tert-butyl ((S)-1-(methoxy(methyl)amino)-1-oxo-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propan-2-yl)carbamate | 870154-03-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: tert-butyl ((S)-1-(methoxy(methyl)amino)-1-oxo-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propan-2-yl)carbamate
• 英文别名: tert-butyl ((1S)-2-[methoxy(methyl)amino]-2-oxo-1-{[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]methyl}ethyl)carbamate；tert-butyl N-[(1S)-1-[methoxy(methyl)carbamoyl]-2-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]ethyl]carbamate；tert-butyl N-[(2S)-1-[methoxy(methyl)amino]-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]carbamate
• CAS: 870154-03-3
• 化学式: C₁₄H₂₅N₃O₅
• 分子量: 315.37
• InChiKey: MWMMXCGWIJBVTK-UWVGGRQHSA-N

物化性质

• 密度：
  1.149±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.3
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  97
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl ((S)-1-(methoxy(methyl)amino)-1-oxo-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propan-2-yl)carbamate 在 正丁基锂 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 5.66h， 生成 (S)-N-((S)-1-(benzo[d]thiazol-2-yl)-1-oxo-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propan-2-yl)-4-methyl-2-(2-phenoxyacetamido)pentanamide
  参考文献：
  名称：

  新型二肽型 SARS-CoV 3CL 蛋白酶抑制剂的设计、合成和生物学评价：构效关系研究

  摘要：

  这项工作描述了低分子量肽 SARS-CoV 3CL 蛋白酶抑制剂的设计、合成和评估。抑制剂的设计基于有效的三肽 Z-Val-Leu-Ala(pyrrolidone-3-yl)-2-benzothiazole ( 8 ; Ki =  4.1 nM)，其中 P3 缬氨酸单元被多种不同的部分。所得系列二肽型抑制剂对 3CL pro表现出中等至良好的抑制活性。特别是，化合物26m和26n对K i表现出良好的抑制活性。值分别为 0.39 和 0.33 μM。这些低分子量化合物对于进一步开发具有药物特性的强效肽模拟物抑制剂具有吸引力。进行了对接研究以模拟化合物26m与 SARS-CoV 3CL 蛋白酶的结合相互作用。对具有强效抑制活性的拟肽化合物的初步 SAR 研究揭示了几个提高抑制活性的结构特征：（i）在 S1' 位置的苯并噻唑弹头，（ii）在 S1 位置的 γ-内酰胺单元，（iii ) S2-位的适当疏水亮氨酸部分，和

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2013.05.005
• 作为产物：
  描述：

  (alphaS,3S)-alpha-[(叔-丁基氧羰基)氨基]-2-氧代-3-吡咯烷丙酸甲酯 在 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 tert-butyl ((S)-1-(methoxy(methyl)amino)-1-oxo-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propan-2-yl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  炔烃作为潜在弹头共价靶向 SARS-CoV-2 主要蛋白酶

  摘要：

  迫切需要改进治疗方法，以更好地控制持续的 COVID-19 大流行。主要蛋白酶 M pro在 SARS-CoV-2 复制中发挥着关键作用，因此成为抗病毒开发的一个有吸引力的靶点。我们寻求识别新型亲电子弹头，以有效、共价抑制 M pro 。通过比较安装在通用支架上的一组弹头与 M pro的功效，我们发现末端炔烃可以共价修饰 M pro作为潜在弹头。我们的生化和 X 射线结构分析揭示了炔烃和 M pro的催化半胱氨酸之间乙烯基硫键的不可逆形成。开发了基于炔烃抑制剂的可点击探针来测量靶标结合、药物停留时间和脱靶效应。最好的含炔抑制剂可有效抑制细胞感染模型中的 SARS-CoV-2 感染。我们的研究结果强调了炔烃作为潜在弹头针对病毒及其他物质中的胱氨酸蛋白酶的巨大潜力。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.3c00810

文献信息

• [EN] INHIBITORS OF NOROVIRUS AND CORONAVIRUS REPLICATION<br/>[FR] INHIBITEURS DE LA RÉPLICATION DE NOROVIRUS ET DE CORONAVIRUS
  申请人：COCRYSTAL PHARMA INC

  公开号：WO2021206876A1

  公开（公告）日：2021-10-14

  Compounds of Formula (I) and methods of inhibiting the replication of viruses in a biological sample or patient, of reducing the amount of viruses in a biological sample or patient, and of treating a virus infection in a patient, comprising administering to said biological sample or patient an effective amount of a compound represented by Formula (I), a compound of Table A or B or a pharmaceutically acceptable salt thereof.

  公式（I）化合物及抑制生物样本或患者中病毒复制、减少生物样本或患者中病毒数量、以及治疗患者病毒感染的方法，包括向所述生物样本或患者投与由公式（I）表示的化合物、表A或B中的化合物或其药用可接受盐的有效量。
• Design and synthesis of new tripeptide-type SARS-CoV 3CL protease inhibitors containing an electrophilic arylketone moiety
  作者：Sho Konno、Pillaiyar Thanigaimalai、Takehito Yamamoto、Kiyohiko Nakada、Rie Kakiuchi、Kentaro Takayama、Yuri Yamazaki、Fumika Yakushiji、Kenichi Akaji、Yoshiaki Kiso、Yuko Kawasaki、Shen-En Chen、Ernesto Freire、Yoshio Hayashi

  DOI：10.1016/j.bmc.2012.11.017

  日期：2013.1

  We describe here the design, synthesis and biological evaluation of a series of molecules toward the development of novel peptidomimetic inhibitors of SARS-CoV 3CLpro. A docking study involving binding between the initial lead compound 1 and the SARS-CoV 3CLpro motivated the replacement of a thiazole with a benzothiazole unit as a warhead moiety at the P1′ site. This modification led to the identification

  我们在此描述了一系列分子的设计、合成和生物学评估，以开发新型 SARS-CoV 3CL pro的拟肽抑制剂。一项涉及初始先导化合物1与 SARS-CoV 3CL pro之间结合的对接研究促使用苯并噻唑单元取代噻唑作为 P1' 位点的弹头部分。这种修饰导致鉴定出更有效的衍生物，包括2i、2k、2m、2o和2p，其 IC 50或K i值在亚微摩尔至纳摩尔范围内。特别是，化合物2i和2p表现出最有效的抑制活性，K i值分别为 4.1 和 3.1 nM。通过这一过程鉴定出的拟肽化合物对于开发针对 SARS 的潜在治疗剂来说是有吸引力的线索。对SARS-CoV 3CL pro具有强效抑制活性的拟肽的结构要求可概括如下：（i）S1'位存在苯并噻唑弹头；(ii) S1位点环状内酰胺的氢键结合能力；(iii) S2 位点的适当立体化学和疏水部分大小，以及 (iv) S4 位点的苯氧基乙酰基部分呈现的独特折叠构象。
• Inhibitors of cysteine proteases and methods of use thereof
  申请人：Pardes Biosciences, Inc.

  公开号：US11124497B1

  公开（公告）日：2021-09-21

  The disclosure provides compounds with warheads and their use in treating medical diseases or disorders, such as viral infections. Pharmaceutical compositions and methods of making various compounds with warheads are provided. The compounds are contemplated to inhibit proteases, such as the 3C, CL- or 3CL-like protease. Exemplary compounds provided include Formula II-I, where R3, RB are provided herein:

  该披露提供了具有战斗头的化合物及其在治疗医学疾病或紊乱，如病毒感染方面的用途。提供了制药组合物和制备各种带有战斗头的化合物的方法。这些化合物被认为能够抑制蛋白酶，如3C、CL-或3CL样蛋白酶。提供的示例化合物包括Formula II-I，其中R3、RB如下所示：
• [EN] METHODS OF INHIBITING SARS-COV-2 REPLICATION AND TREATING CORONAVIRUS DISEASE 2019<br/>[FR] PROCÉDÉS D'INHIBITION DE LA RÉPLICATION DU SRAS-COV-2 ET DE TRAITEMENT DE LA MALADIE À CORONAVIRUS 2019
  申请人：PFIZER

  公开号：WO2021176369A1

  公开（公告）日：2021-09-10

  The invention relates to methods of treating COVID-19 in a patient by administering therapeutically effective amounts of certain SARS-CoV-2 inhibitor compounds or pharmaceutical compositions containing them to a patient in need thereof. The invention also relates to inhibiting SARS-CoV-2 coronavirus viral replication activity comprising contacting SARS-CoV-2-related coronavirus protease with a therapeutically effective amount of a SARS-Cov-2 protease inhibitor, such as a SARS-Cov-2 3CL protease inhibitor and compositions comprising the same

  该发明涉及通过向需要治疗的患者施用特定SARS-CoV-2抑制剂化合物或含有它们的药物组合物的治疗有效量来治疗COVID-19的方法。该发明还涉及抑制SARS-CoV-2冠状病毒病毒复制活性，包括将SARS-CoV-2相关冠状病毒蛋白酶与SARS-Cov-2蛋白酶抑制剂的治疗有效量接触，如SARS-Cov-2 3CL蛋白酶抑制剂以及包含相同的组合物。
• Development of potent dipeptide-type SARS-CoV 3CL protease inhibitors with novel P3 scaffolds: Design, synthesis, biological evaluation, and docking studies
  作者：Pillaiyar Thanigaimalai、Sho Konno、Takehito Yamamoto、Yuji Koiwai、Akihiro Taguchi、Kentaro Takayama、Fumika Yakushiji、Kenichi Akaji、Shen-En Chen、Aurash Naser-Tavakolian、Arne Schön、Ernesto Freire、Yoshio Hayashi

  DOI：10.1016/j.ejmech.2013.07.037

  日期：2013.10

  We report the design and synthesis of a series of dipeptide-type inhibitors with novel P3 scaffolds that display potent inhibitory activity against SARS-CoV 3CLpro. A docking study involving binding between the dipeptidic lead compound 4 and 3CLpro suggested the modification of a structurally flexible P3 N-(3-methoxyphenyl)glycine with various rigid P3 moieties in 4. The modifications led to the identification

  我们报告了一系列具有新型 P3 支架的二肽型抑制剂的设计和合成，这些抑制剂对 SARS-CoV 3CLpro 显示出有效的抑制活性。一项涉及二肽先导化合物 4 和 3CLpro 之间结合的对接研究表明，用 4 中的各种刚性 P3 部分对结构灵活的 P3 N-(3-甲氧基苯基)甘氨酸进行修饰。这些修饰导致了几种有效衍生物的鉴定，包括 5c -k 和 5n 的抑制活性（Ki 或 IC50）在亚微摩尔至纳摩尔范围内。尤其是化合物 5h，显示出最有效的抑制活性，Ki 值为 0.006 μM。该效力比先导化合物 4 的效力高 65 倍 (Ki=0.39 μM)。此外，5h 的 Ki 值与等温滴定量热法 (ITC) 中观察到的结合亲和力 (16 nM) 非常吻合。围绕先导 4 中 P3 基团的 SAR 研究发现刚性吲哚-2-羰基单元是最佳 P3 部分之一 (5c)。进一步优化表明，吲哚单元4位的甲氧基取代非常有利于增强抑制效力。