N-[5-[[(1S,4R,14S,17R,27S,30R)-22,35-bis[(5-acetamidopyridin-3-yl)methyl]-8,10,21,23,34,36-hexaoxo-9,22,35-triazatridecacyclo[28.9.1.14,14.117,27.02,29.03,15.05,13.07,11.016,28.018,26.020,24.031,39.033,37]dotetraconta-2,5,7(11),12,15,18,20(24),25,28,31,33(37),38-dodecaen-9-yl]methyl]pyridin-3-yl]acetamide | 1073560-37-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 菲及其衍生物
• 英文名称: N-[5-[[(1S,4R,14S,17R,27S,30R)-22,35-bis[(5-acetamidopyridin-3-yl)methyl]-8,10,21,23,34,36-hexaoxo-9,22,35-triazatridecacyclo[28.9.1.14,14.117,27.02,29.03,15.05,13.07,11.016,28.018,26.020,24.031,39.033,37]dotetraconta-2,5,7(11),12,15,18,20(24),25,28,31,33(37),38-dodecaen-9-yl]methyl]pyridin-3-yl]acetamide
• CAS: 1073560-37-8
• 化学式: C₆₃H₄₅N₉O₉
• 分子量: 1072.11
• InChiKey: VZPSJPLBWBCAKI-GRSXZSPVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  81
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  16.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  238
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  四甲基硅烷 、 N-[5-[[(1S,4R,14S,17R,27S,30R)-22,35-bis[(5-acetamidopyridin-3-yl)methyl]-8,10,21,23,34,36-hexaoxo-9,22,35-triazatridecacyclo[28.9.1.14,14.117,27.02,29.03,15.05,13.07,11.016,28.018,26.020,24.031,39.033,37]dotetraconta-2,5,7(11),12,15,18,20(24),25,28,31,33(37),38-dodecaen-9-yl]methyl]pyridin-3-yl]acetamide 以 二氯甲烷-D2 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  旋转门动力学对分子包封动力学的影响—活性/选择性关系

  摘要：

  门控分子封装：研究了客体分子进入/离开门控宿主的速率与门旋转并由此打开/关闭宿主的速率之间的关系。动力学测量的结果表明，更多的动态宿主在捕获客体方面也更具选择性，从而揭示了与分子识别事件有关的活性/选择性关系（见图）。

  DOI：

  10.1002/chem.201003138
• 作为产物：
  描述：

  tris anhydride 、 N-(5-(aminomethyl)pyridin-3-yl)acetamide 在 吡啶 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 12.0h， 以63%的产率得到N-[5-[[(1S,4R,14S,17R,27S,30R)-22,35-bis[(5-acetamidopyridin-3-yl)methyl]-8,10,21,23,34,36-hexaoxo-9,22,35-triazatridecacyclo[28.9.1.14,14.117,27.02,29.03,15.05,13.07,11.016,28.018,26.020,24.031,39.033,37]dotetraconta-2,5,7(11),12,15,18,20(24),25,28,31,33(37),38-dodecaen-9-yl]methyl]pyridin-3-yl]acetamide
  参考文献：
  名称：

  控制封装动力学稳定性的三重“蝶阀”。工作中的分子篮

  摘要：

  分子篮 1 由半刚性三降冰片二烯骨架和边缘的三个旋转吡啶基门组成，旨在“动态”封闭空间并因此调节分子封装。门被证明通过分子内氢键折叠，从而形成 C3nu 对称受体：吡啶门的酰胺 NH 质子的 1H NMR 共振出现在低场（delta = 10.98 ppm），并观察到 ​​NH 振动拉伸（IR）在 3176 厘米（-1）。因此，密度泛函理论（DFT，B3LYP）研究表明，1 的封闭构象异构体在能量上是最稳定和占主导地位的。吡啶“门”的传动装置，围绕它们的轴，导致两个动态对映异构体 1A 和 1B 的相互转化，包括分子内氢键的顺时针和逆时针接缝。动态 1H NMR 光谱测量和线形模拟表明，当 CCl4 占据 1 的空腔时，1A/B 相互转换需要 10.0 kcal/mol (DeltaG++(A/B), 298 K) 的能垒。同样，发现 CCl4 离开篮子的活化自由能为 13.1 kcal/mol

  DOI：

  10.1021/ja8041977

文献信息

• Molecular Recognition of a Transition State
  作者：Xiaoguang Bao、Stephen Rieth、Sandra Stojanović、Christopher M. Hadad、Jovica D. Badjić

  DOI：10.1002/anie.201000656

  日期：2010.6.28

  inside job: The conformational interconversion of cyclohexane occurs at a higher rate in the interior of gated molecular baskets (see picture) than in bulk free solvent or a vacuum. The acceleration results from more favorable noncovalent bonding, and hence stabilization of the transition state, of the encapsulated compound.

  内部工作：在封闭的分子篮内部（参见图片），环己烷的构象互变发生率要高于无本体溶剂或真空中的发生率。加速来自更有利的非共价键合，从而稳定了封装化合物的过渡态。
• The Effect of the Dynamics of Revolving Gates on the Kinetics of Molecular Encapsulation-The Activity/Selectivity Relationship
  作者：Stephen Rieth、Jovica D. Badjić

  DOI：10.1002/chem.201003138

  日期：2011.2.25

  Gated molecular encapsulation: The relationship between the rate by which guest molecules enter/exit gated hosts and the rate by which gates revolve and thereby open/close the host were investigated. The results of kinetic measurements have indicated that more dynamic hosts are also more selective in trapping guests, thereby revealing an activity/selectivity relationship pertaining molecular recognition

  门控分子封装：研究了客体分子进入/离开门控宿主的速率与门旋转并由此打开/关闭宿主的速率之间的关系。动力学测量的结果表明，更多的动态宿主在捕获客体方面也更具选择性，从而揭示了与分子识别事件有关的活性/选择性关系（见图）。
• A 3-fold “Butterfly Valve” in Command of the Encapsulation’s Kinetic Stability. Molecular Baskets at Work
  作者：Bao-Yu Wang、Xiaoguang Bao、Zhiqing Yan、Veselin Maslak、Christopher M. Hadad、Jovica D. Badjić

  DOI：10.1021/ja8041977

  日期：2008.11.12

  Likewise, the activation free energy for CCl4 departing the basket was found to be 13.1 kcal/mol (DeltaG++, 298 K), whereas the thermodynamic stability of 1:CCl4 complex was -2.7 kcal/mol (DeltaGdegrees, 298 K). In view of that, CCl4 (but also (CH3)3CBr) was proposed to escape from, and a molecule of solvent to enter, the basket when the gates rotate about their axis: the exit of CCl4 requires the activation

  分子篮 1 由半刚性三降冰片二烯骨架和边缘的三个旋转吡啶基门组成，旨在“动态”封闭空间并因此调节分子封装。门被证明通过分子内氢键折叠，从而形成 C3nu 对称受体：吡啶门的酰胺 NH 质子的 1H NMR 共振出现在低场（delta = 10.98 ppm），并观察到 ​​NH 振动拉伸（IR）在 3176 厘米（-1）。因此，密度泛函理论（DFT，B3LYP）研究表明，1 的封闭构象异构体在能量上是最稳定和占主导地位的。吡啶“门”的传动装置，围绕它们的轴，导致两个动态对映异构体 1A 和 1B 的相互转化，包括分子内氢键的顺时针和逆时针接缝。动态 1H NMR 光谱测量和线形模拟表明，当 CCl4 占据 1 的空腔时，1A/B 相互转换需要 10.0 kcal/mol (DeltaG++(A/B), 298 K) 的能垒。同样，发现 CCl4 离开篮子的活化自由能为 13.1 kcal/mol