor activity of novel ribonucleosides with C-5 OH replaced by a diaminopyrimidinyl group
  作者：Kerang Wang、Ling Wu、Zhanbin Qin、Xinhao Yan、Xiaoliu Li、Hua Chen、Pingzhu Zhang、Jinchao Zhang

  DOI：10.1016/j.bmcl.2010.12.069

  日期：2011.2

  A series of novel ribonucleosides with C-5 OH replaced by a diaminopyrimidinyl group were synthesized by successively nucleophilic substitutions of 5'-deoxy-5'-amino-ribonucleosides with 2,4-dichloropyrimidine and then with various fatty amines under microwave irradiation. Their anticancer activities in vitro were preliminarily evaluated. Compounds 7a and 8a only exhibited anticancer activity against A549 cell line with the IC50 values of 10.73 and 10.99 mu M, respectively. In addition, 7h and 8h showed potent activities against both A549 and Hela cell lines with the IC50 values of 12.71, 8.55 and 8.44, 5.55 mu M, respectively. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.