S-methyl 2-methoxy-3-methyl-5-[5-(5-methyl-[1,3,4]oxadiazol-2-yl)pent-1-enyl]benzothioate | 954371-35-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: S-methyl 2-methoxy-3-methyl-5-[5-(5-methyl-[1,3,4]oxadiazol-2-yl)pent-1-enyl]benzothioate
• 英文别名: S-methyl 2-methoxy-3-methyl-5-[5-(5-methyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)pent-1-ynyl]benzenecarbothioate
• CAS: 954371-35-8
• 化学式: C₁₈H₂₀N₂O₃S
• 分子量: 344.434
• InChiKey: JCBARGVVZYLGOP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  90.5
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  S-methyl 2-methoxy-3-methyl-5-[5-(5-methyl-[1,3,4]oxadiazol-2-yl)pent-1-enyl]benzothioate 、 间溴苯甲腈 在 四(三苯基膦)钯 三正丁基氢锡 、 copper(l) iodide 、 cesium fluoride 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.5h， 以33 mg的产率得到(Z)-S-methyl 5-(1-(3-cyanophenyl)-5-(5-methyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)pent-1-enyl)-2-methoxy-3-methylbenzothioate
  参考文献：
  名称：

  具有增强的水解稳定性的烯基二芳基甲烷HIV-1非核苷逆转录酶抑制剂的合成和生物学评估。

  摘要：

  HIV逆转录酶（NNRTIs）的非核苷抑制剂尽管不是HIV / AIDS治疗的主要手段，但由于其独特的作用机理，在高活性抗逆转录病毒疗法（HAART）中已变得越来越重要。几年前，我们的研究小组将烯基二芳基甲烷（ADAMs）鉴定为一种有效的新型NNRTIs。然而，发现活性最高的化合物在代谢上不稳定。随后的工作通过用各种杂环，腈和硫代酯代替不稳定的酯，从而合成了33种具有改善的代谢特性的类似物。结果，在纳摩尔浓度范围内鉴定出许多具有抗HIV活性的水解稳定的NNRTI。此外，基于新的ADAM系列，开发了一种改进的药效团模型，

  DOI：

  10.1021/jm070382k
• 作为产物：
  描述：

  5-iodo-2-methoxy-3-methylthiobenzoic acid S-methyl ester 、 2-methyl-5-pent-4-ynyl-[1,3,4]oxadiazole 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 copper(l) iodide 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 16.0h， 以85%的产率得到S-methyl 2-methoxy-3-methyl-5-[5-(5-methyl-[1,3,4]oxadiazol-2-yl)pent-1-enyl]benzothioate
  参考文献：
  名称：

  具有增强的水解稳定性的烯基二芳基甲烷HIV-1非核苷逆转录酶抑制剂的合成和生物学评估。

  摘要：

  HIV逆转录酶（NNRTIs）的非核苷抑制剂尽管不是HIV / AIDS治疗的主要手段，但由于其独特的作用机理，在高活性抗逆转录病毒疗法（HAART）中已变得越来越重要。几年前，我们的研究小组将烯基二芳基甲烷（ADAMs）鉴定为一种有效的新型NNRTIs。然而，发现活性最高的化合物在代谢上不稳定。随后的工作通过用各种杂环，腈和硫代酯代替不稳定的酯，从而合成了33种具有改善的代谢特性的类似物。结果，在纳摩尔浓度范围内鉴定出许多具有抗HIV活性的水解稳定的NNRTI。此外，基于新的ADAM系列，开发了一种改进的药效团模型，

  DOI：

  10.1021/jm070382k

文献信息

• Crystallographic Study of a Novel Subnanomolar Inhibitor Provides Insight on the Binding Interactions of Alkenyldiarylmethanes with Human Immunodeficiency Virus-1 Reverse Transcriptase
  作者：Matthew D. Cullen、William C. Ho、Joseph D. Bauman、Kalyan Das、Eddy Arnold、Tracy L. Hartman、Karen M. Watson、Robert W. Buckheit、Christophe Pannecouque、Erik De Clercq、Mark Cushman

  DOI：10.1021/jm901167t

  日期：2009.10.22

  Two crystal structures have been solved for separate complexes of alkenyldiarylmethane (ADAM) nonnucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTI) 3 and 4 with HIV-1 reverse transcriptase (RT). The structures reveal inhibitor binding is exclusively hydrophobic in nature and the shape of the inhibitor-bound NNRTI binding pocket is unique among other reported inhibitor-RT crystal structures. Primarily, ADAMs 3 and 4 protrude from a large gap in the back side of the binding pocket, placing portions of the inhibitors unusually close to the polymerase active site and allowing 3 to form a weak hydrogen bond with Lys223. The lack of additional stabilizing interactions, beyond the observed hydrophobic surface contacts, between 4 and RT is quite perplexing given the extreme potency of the compound (IC50 <= 1 nM). ADAM 4 was designed to be hydrolytically stable in blood plasma, and an investigation of its hydrolysis in rat plasma demonstrated it has a significantly prolonged half-life in comparison to ADAM lead compounds 1 and 2.