present in the sample. The brightest microarray hits were converted to affinity‐based probes (AfBPs) using convenient, 1‐step “click” chemistry with benzophenone from the relevant building blocks. Pull‐down/mass spectrometric analysis with these probes (individuals or cocktail) yielded putative protein targets that include well‐known aspartic proteases, such as cathepsin D which is a clear marker for
事实证明,小分子微阵列(
SMM)越来越成为评估蛋白质与
配体相互作用以及以高通量方式筛选酶底物和
抑制剂的重要工具。我们之前描述了一种
SMM辅助的筛选策略,用于快速鉴定针对
天冬氨酸蛋白酶γ-分泌酶的探针。在本文中,我们将扩展使用羟乙基胺衍生的
抑制剂的扩展库,该
抑制剂非排他性地针对
天冬氨酸蛋白酶。我们的库在P 2,P 1,P 1 '和P 2 '上是多样化的职位。因此,使用组合固相合成方法合成了86种新
抑制剂,使总文库大小达到284种
生物素化化合物,并排列在抗
生物素蛋白载玻片上。为了阐明复杂
生物样品中的酶活性和特性,使用荧光标记的哺乳动物细胞裂解液进行了筛选。这产生了可再现的图谱或结合指纹,与
天冬氨酸蛋白酶或辅助蛋白以及样品中存在的其他相互作用靶标的相互作用相对应。最亮的芯片命中率转换为基于亲和力的探针(A fBP)使用便捷的第一步“点击”
化学反应,并使用来自相关构件的
二苯甲酮。使用这些探针(个人