O-benzyl-O-β-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidite | 196197-29-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: O-benzyl-O-β-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidite
• 英文别名: (benzyloxy)(cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphin；benzyl 2-cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoramidite；benzyl-2-cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoramidite；Benzyl (2-cyanoethyl) diisopropylphosphoramidite；3-[[di(propan-2-yl)amino]-phenylmethoxyphosphanyl]oxypropanenitrile
• CAS: 196197-29-2
• 化学式: C₁₆H₂₅N₂O₂P
• 分子量: 308.36
• InChiKey: HXFHQAWYBQFBCM-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  358.8±35.0 °C(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  45.5
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  O-benzyl-O-β-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidite 在 四氮唑 、 叔丁基过氧化氢 作用下， 以 癸烷 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.5h， 生成 benzyl 3,7,11,15-tetramethylhexadecylphosphoryl 2,3-di-O-benzyl-4,6-O-benzylidene-α-D-mannopyranoside
  参考文献：
  名称：

  β-甘露吡喃糖基磷酸异戊二烯酸酯的高效，非对映选择性化学合成。

  摘要：

  [反应：参见正文]在三氟甲磺酸酐活化下，将四丁基苄基二氢植酸磷酸四铵与S-苯基2,3-二-O-benyl-4，6-O-亚苄基-1-硫代-α-D-甘露吡喃糖苷S-氧化物偶联在-78℃下将其溶于甲苯中，以56％的产率得到相应的β-甘露糖基磷酸酯，没有可检测到的α-端基异构体的形成。然后在液体氨中用钠处理，得到未保护的β-甘露糖基磷酸异戊二烯酸酯。

  DOI：

  10.1021/ol006725p
• 作为产物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 苯甲醇 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 反应 1.0h， 以94%的产率得到O-benzyl-O-β-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  β-甘露吡喃糖基磷酸异戊二烯酸酯的高效，非对映选择性化学合成。

  摘要：

  [反应：参见正文]在三氟甲磺酸酐活化下，将四丁基苄基二氢植酸磷酸四铵与S-苯基2,3-二-O-benyl-4，6-O-亚苄基-1-硫代-α-D-甘露吡喃糖苷S-氧化物偶联在-78℃下将其溶于甲苯中，以56％的产率得到相应的β-甘露糖基磷酸酯，没有可检测到的α-端基异构体的形成。然后在液体氨中用钠处理，得到未保护的β-甘露糖基磷酸异戊二烯酸酯。

  DOI：

  10.1021/ol006725p

文献信息

• Efficient, Diastereoselective Chemical Synthesis of a β-Mannopyranosyl Phosphoisoprenoid
  作者：David Crich、Vadim Dudkin

  DOI：10.1021/ol006725p

  日期：2000.11.1

  [reaction: see text] Tetrabutylammonium benzyl dihydrophytylphosphate was coupled to S-phenyl 2,3-di-O-benyl-4, 6-O-benzylidene-1-thio-alpha-D-mannopyranoside S-oxide on activation with triflic anhydride in toluene at -78 degrees C to give the corresponding beta-mannosyl phosphate in 56% yield with no detectable formation of the alpha-anomer. Treatment with sodium in liquid ammonia then afforded the

  [反应：参见正文]在三氟甲磺酸酐活化下，将四丁基苄基二氢植酸磷酸四铵与S-苯基2,3-二-O-benyl-4，6-O-亚苄基-1-硫代-α-D-甘露吡喃糖苷S-氧化物偶联在-78℃下将其溶于甲苯中，以56％的产率得到相应的β-甘露糖基磷酸酯，没有可检测到的α-端基异构体的形成。然后在液体氨中用钠处理，得到未保护的β-甘露糖基磷酸异戊二烯酸酯。
• Synthesis of phosphorofluoridate analogues of myo-inositol 1,4,5,-tris(phosphate) and their biological activity
  作者：Yutaka Watanabe、Shinsuke Sofue、Shoichiro Ozaki、Masato Hirata

  DOI：10.1039/cc9960001815

  日期：——

  Phosphorofluoridate analogues, of myo-inositol 1,4,5-tris(phosphate), 4-and 5-phosphorofluoridate and 4,5-bis(phosphorofluoridate), were prepared and their biological acivity towards InsP3 5-phosphatase was found to be similar to or more activ than that for InsP3 while they proved to be less active in the binding assay than InsP3.

  制备了肌醇 1,4,5-三（磷酸）、4-和 5-氟磷酸以及 4,5-双（氟磷酸）的氟磷酸类似物，发现它们对 InsP3 5-磷酸酶的生物活性相似比 InsP3 更活跃，但在结合测定中证明它们的活性低于 InsP3。
• Synthesis of the Fully Phosphorylated GPI Anchor Pseudohexasaccharide of <i>Toxoplasma </i><i>g</i><i>ondii</i>
  作者：Klaus Pekari、Denis Tailler、Ralf Weingart、Richard R. Schmidt

  DOI：10.1021/jo015840q

  日期：2001.11.1

  stereoselectivity and good yields in the glycosylation reactions, anchimeric assistance was employed. To enable regioselective attachment of the two different phosphorus esters, the 6f-O-silyl group of 32 was first removed and the aminoethyl phosphate residue was attached. Then the MPM group was oxidatively removed, and the second phosphate residue was introduced. Unprotected 1a was then liberated in two steps:

  完全磷酸化的糖基磷脂酰肌醇（GPI）锚定假六糖1a的逆合成导致了结构单元2-6，其中5和6是已知的。假二糖结构单元2的形成基于容易获得的结构单元7，该结构单元7通过衍生物11及其与已知供体12的糖基化作用，获得了所需的化合物2。结构单元3，允许所需的所有羟基进入，由甘露糖分五个步骤制备。从容易获得的前体中获得结构单元4，该结构单元4与3反应生成二糖23。决定性假六糖中间体32的合成基于23与5，然后与6，最后与2的反应。由于在糖基化反应中具有高的立体选择性和良好的收率，因此使用了嵌合助剂。为了使两种不同的磷酸酯区域选择性地连接，首先除去32的6f-O-甲硅烷基，并连接磷酸氨基乙基残基。然后，氧化除去MPM基团，并引入第二磷酸盐残基。然后分两步释放未保护的1a：用甲醇钠处理除去了乙酰基保护基团，最后，催化氢化得到了所需的目标分子，该分子可以在结构上完全分配。
• Synthesis of inosine 6-phosphate diesters via phosphitylation of the carbonyl oxygen
  作者：Natsuhisa Oka、Yasuhiro Morita、Yuta Itakura、Kaori Ando

  DOI：10.1039/c3cc46617e

  日期：——

  Inosine derivatives bearing a phosphodiester group at the O6-position of the nucleobase were synthesized via phosphitylation of the carbonyl oxygen using phosphoramidites activated by non-nucleophilic acidic activators.

  在核碱基 O6 位上带有磷酸二酯基团的肌苷衍生物是利用非亲核酸性活化剂激活的磷酰胺基团通过羰基氧的磷酸化作用合成的。
• 5′ phosphate mimics
  申请人：Alnylam Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US10131908B2

  公开（公告）日：2018-11-20

  The present invention provides nucleosides and oligonucleotides comprising a 5′ phosphate mimics of formula (IVc) or (Vc), One aspect of the present invention relates to modified nucleosides and oligonucleotides comprising such dinucleotide of formula (Ia). Another aspect of the invention relates to a method of inhibiting the expression of a gene in call, the method comprising (a) contacting an oligonucleotide of the invention with the cell; and (b) maintaining the cell from step (a) for a time sufficient to obtain degradation of the mRNA of the target gene.

  本发明提供了包含式（IVc）或（Vc）的 5′磷酸模拟物的核苷和寡核苷酸、 本发明的一个方面涉及包含式(Ia)的二核苷酸的修饰核苷和寡核苷酸。本发明的另一方面涉及一种抑制呼唤中基因表达的方法，该方法包括：(a)将本发明的寡核苷酸与细胞接触；(b)将细胞从步骤(a)维持足够长的时间，使目的基因的 mRNA 降解。