N-methyl 5-demethylellipticine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: N-methyl 5-demethylellipticine
• 英文别名: 6,11-Dimethylpyrido[4,3-b]carbazole；6,11-dimethylpyrido[4,3-b]carbazole
• 化学式: C₁₇H₁₄N₂
• 分子量: 246.312
• InChiKey: YNGQQZQBYFGKRE-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.12
• 拓扑面积：
  17.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  1

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-氯丁腈 、 N-methyl 5-demethylellipticine 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 5.0h， 以35%的产率得到N²-(3-cyanopropyl) N-methyl 5-demethylellipticinium chloride
  参考文献：
  名称：

  具有不同长度烷基的玫瑰树碱衍生物的结构修饰对其对人DNA拓扑异构酶II的影响具有影响：结合实验和计算研究

  摘要：

  降低肿瘤细胞生存力并破坏DNA拓扑异构酶反应的化合物已广泛用于抗癌药物的开发。玫瑰树碱（5,11-二甲基-6H-吡啶并[4,3-b]咔唑）是一种有效的嵌入剂，可通过与DNA拓扑异构酶II的相互作用来干扰核酸的加工。尽管玫瑰树碱是一种很好表征的化合物，但是由于给药时检测到的不良作用，它不是一种广泛接受的药物。我们先前已经报道了两种新型玫瑰树碱衍生物，N-甲基-5-脱甲基玫瑰树碱（ET-1）和2-甲基-N-甲基-5-脱甲基椭圆碘化物（ET-2）作为靶向DNA拓扑异构酶II的有效化合物。这项研究涵盖了N-甲基5-脱甲基玫瑰树碱的五种新盐（Z-1，Z-2，Z-4，Z-5和Z-6）具有几种有机卤化物及其对人拓扑异构酶II酶的作用。此外，进行了计算机模拟研究，以更好地了解靶分子结合口袋处的被研究分子的作用方式。我们的结果表明，三种衍生物（Z-1，Z-2和Z-6）对人拓扑异构酶II的催化活性具有相当大的

  DOI：

  10.1007/s00044-019-02472-9
• 作为产物：
  描述：

  4,9-dimethyl-9H-carbazole-3-carbaldehyde 在 盐酸 、 sodium tetrahydroborate 、 三乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 氯仿 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 N-methyl 5-demethylellipticine
  参考文献：
  名称：

  两种新型玫瑰树碱衍生物对人DNA拓扑异构酶IIα的抑制作用

  摘要：

  玫瑰树碱（5,11-二甲基-6 H-吡啶并[4,3- b ]咔唑）是一种抗肿瘤药，可插入DNA中并改变拓扑异构酶II的活性。不幸的是，这种化合物表现出许多不利的性质。因此，为了研究基于玫瑰树碱的新型化合物作为拓扑异构酶II靶向药物的潜力，我们合成了两种新型衍生物：N-甲基-5-脱甲基玫瑰树碱（ET-1）和2-甲基-N-甲基-5-脱甲基碘碘（ET-2）。如通过DNA脱级和裂解测定所确定的，ET-1和ET-2充当人类拓扑异构酶IIα的催化抑制剂，并且都比母体化合物更有效。两种化合物均不损害II型酶与其DNA底物结合的能力。最后，ET-1和ET-2作为拓扑异构酶IIα的催化抑制剂的功效似乎与它们插入双螺旋结构的能力有关。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2016.02.034

文献信息

• Inhibition of human DNA topoisomerase IIα by two novel ellipticine derivatives
  作者：Kendra R. Vann、Yavuz Ergün、Sevil Zencir、Serkan Oncuoglu、Neil Osheroff、Zeki Topcu

  DOI：10.1016/j.bmcl.2016.02.034

  日期：2016.4

  Ellipticine (5,11-dimethyl-6H-pyrido[4,3-b]carbazole) is an antineoplastic agent that intercalates into DNA and alters topoisomerase II activity. Unfortunately, this compound displays a number of adverse properties. Therefore, to investigate new ellipticine-based compounds for their potential as topoisomerase II-targeted drugs, we synthesized two novel derivatives, N-methyl-5-demethyl ellipticine (ET-1)

  玫瑰树碱（5,11-二甲基-6 H-吡啶并[4,3- b ]咔唑）是一种抗肿瘤药，可插入DNA中并改变拓扑异构酶II的活性。不幸的是，这种化合物表现出许多不利的性质。因此，为了研究基于玫瑰树碱的新型化合物作为拓扑异构酶II靶向药物的潜力，我们合成了两种新型衍生物：N-甲基-5-脱甲基玫瑰树碱（ET-1）和2-甲基-N-甲基-5-脱甲基碘碘（ET-2）。如通过DNA脱级和裂解测定所确定的，ET-1和ET-2充当人类拓扑异构酶IIα的催化抑制剂，并且都比母体化合物更有效。两种化合物均不损害II型酶与其DNA底物结合的能力。最后，ET-1和ET-2作为拓扑异构酶IIα的催化抑制剂的功效似乎与它们插入双螺旋结构的能力有关。
• Structural modification of ellipticine derivatives with alkyl groups of varying length is influential on their effects on human DNA topoisomerase II: a combined experimental and computational study
  作者：M. Kuskucu、V. Akyildiz、Á. Kulmány、Y. Ergün、S. Zencir、I. Zupko、S. Durdagi、M. Zaka、K. Sahin、H. Orhan、Z. Topcu

  DOI：10.1007/s00044-019-02472-9

  日期：2020.2

  The compounds reducing tumor cell viability and disrupting DNA topoisomerase reactions have been widely used in anticancer drug development. Ellipticine (5,11-dimethyl-6H-pyrido[4,3-b]carbazole) is a potent intercalating agent that interferes with nucleic acid processing through interaction with DNA topoisomerase II. Although ellipticine is a well-characterized compound, it is not a widely-accepted

  降低肿瘤细胞生存力并破坏DNA拓扑异构酶反应的化合物已广泛用于抗癌药物的开发。玫瑰树碱（5,11-二甲基-6H-吡啶并[4,3-b]咔唑）是一种有效的嵌入剂，可通过与DNA拓扑异构酶II的相互作用来干扰核酸的加工。尽管玫瑰树碱是一种很好表征的化合物，但是由于给药时检测到的不良作用，它不是一种广泛接受的药物。我们先前已经报道了两种新型玫瑰树碱衍生物，N-甲基-5-脱甲基玫瑰树碱（ET-1）和2-甲基-N-甲基-5-脱甲基椭圆碘化物（ET-2）作为靶向DNA拓扑异构酶II的有效化合物。这项研究涵盖了N-甲基5-脱甲基玫瑰树碱的五种新盐（Z-1，Z-2，Z-4，Z-5和Z-6）具有几种有机卤化物及其对人拓扑异构酶II酶的作用。此外，进行了计算机模拟研究，以更好地了解靶分子结合口袋处的被研究分子的作用方式。我们的结果表明，三种衍生物（Z-1，Z-2和Z-6）对人拓扑异构酶II的催化活性具有相当大的