Phosphatase-Inert Glucosamine 6-Phosphate Mimics Serve as Actuators of the <i>glmS</i> Riboswitch
作者:Xiang Fei、Thomas Holmes、Julianna Diddle、Lauren Hintz、Dan Delaney、Alex Stock、Danielle Renner、Molly McDevitt、David B. Berkowitz、Juliane K. Soukup
DOI:10.1021/cb500458f
日期:2014.12.19
GlcN6P analogs bearing phosphatase-inert surrogates in place of the natural phosphate ester. Self-cleavage assays with the Bacillus cereusglmS riboswitch give a broad SAR. Two analogs display significant activity, namely, the 6-deoxy-6-phosphonomethyl analog (5) and the 6-O-malonyl ether (13). Kinetic profiles show a 22-fold and a 27-fold higher catalytic efficiency, respectively, for these analogs vs
该GLMS核糖开关基因调节核糖开关和催化性RNA中是独一无二的。这是因为其自身的代谢物 6-磷酸葡萄糖胺 (GlcN6P) 与核糖开关结合并催化参与 RNA 自切割反应,从而提供了一种新的负反馈机制。鉴于许多病原体含有glmS核糖开关,这个潜在 RNA 目标的人工致动器引起了极大的兴趣。结构/动力学研究表明 GlcN6P 中的 2-氨基和 6-磷酸酯官能团对于这种驱动至关重要。作为开发人工致动器的第一步,我们合成了一系列九个 GlcN6P 类似物,这些类似物带有磷酸酶惰性替代物来代替天然磷酸酯。自裂解试验蜡样芽孢杆菌glmS核糖开关具有广泛的 SAR。两种类似物显示出显着的活性,即 6-脱氧-6-膦酰基甲基类似物 ( 5 ) 和6- O-丙二酰醚 ( 13 )。动力学曲线显示,这些类似物的催化效率分别比氨基葡萄糖 (GlcN) 高 22 倍和 27 倍。鉴于其不可水解的磷酸盐替代功能,这些