5-Allyl-uridin | 59240-49-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-Allyl-uridin
• 英文别名: 5-Allyluridine；1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-prop-2-enylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 59240-49-2
• 化学式: C₁₂H₁₆N₂O₆
• 分子量: 284.269
• InChiKey: VHTXRUOQNZDVPO-TURQNECASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.9
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-Allyl-uridin 在 四氮唑 、 叔丁基过氧化氢 、 对甲苯磺酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 丙酮 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 99.5h， 生成 1-[(2R,4S,5R)-4-[[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(2,4-dioxo-5-prop-2-enylpyrimidin-1-yl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-6-yl]methoxy-oxido-prop-2-enoxyphosphaniumyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  Borsting, Philip; Sorensen, Anders M.; Nielsen, Poul, Synthesis, 2002, # 6, p. 797 - 801

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-O-isopropylidene-5'-O-methoxymethyluridine 在 rhodium on alumina 氢气 、 双氧水 、 三氟乙酸 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 25.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 24.0h， 生成 5-Allyl-uridin
  参考文献：
  名称：

  5，6-二氢尿苷的锂化：5-取代尿苷的新途径

  摘要：

  发现在用LDA锂化时，2'，3'-O-异亚丙基-5'-O-甲氧基甲基-5,6-二氢尿苷（2）用作“酰胺α-阴离子”。阴离子与酰氯的反应，然后进行苯硒化和氧化消除，得到5-酰基尿嘧啶核苷。为了制备5-烷基尿苷，在2的C-5处初始引入苯基硒烯基似乎是有效的。其α-硒烯碳负离子的烷基化反应和随后生成的5,6-双键产生了5-烷基尿苷。这些途径构成了5-取代的尿苷的新入口。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)96481-6

文献信息

• IONIZABLE CATIONIC LIPID FOR RNA DELIVERY
  申请人：Arcturus Therapeutics, Inc.

  公开号：US20180169268A1

  公开（公告）日：2018-06-21

  What is described is a compound of formula I consisting of a compound in which R 1 is a branched chain alkyl consisting of 10 to 31 carbons; R 2 is a linear alkyl, alkenyl, or alkynyl consisting of 2 to 20 carbons; L 1 and L 2 are the same or different, each a linear alkylene of 1 to 20 carbons or a linear alkenylene of 2 to 20 carbons; X 1 is S or O; R 3 is a linear or branched alkylene consisting of 1 to 6 carbons; and R 4 and R 5 are the same or different, each a hydrogen or a linear or branched alkyl consisting of 1 to 6 carbons; or a pharmaceutically acceptable salt thereof.

  描述的是一种化合物，其化学式为I，包括以下成分： R1为由10至31个碳组成的支链烷基化合物； R2为由2至20个碳组成的直链烷基、烯基或炔基； L1和L2相同或不同，每个为由1至20个碳组成的直链烷基或由2至20个碳组成的直链烯基； X1为S或O； R3为由1至6个碳组成的直链或支链烷基； R4和R5相同或不同，每个为氢或由1至6个碳组成的直链或支链烷基；或其药用可接受盐。
• Novel compositions for the delivery of negatively charged molecules
  申请人：Ribozyme Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US20030073640A1

  公开（公告）日：2003-04-17

  This invention features permeability enhancer molecules, and methods, to increase membrane permeability of various molecules, such as nucleic acids, polynucleotides, oligonucleotides, enzymatic nucleic acid molecules, antisense nucleic acid molecules, 2-5A antisense chimeras, triplex forming oligonucleotides, decoy RNAs, dsRNAs, siRNAs, aptamers, or antisense nucleic acids containing nucleic acid cleaving chemical groups, peptides, polypeptides, proteins, carbohydrates, steroids, metals and small molecules, thereby facilitating cellular uptake of such molecules.

  本发明涉及一种透过性增强剂分子，及其方法，用于增加诸如核酸、多核酸、寡核酸、酶核酸分子、反义核酸分子、2-5A反义嵌合体、三链形成寡核酸、诱饵RNA、双链RNA、小干扰RNA、适配体或含有核酸切割化学基团的核酸、肽、多肽、蛋白质、碳水化合物、类固醇、金属和小分子等不同分子的膜透过性，从而促进细胞对这些分子的摄取。
• [EN] siRNAs WITH AT LEAST TWO LIGANDS AT DIFFERENT ENDS<br/>[FR] ARNSI POSSÉDANT AU MOINS DEUX LIGANDS À DEUX EXTRÉMITÉS DISTINCTES
  申请人：SILENCE THERAPEUTICS GMBH

  公开号：WO2019193189A1

  公开（公告）日：2019-10-10

  There is provided inter alia a conjugate for inhibiting expression of a target gene in a cell, said conjugate comprising a nucleic acid portion and ligand portions, said nucleic acid portion comprising at least one duplex region that comprises at least a portion of a first RNA strand and at least a portion of a second RNA strand that is at least partially complementary to the first strand, wherein said first strand is at least partially complementary to at least a portion of RNA transcribed from said target gene, said ligand portions comprising a linker moiety and a targeting ligand for in vivo targeting of cells and being conjugated exclusively to the 3' and/or 5' ends of one or both RNA strands, wherein the 5' end of the first RNA strand is not conjugated, wherein: (i) the second RNA strand is conjugated at the 5' end to the targeting ligand, and wherein (a) the second RNA strand is also conjugated at the 3' end to the targeting ligand and the 3' end of the first RNA strand is not conjugated; or (b) the first RNA strand is conjugated at the 3' end to the targeting ligand and the 3' end of the second RNA strand is not conjugated; or (c) both the second RNA strand and the first RNA strand are also conjugated at the 3' ends to the targeting ligand; or (ii) both the second RNA strand and the first RNA strand are conjugated at the 3' ends to the targeting ligand and the 5' end of the second RNA strand is not conjugated.

  提供了一种用于抑制细胞中靶基因表达的共轭物，该共轭物包括核酸部分和配体部分，所述核酸部分包括至少一个双链区域，该区域包括至少部分第一RNA链和至少部分第二RNA链，该第二RNA链至少部分与第一链互补，其中所述第一链至少部分与从所述靶基因转录的RNA的至少部分互补，所述配体部分包括连接子基团和用于体内细胞靶向的靶向配体，并且仅连接到一个或两个RNA链的3'和/或5'末端，其中第一RNA链的5'末端未连接，其中：(i) 第二RNA链在5'末端连接到靶向配体，其中(a) 第二RNA链还在3'末端连接到靶向配体，且第一RNA链的3'末端未连接；或(b) 第一RNA链在3'末端连接到靶向配体，且第二RNA链的3'末端未连接；或(c) 第二RNA链和第一RNA链的3'末端均连接到靶向配体；或(ii) 第二RNA链和第一RNA链的3'末端均连接到靶向配体，且第二RNA链的5'末端未连接。
• [EN] LIGAND-MODIFIED DOUBLE-STRANDED NUCLEIC ACIDS<br/>[FR] ACIDES NUCLÉIQUES DOUBLE BRIN MODIFIÉS PAR UN LIGAND
  申请人：DICERNA PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2016100401A1

  公开（公告）日：2016-06-23

  The invention provides for double stranded nucleic acid molecules comprising a 5 'extension of the sense or antisense strand and further comprising a plurality of nucleotides that are conjugated to a ligand and methods of using the double-stranded nucleic acid molecules. Ligand-modified oligomers where the sense stands form a tetraloop provide new potent and stable RNA interference agents. These dsNA molecules are synthesized using a plurality of nucleotides that include ligand-modified monomers, nucleotide analog monomers, modified nucleotide monomers and the like, using standard nucleotide synthetic methods and systems.

  该发明提供了包括具有感链或反义链的5'延伸以及进一步包括与配体结合的多个核苷酸的双链核酸分子，以及使用这些双链核酸分子的方法。其中，感链形成四环的配体修饰寡聚物提供了新的强效和稳定的RNA干扰剂。这些双链核酸分子是使用包括配体修饰单体、核苷酸类似物单体、修饰核苷酸单体等的多个核苷酸合成的，使用标准的核苷酸合成方法和系统。
• Methods for synthesizing nucleosides, nucleoside derivatives and non-nucleoside derivatives
  申请人：——

  公开号：US20020120129A1

  公开（公告）日：2002-08-29

  The present invention provides methods for the chemical synthesis of nucleosides and derivatives thereof, including 2′-amino, 2′-N-phthaloyl, 2′-O-methyl, 2′-O-silyl, 2′OH nucleosides, C-nucleosides, nucleoside phosphoramidites, C-nucleoside phosphoramidites, and non-nucleoside derivatives.

  本发明提供了核苷及其衍生物的化学合成方法，包括2'-氨基、2'-N-邻苯二甲酰基、2'-O-甲基、2'-O-硅基、2'-OH 核苷、C-核苷、核苷磷酰胺酯、C-核苷磷酰胺酯和非核苷衍生物。