dimethyl 1-carbomethoxy-3-indolylmalonate | 73857-25-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: dimethyl 1-carbomethoxy-3-indolylmalonate
• 英文别名: dimethyl 2-(1-carbomethoxy-1H-indol-3-yl)malonate；dimethyl 2-(1-(methoxycarbonyl)-1H-indole-3-yl)malonate；Propanedioic acid, [1-(methoxycarbonyl)-1H-indol-3-yl]-, dimethyl ester；dimethyl 2-(1-methoxycarbonylindol-3-yl)propanedioate
• CAS: 73857-25-7
• 化学式: C₁₅H₁₅NO₆
• 分子量: 305.287
• InChiKey: NFWLITATSBQMRJ-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  108-110 °C(Solv: methanol (67-56-1))
• 沸点：
  420.3±53.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.29±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.2
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  83.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  dimethyl 1-carbomethoxy-3-indolylmalonate 在 溴 、 potassium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 四氯化碳 、 水 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 6-溴吲哚-3-乙酸
  参考文献：
  名称：

  基于片段的苯并呋喃命中作为新型大肠杆菌 DsbA 抑制剂的开发

  摘要：

  采用基于片段的药物发现方法来靶向大肠杆菌中的硫醇二硫化物氧化还原酶 DsbA (EcDsbA)。这种酶对于许多致病性革兰氏阴性菌中毒力因子的正确折叠至关重要，小分子抑制剂有可能被开发为抗毒力化合物。片段库的生物物理筛选鉴定了几类与 EcDsbA 具有亲和力的片段。一种具有高 mM 亲和力的命中，2-(6-溴苯并呋喃-3-基) 乙酸 (6)，在支架周围的几个位置进行了化学加工。精心设计的类似物的 X 射线晶体结构显示在与 EcDsbA 的催化二硫键相邻的疏水结合槽中结合。结合亲和力是根据 NMR 研究计算的，化合物 25 和 28 被确定为具有最高亲和力的结合剂，其解离常数 (KD) 分别为 326 ± 25 和 341 ± 57 µM。这项工作表明将苯并呋喃片段开发成一类新型 EcDsbA 抑制剂的潜力。

  DOI：

  10.3390/molecules24203756
• 作为产物：
  描述：

  吲哚-3-醋酸乙酯 、 碳酸二甲酯 在 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 mineral oil 为溶剂， 反应 16.0h， 以59%的产率得到dimethyl 1-carbomethoxy-3-indolylmalonate
  参考文献：
  名称：

  基于片段的苯并呋喃命中作为新型大肠杆菌 DsbA 抑制剂的开发

  摘要：

  采用基于片段的药物发现方法来靶向大肠杆菌中的硫醇二硫化物氧化还原酶 DsbA (EcDsbA)。这种酶对于许多致病性革兰氏阴性菌中毒力因子的正确折叠至关重要，小分子抑制剂有可能被开发为抗毒力化合物。片段库的生物物理筛选鉴定了几类与 EcDsbA 具有亲和力的片段。一种具有高 mM 亲和力的命中，2-(6-溴苯并呋喃-3-基) 乙酸 (6)，在支架周围的几个位置进行了化学加工。精心设计的类似物的 X 射线晶体结构显示在与 EcDsbA 的催化二硫键相邻的疏水结合槽中结合。结合亲和力是根据 NMR 研究计算的，化合物 25 和 28 被确定为具有最高亲和力的结合剂，其解离常数 (KD) 分别为 326 ± 25 和 341 ± 57 µM。这项工作表明将苯并呋喃片段开发成一类新型 EcDsbA 抑制剂的潜力。

  DOI：

  10.3390/molecules24203756

文献信息

• Cleavage of alkoxycarbonyl protecting groups from carbamates by t-BuNH2
  作者：Oscar R. Suárez-Castillo、Luis Alberto Montiel-Ortega、Myriam Meléndez-Rodríguez、Maricruz Sánchez-Zavala

  DOI：10.1016/j.tetlet.2006.11.024

  日期：2007.1

  An efficient, simple protocol for the selective cleavage of a variety of N-alkoxycarbonyl protecting groups by t-BuNH2/MeOH is described. The scope of the procedure was explored for a series of indole, aniline and pyrrolidine carbamate derivatives containing other potentially reactive functional groups affording a clean cleavage of the carbamate group.

  描述了一种有效，简单的方案，用于通过t -BuNH 2 / MeOH选择性裂解各种N-烷氧基羰基保护基。探索了该程序的范围，以研究一系列含有其他潜在反应性官能团的吲哚，苯胺和吡咯烷氨基甲酸酯衍生物，从而提供了氨基甲酸酯基团的清晰裂解。
• Aromatic Bromination versus Oxidation of Indolylmalonates by Bromine
  作者：Martha S. Morales-Ríos、Norma F. Santos-Sánchez、Oscar R. Suárez-Castillo、Pedro Joseph-Nathan

  DOI：10.1021/jo020543m

  日期：2003.1.1

  (2c), bromination at the 4- and 6-position is the dominating reaction. Investigation of the products composition of several 5-substituted indolylmalonates revealed the following trend: with a 5-substituted electron-withdrawing group like fluorine, the indolylmalonate undergoes oxidation rather than bromination. In contrast, with a 5-substituted electron-donating group, like a hydroxyl group, the ring

  据报道，在NCl（4）或AcOH中，在N（1）位置带有吸电子基团的5-取代的吲哚基丙二酸酯（2a-e）与溴的反应。这些底物与众所周知的芳族溴竞争而发生氧化。在两组条件下，对于母体吲哚基丙二酸酯（2a），观察到化学特异性氧化，而对于5-羟基吲哚基丙二酸酯（2c），在4-位和6-位的溴化反应占主导。对几种5-取代的吲哚基丙二酸酯的产物组成的研究显示出以下趋势：对于具有5-取代的吸电子基团，如氟，吲哚基丙二酸酯进行氧化而不是溴化。相反，对于5-取代的供电子基团，如羟基，环溴化优先于氧化。当5-取代基为烷氧基时，获得大量的溴化氧化产物。通过质谱监测氧化反应允许表征2-溴吲哚基亚丙二酸酯中间体。溴离子被认为是该中间体形成中的可能途径。由（1）1 H NMR光谱，单晶X射线衍射和从头算来确定不对称的甲氧基和苄氧基取代基的构象。
• Conformational studies of N-carbomethoxy-2-alkoxyindolenines by dynamic NMR, crystallography, and molecular mechanics
  作者：Oscar R. Suárez-Castillo、Yaneth M.A. Contreras-Martínez、Lidia Beiza-Granados、Myriam Meléndez-Rodríguez、J. Roberto Villagómez-Ibarra、J. Martín Torres-Valencia、Martha S. Morales-Ríos、Pedro Joseph-Nathan

  DOI：10.1016/j.tet.2005.07.023

  日期：2005.9

  and the transformation to their tautomeric indoles is reported. Variable-temperature 1H NMR studies of these 2-alkoxyindolenines evidenced dynamic processes involving two low-energy E and Z equilibrating conformers around the N–C(O) carbamate bond, for which the barriers (ΔG≠) between the two conformations are in the order of 12.5–13.9 kcal/mol, as deduced from computational NMR line shape simulations

  报道了N-羰甲氧基-2-烷氧基吲哚烯的合成和向其互变异构吲哚的转化。这些2-烷氧基吲哚胺的可变温度1 H NMR研究表明，动态过程涉及围绕N–C（O）氨基甲酸酯键的两个低能E和Z平衡构象异构体，这两个构象之间的壁垒（ΔG ≠）为从NMR线形模拟计算得出，其数量级为12.5-13.9 kcal / mol。旋转势垒随着烷氧基基团的体积的增加而降低，其中E构象异构体总是更稳定。分子力学计算证明是首选准分子与X射线衍射研究一致，随着空间效应的增加，五元环中烷氧基的N轴位置。
• Diastereoselective Indole-Dearomative Cope Rearrangements by Compounding Minor Driving Forces
  作者：Subhadip De、Breanna M. Tomiczek、Yinuo Yang、Kenneth Ko、Ion Ghiviriga、Adrian Roitberg、Alexander J. Grenning

  DOI：10.1021/acs.orglett.2c01381

  日期：2022.5.27

  Reported herein is the discovery of a diastereoselective indole-dearomative Cope rearrangement. A suite of minor driving forces promote dearomatization: (i) steric congestion in the starting material, (ii) alkylidene malononitrile and stilbene conjugation events in the product, and (iii) an unexpected intramolecular π–π* stack on the product side of the equilibrium. The key substrates are rapidly assembled

  本文报道的是非对映异构选择性吲哚-脱芳烃 Cope 重排的发现。一系列次要驱动力促进脱芳构化：(i) 起始材料中的空间拥塞，(ii) 产物中的亚烷基丙二腈和茋共轭事件，以及 (iii) 产物侧意外的分子内 π-π* 堆叠平衡。关键底物由简单的起始材料快速组装而成，产生了许多成功的例子。这些产品结构复杂，并带有由脱芳香 Cope 重排产生的邻位立体中心。它们还包含各种功能组，用于相互转换为复杂的体系结构。
• Indole derivatives
  作者：V. S. Rozhkov、Yu. I. Smushkevich、N. N. Suvorov

  DOI：10.1007/bf00475390

  日期：1980.1

表征谱图