methyl 2-O-methoxymethyl-4,6-O-benzilidene-β-D-galactopyranoside

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡喃二恶英
• 英文名称: methyl 2-O-methoxymethyl-4,6-O-benzilidene-β-D-galactopyranoside
• 英文别名: 4,6-di-O-benzylidene-2-O-methoxymethyl-β-D-galactopyranoside；methyl 2-O-methoxymethyl-4,6-O-benzylidene-β-D-galactopyranoside；(4aR,6R,7R,8S,8aR)-6-methoxy-7-(methoxymethoxy)-2-phenyl-4,4a,6,7,8,8a-hexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxin-8-ol
• 化学式: C₁₆H₂₂O₇
• 分子量: 326.346
• InChiKey: HIDCMKWRHHVRHH-KOGYTIRMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.4
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  75.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 2-O-methoxymethyl-4,6-O-benzilidene-β-D-galactopyranoside 在 四甲基乙二胺 、 溶剂黄146 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 28.08h， 生成 methyl 3-O-[(3'-O-methyl)malonyl]-β-D-galactopyranoside
  参考文献：
  名称：

  合理设计和合成作为有效的galectin-8N拮抗剂的甲基-β-D-半乳糖醛酸苯基酯。

  摘要：

  Galectin-8是一种β-半乳糖苷识别蛋白，在调节骨骼重塑以及癌症进展和转移中具有重要作用。已经设计了甲基β- d-吡喃半乳糖苷丙二酰芳族酯以靶向并与galectin- 8N延伸的碳水化合物结合位点的特定氨基酸残基接合。化学合成的化合物对galectin-8 N具有体外结合亲和力通过等温滴定热量法评估，其范围为5–33μM。这种亲和力与化合物抑制SUM159乳腺癌细胞系中galectin-8诱导的趋化因子和促炎细胞因子表达的能力直接相关。X射线晶体结构测定表明，这些单糖基的化合物结合半乳凝素8 Ñ通过接合其独特的精氨酸（Arg59），同时交联到位于横跨糖结合位点的另一精氨酸（Arg45）。这种基于结构的药物设计方法导致了新型单糖半乳糖拮抗剂的发现，其最强结合的化合物（K d 5.72μM）比二糖乳糖紧紧7倍。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.0c00602
• 作为产物：
  描述：

  甲基-Β-D-吡喃半乳糖苷 在 甲醇 、 混旋樟脑磺酸 、 sodium 、 N,N-二异丙基乙胺 、 silver(l) oxide 作用下， 以 正己烷 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 34.0h， 生成 methyl 2-O-methoxymethyl-4,6-O-benzilidene-β-D-galactopyranoside
  参考文献：
  名称：

  针对半乳糖凝集素8的单糖配体的基于结构的设计

  摘要：

  Galectin-8是一种β-半乳糖苷识别蛋白，在调节骨骼重塑中发挥作用，并且是解决与骨丢失相关疾病的新兴靶标。我们已经设计并合成了甲基3 - O- [1-羧乙基]-β- d-吡喃半乳糖苷（化合物6）作为靶向半乳糖凝集素8（N半乳糖凝集素8 N）的N端结构域的配体。我们的设计涉及分子动力学（MD）模拟，该模拟预测6可以模拟半乳糖环以及3'- O-唾液酸化乳糖（3'-SiaLac）的羧酸基团与半乳糖凝集素8 N的相互作用。等温滴定热法（ITC）确定了Galectin-8的结合亲和力Ñ为6为32.8μ米，而对于半乳凝素8（半乳凝素8的C末端结构域没有检测到显著亲和力Ç）。galectin-8 N – 6复合物的晶体结构验证了预测的结合构象，并揭示了涉及Galectin进化上保守的氨基酸以及galectin-8 N独特的蛋白质-配体相互作用，以进行识别。总体而言，我们已经启动并证明了合理的配体设

  DOI：

  10.1002/cmdc.201800224

文献信息

• Galactose-conjugates of the oseltamivir pharmacophore—new tools for the characterization of influenza virus neuraminidases
  作者：Benoit Carbain、Stephen R. Martin、Patrick J. Collins、Peter B. Hitchcock、Hansjörg Streicher

  DOI：10.1039/b903394g

  日期：——

  We describe the synthesis of mimetics of the α2–3 and α2–6 sialogalactoside substrates of influenza neuraminidase which include the oseltamivir pharmacophore, and report the sub-nanomolar affinities for these novel neuraminidase inhibitors. The challenge of synthesizing a Phospha-Oseltamivir/Tamiphosphor monoester involving the secondary 3-hydroxy group of galactose required to mimic the α2–3 sialogalactoside has been overcome by palladium-promoted coupling of the oseltamivir-derived vinyl iodide with a protected galactose-3-phosphonate. The difference in binding of these two inhibitors to a given influenza neuraminidase should be a function of its α2–3/α2–6-selectivity, an important, but not yet fully understood factor in the adaptation of highly pathogenic avian influenza viruses to human hosts.

  我们描述了合成模仿流感神经氨酸酶的α2–3和α2–6唾液酸半乳糖苷底物的化合物，包括奥司他韦药效团，并报告了这些新型神经氨酸酶抑制剂的亚纳摩尔亲和力。合成涉及半乳糖的次级3-羟基所需的磷酸奥司他韦/塔米福韦单酯的挑战，通过钯促进的奥司他韦衍生的乙烯基碘与保护的半乳糖-3-磷酸酯的耦合得以克服。这两种抑制剂与特定流感神经氨酸酶的结合差异应取决于其α2–3/α2–6选择性，这是高度致病性禽流感病毒适应人类宿主中一个重要但尚未完全理解的因素。
• Rational Design and Synthesis of Methyl-β-<scp>d</scp>-galactomalonyl Phenyl Esters as Potent Galectin-8<i>N</i> Antagonists
  作者：Brijesh Patel、Chandan Kishor、Todd. A. Houston、Hadas Shatz-Azoulay、Yehiel Zick、Yaron Vinik、Helen Blanchard

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.0c00602

  日期：2020.10.22

  β-galactoside-recognizing protein having an important role in the regulation of bone remodeling and cancer progression and metastasis. Methyl β-d-galactopyranoside malonyl aromatic esters have been designed to target and engage with particular amino acid residues of the galectin-8N extended carbohydrate-binding site. The chemically synthesized compounds had in vitro binding affinity toward galectin-8N

  Galectin-8是一种β-半乳糖苷识别蛋白，在调节骨骼重塑以及癌症进展和转移中具有重要作用。已经设计了甲基β- d-吡喃半乳糖苷丙二酰芳族酯以靶向并与galectin- 8N延伸的碳水化合物结合位点的特定氨基酸残基接合。化学合成的化合物对galectin-8 N具有体外结合亲和力通过等温滴定热量法评估，其范围为5–33μM。这种亲和力与化合物抑制SUM159乳腺癌细胞系中galectin-8诱导的趋化因子和促炎细胞因子表达的能力直接相关。X射线晶体结构测定表明，这些单糖基的化合物结合半乳凝素8 Ñ通过接合其独特的精氨酸（Arg59），同时交联到位于横跨糖结合位点的另一精氨酸（Arg45）。这种基于结构的药物设计方法导致了新型单糖半乳糖拮抗剂的发现，其最强结合的化合物（K d 5.72μM）比二糖乳糖紧紧7倍。
• Structure-Based Design of a Monosaccharide Ligand Targeting Galectin-8
  作者：Mohammad H. Bohari、Xing Yu、Chandan Kishor、Brijesh Patel、Rob Marc Go、Hadieh A. Eslampanah Seyedi、Yaron Vinik、I. Darren Grice、Yehiel Zick、Helen Blanchard

  DOI：10.1002/cmdc.201800224

  日期：2018.8.20

  Galectin‐8 is a β‐galactoside‐recognising protein that has a role in the regulation of bone remodelling and is an emerging new target for tackling diseases with associated bone loss. We have designed and synthesised methyl 3‐O‐[1‐carboxyethyl]‐β‐d‐galactopyranoside (compound 6) as a ligand to target the N‐terminal domain of galectin‐8 (galectin‐8N). Our design involved molecular dynamics (MD) simulations

  Galectin-8是一种β-半乳糖苷识别蛋白，在调节骨骼重塑中发挥作用，并且是解决与骨丢失相关疾病的新兴靶标。我们已经设计并合成了甲基3 - O- [1-羧乙基]-β- d-吡喃半乳糖苷（化合物6）作为靶向半乳糖凝集素8（N半乳糖凝集素8 N）的N端结构域的配体。我们的设计涉及分子动力学（MD）模拟，该模拟预测6可以模拟半乳糖环以及3'- O-唾液酸化乳糖（3'-SiaLac）的羧酸基团与半乳糖凝集素8 N的相互作用。等温滴定热法（ITC）确定了Galectin-8的结合亲和力Ñ为6为32.8μ米，而对于半乳凝素8（半乳凝素8的C末端结构域没有检测到显著亲和力Ç）。galectin-8 N – 6复合物的晶体结构验证了预测的结合构象，并揭示了涉及Galectin进化上保守的氨基酸以及galectin-8 N独特的蛋白质-配体相互作用，以进行识别。总体而言，我们已经启动并证明了合理的配体设