(2S)-2-[[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]氨基]-5-己烯酸 | 851909-08-5

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物 - 甘氨酸类衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: (2S)-2-[[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]氨基]-5-己烯酸
• 中文别名: (S)-2-(((9H-芴-9-基甲氧基)羰基)氨基)-5-己烯酸
• 英文名称: (S)-2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)hex-5-enoic acid
• 英文别名: (2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)hex-5-enoic acid
• CAS: 851909-08-5
• 化学式: C₂₁H₂₁NO₄
• 分子量: 351.402
• InChiKey: CPJQXKHZCVDRSX-IBGZPJMESA-N

物化性质

• 沸点：
  573.7±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.222

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.2
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  75.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

安全信息

• 海关编码：
  2924299090
• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H315,H319,H335
• 储存条件：
  2-8°C

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S)-2-[[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]氨基]-5-己烯酸 在 Grubbs catalyst first generation N-乙基吗啉 、 三氟乙酸 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 114.0h， 生成 methyl (3S,9S)-3-N-(Fmoc)amino-2-oxo-2,3,4,5,8,9-hexahydro-1H-azonine-9-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  通过闭环复分解合成具有8、9和10元环的大环二肽β-转类似物的系统研究

  摘要：

  进行了系统的研究以建立用于形成对映体纯的大环二肽内酰胺的一般合成方案。着眼于8、9和10元环的大环，有效的合成是通过一个序列进行的，该序列的特征是将烯丙基-和高烯丙基-甘氨酸的结构单元进行肽偶联，然后进行闭环复分解。通过使用各自保护的二肽的一般策略，有效地制备了具有顺式酰胺和顺式烯烃构型的8元内酰胺以及具有反酰胺和反烯烃构型的9元和10元内酰胺。格拉布斯的催化剂，以及作为苄基衍生物的中央酰胺的临时保护。

  DOI：

  10.1021/jo0477648
• 作为产物：
  描述：

  在 盐酸 、 乙二胺四乙酸 、 水 、 碳酸氢钠 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 (2S)-2-[[(9H-芴-9-基甲氧基)羰基]氨基]-5-己烯酸
  参考文献：
  名称：

  Influence of α-methylation in constructing stapled peptides with olefin metathesis

  摘要：

  Ring-closing metathesis is commonly utilized in peptide macro-cyclization. The influence of alpha-methylation of the amino acids bearing the olefin moieties has never been systematically studied. In this report, controlled reactions unambiguously indicate that alpha-methylation at the N-terminus of the metathesis sites is crucial for this reaction to occur. Also, we first elucidated that the E-isomers of stapled peptides are significantly more helical than the Z-isomers. (C) 2014 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.tet.2014.08.004

文献信息

• Rational Design and Synthesis of Modified Teixobactin Analogues: In Vitro Antibacterial Activity against <i>Staphylococcus aureus</i> , <i>Propionibacterium acnes</i> and <i>Pseudomonas aeruginosa</i>
  作者：Vivian Ng、Sarah A. Kuehne、Weng C. Chan

  DOI：10.1002/chem.201801423

  日期：2018.6.26

  Extensive antimicrobial susceptibility assessment against a panel of clinically relevant Staphylococcus aureus and Propionibacterium acnes strains led to the identification of the new lead compound, [Arg(Me)10,Nle11]teixobactin, with an excellent bactericidal activity (minimum inhibitory concentration (MIC)=2–4 μg mL−1). Significantly, the antimicrobial activity of several of the teixobactin analogues against

  Teixobactin是最近发现的一种与细菌脂质II和脂质III结合的二肽肽，为设计新的抗菌剂提供了有希望的分子支架。在这里，我们描述了系统修饰的teixobactin类似物的合成和抗菌评估。Ile 11残基被脂肪族等聚体取代，修饰残基10的胍基基团，以及向大环引入刚性化残基（即脱氢氨基酸），产生了有用的结构活性信息。针对一组临床相关的金黄色葡萄球菌和痤疮丙酸杆菌菌株进行了广泛的药敏评估，从而鉴定出了新的先导化合物[Arg（Me）10，Nle 11 ] teixobactin，具有优异的杀菌活性（最低抑菌浓度（MIC）= 2-4μgmL -1）。值得注意的是，当与亚MIC浓度的外膜破坏性抗生素大肠菌素结合使用时，“ teixobactin类似物”对致病性革兰氏阴性铜绿假单胞菌的抗微生物活性被“恢复”。[Tfn 10，Nle 11 ] teixobactin（32μgmL -1）-colistin（2μgmL
• Insight into Transannular Cyclization Reactions To Synthesize Azabicyclo[<i>X</i>.<i>Y</i>.<i>Z</i>]alkanone Amino Acid Derivatives from 8-, 9-, and 10-Membered Macrocyclic Dipeptide Lactams
  作者：N. D. Prasad Atmuri、William D. Lubell

  DOI：10.1021/acs.joc.5b00237

  日期：2015.5.15

  An efficient method for synthesizing different functionalized azabicyclo[X.Y.0]alkanone amino acid derivatives has been developed employing electrophilic transannular cyclizations of 8-, 9-, and 10-membered unsaturated macrocycles to form 5,5-, 6,5-, 7,5-, and 6,6-fused bicylic amino acids, respectively. Macrocycles were obtained by a sequence featuring peptide coupling of vinyl-, allyl-, homoallyl-

  一种合成不同功能化氮杂双环[ X的有效方法。ÿ.0]烷酮氨基酸衍生物是利用8、9和10元不饱和大环的亲电跨环环化反应形成5、5、6、5、7、5和6，6稠合的双环氨基酸。通过以乙烯基-，烯丙基-，高烯丙基-和高同烯丙基甘氨酸结构单元的肽偶联为特征，然后闭环易位的序列获得大环。对8元，9元和10元大环内酰胺起始原料以及某些双环氨基酸产物的X射线晶体学分析提供了对它们的构象偏爱以及非对映选择性形成特定氮杂双环烷酮氨基酸的机理的见解。环戊内酰胺化反应的方式。
• [EN] AMINO ACID ANALOGUES AND METHODS FOR THEIR SYNTHESIS<br/>[FR] ANALOGUES D'ACIDES AMINÉS ET LEURS PROCÉDÉS DE SYNTHÈSE
  申请人：UNIV MONASH

  公开号：WO2014005197A1

  公开（公告）日：2014-01-09

  A method for the synthesis of an amino acid analogue or a salt, solvate, derivative, isomer or tautomer thereof comprising the steps of: (i) subjecting an amino acid containing a metathesisable group to metathesis with a compound containing a complementary metathesisable group of formula (I) or (II): (Formulae (I), (II)) wherein R1 and R2 are independently selected from H and substituted or unsubstituted C1 to C4 alkyl; each R3 is either absent or independently selected from a heteroatom, a substituted or unsubstituted C1 to C20 alkyl, and a substituted or unsubstituted C1 to C20 alkyl group interrupted by one or more heteroatoms; and each X is independently selected from H and an effector molecule; in the presence of a reagent to catalyse the metathesis to form a dicarba bridge between the amino acid containing a metathesisable group and the compound containing a complementary metathesisable group; and (ii) reducing the dicarba bridge to form a saturated dicarba bridge, wherein the reagent used to catalyse step (i) also catalyses step (ii).

  一种合成氨基酸类似物或其盐、溶剂合物、衍生物、异构体或互变异构体的方法，包括以下步骤：(i)将含有可与交换反应的基团的氨基酸与含有配对交换反应基团的化合物进行交换反应，所述化合物的化学式为(I)或(II)：(化学式(I), (II))其中R1和R2分别独立地选自H和取代或未取代的C1至C4烷基；每个R3要么不存在，要么独立地选自一个杂原子、一个取代或未取代的C1至C20烷基，以及一个被一个或多个杂原子中断的取代或未取代的C1至C20烷基基团；每个X独立地选自H和一个效应分子；在存在催化交换反应的试剂的情况下，形成含有可与交换反应基团的氨基酸与含有配对交换反应基团的化合物之间的二碳桥；(ii)还原二碳桥以形成饱和的二碳桥，其中用于催化步骤(i)的试剂也催化步骤(ii)。
• Macrocyclic BACE1 inhibitors with hydrophobic cross-linked structures: Optimization of ring size and ring structure
  作者：Takuya Otani、Yasunao Hattori、Kenichi Akaji、Kazuya Kobayashi

  DOI：10.1016/j.bmc.2021.116517

  日期：2021.12

  Based on the X-ray crystallography of recombinant BACE1 and a hydroxyethylamine-type peptidic inhibitor, we introduced a cross-linked structure between the P1 and P3 side chains of the inhibitor to enhance its inhibitory activity. The P1 and P3 fragments bearing terminal alkenes were synthesized, and a ring-closing metathesis of these alkenes was used to construct the cross-linked structure. Evaluation

  基于重组 BACE1 和羟乙胺型肽抑制剂的 X 射线晶体学，我们在抑制剂的 P1 和 P3 侧链之间引入了交联结构，以增强其抑制活性。合成了带有末端烯烃的P1和P3片段，并使用这些烯烃的闭环复分解来构建交联结构。使用具有不同侧链长度的 P1 和 P3 片段评估环大小表明，13 元环是最佳的，尽管它们的活性与母体化合物相比有所降低。此外，发现最佳环结构是在 P3 β 位具有二甲基支链取代基的大环，其活性比未取代的大环高约 100 倍。此外，
• From Macrocycle Dipeptide Lactams To Azabicyclo[X.Y.0]alkanone Amino Acids:  A Transannular Cyclization Route for Peptide Mimic Synthesis
  作者：Simon Surprenant、William D. Lubell

  DOI：10.1021/ol0609863

  日期：2006.6.1

  text] Macrocyclic and fused bicyclic dipeptides are complementary motifs for mimicry of different types of beta-turn geometry. Macrocyclic dipeptide mimics have served as precursors for the synthesis of their bicyclic counterparts using electrophilic transannular cyclizations of 9- and 10-membered ring lactams 9-12 to form azabicyclo[4.3.0]- and -[5.3.0]alkanone amino esters 13-16.

  [反应：见正文]大环和稠合的双环二肽是模仿不同类型的β-转角几何结构的互补基序。大环二肽模拟物已用作前体，用于使用9和10元环内酰胺9-12的亲电跨环环化反应形成双氮杂环[4.3.0]-和-[5.3.0]烷酮氨基酯13 -16。