5-dodecynyl-2',3'-dideoxyuridine | 951317-08-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-dodecynyl-2',3'-dideoxyuridine
• 英文别名: 5-dodec-1-ynyl-1-[(2R,5S)-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 951317-08-1
• 化学式: C₂₁H₃₂N₂O₄
• 分子量: 376.496
• InChiKey: LIFDELIBWJPEAF-RBUKOAKNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.71
• 拓扑面积：
  78.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-dodecynyl-2',3'-dideoxyuridine 在 copper(l) iodide 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 6-decyl-3-[(2R,5S)-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl]furo[2,3-d]pyrimidin-2-one
  参考文献：
  名称：

  基于亲脂性烷基呋喃并嘧啶双脱氧核苷的人类巨细胞病毒（HCMV）抑制剂新家族的发现：通过新型非核苷机制的作用。

  摘要：

  继我们发现亲脂性烷基呋喃并嘧啶2'-脱氧核苷的强力抗水痘带状疱疹病毒作用后，我们现在报道2'，3'-二脱氧糖类似物没有抗VZV活性，但却是人类的有效和选择性抑制剂巨细胞病毒（HCMV）。本发明化合物在约200℃下具有体外活性。1 microM，细胞毒性仅高于200 microM。重要的是，我们已经发现，尽管这些新试剂尽管具有核苷结构，但它们并不能充当核苷类似物，而且添加时间的研究表明，该化合物在DNA合成之前的病毒复制周期中可能抑制HCMV。它们代表了发现HCMV改良疗法的新线索，尤其是鉴于其新颖的作用机制。

  DOI：

  10.1021/jm030857h
• 作为产物：
  描述：

  2-脱氧尿苷 在 palladium on activated charcoal 吡啶 、 sodium hydroxide 、 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 氢气 、 一氯化碘 、 sodium hydride 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 20.0~100.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 29.0h， 生成 5-dodecynyl-2',3'-dideoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  基于亲脂性烷基呋喃并嘧啶双脱氧核苷的人类巨细胞病毒（HCMV）抑制剂新家族的发现：通过新型非核苷机制的作用。

  摘要：

  继我们发现亲脂性烷基呋喃并嘧啶2'-脱氧核苷的强力抗水痘带状疱疹病毒作用后，我们现在报道2'，3'-二脱氧糖类似物没有抗VZV活性，但却是人类的有效和选择性抑制剂巨细胞病毒（HCMV）。本发明化合物在约200℃下具有体外活性。1 microM，细胞毒性仅高于200 microM。重要的是，我们已经发现，尽管这些新试剂尽管具有核苷结构，但它们并不能充当核苷类似物，而且添加时间的研究表明，该化合物在DNA合成之前的病毒复制周期中可能抑制HCMV。它们代表了发现HCMV改良疗法的新线索，尤其是鉴于其新颖的作用机制。

  DOI：

  10.1021/jm030857h

文献信息

• Inhibition of <i>Mycobacterium tuberculosis</i>, <i>Mycobacterium bovis</i>, and <i>Mycobacterium </i><i>avium</i> by Novel Dideoxy Nucleosides
  作者：Dinesh Rai、Monika Johar、Naveen C. Srivastav、Tracey Manning、B. Agrawal、Dennis Y. Kunimoto、Rakesh Kumar

  DOI：10.1021/jm070391t

  日期：2007.9.1

  The prevalence of tuberculosis (TB) and mutidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) has been increasing, leading to serious infections, high mortality, and a global health threat. Here, we report the identification of a novel class of dideoxy nucleosides as potent and selective inhibitors of Mycobacterium bovis, Mycobacterium tuberculosis, and drug-resistant Mycobacterium tuberculosis. A series of 5-acetylenic derivatives of 2 ',3 '-dideoxyuridine (3-8) and 3 '-fluoro-2 ',3 '-dideoxyuridine (22-27) were synthesized and tested for their antimycobacterial activity against M. bovis, M. tuberculosis, and M. avium. 2 ',3 '-Dideoxyuridine possessing 5-decynyl, 5-dodecynyl, 5-tridecynyl, and 5-tetradecynyl substituents (4-7) exhibited the highest antimycobacterial activity against all three mycobacteria. In contrast, in the 3 '-fluoro-2 ',3 '-dideoxyuridine series, a 5-tetradecynyl analogue (26) displayed the most potent activity against these mycobacteria. Among other derivatives, 5-bromo-2',3'-dideoxycytidine (11), 5-methyl-2 ',3 '-dideoxycytidine (12). and 5-chloro-4-thio-2 ',3 '-dideoxyuridine (19) exhibited modest inhibition of M. bovis and M. tuberculosis. In the series of dideoxy derivatives of adenosine, guanosine, and purines, 2-amino-6-mercaptoethyl-9-(2,3-dideoxy-beta-D-glyceropentofuranosyl)purine (32) and 2-amino-4-fluoro-7-(2,3-dideoxy-beta-D-glyceropentofuranosyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidine (35) were the most efficacious against M. bovis and M. tuberculosis, and All. avium, respectively.
• Discovery of a New Family of Inhibitors of Human Cytomegalovirus (HCMV) Based upon Lipophilic Alkyl Furano Pyrimidine Dideoxy Nucleosides:  Action via a Novel Non-Nucleosidic Mechanism
  作者：Christopher McGuigan、Ranjith N. Pathirana、Robert Snoeck、Graciela Andrei、Erik De Clercq、Jan Balzarini

  DOI：10.1021/jm030857h

  日期：2004.3.1

  Following our discovery of the potent anti-varicella zoster virus action of lipophilic alkyl furano pyrimidine 2'-deoxynucleosides, we now report that 2',3'-dideoxy sugar analogues are devoid of anti-VZV activity but are potent and selective inhibitors of human cytomegalovirus (HCMV). The present compounds are active in vitro at ca. 1 microM with cytotoxicity only above 200 microM. Importantly, we

  继我们发现亲脂性烷基呋喃并嘧啶2'-脱氧核苷的强力抗水痘带状疱疹病毒作用后，我们现在报道2'，3'-二脱氧糖类似物没有抗VZV活性，但却是人类的有效和选择性抑制剂巨细胞病毒（HCMV）。本发明化合物在约200℃下具有体外活性。1 microM，细胞毒性仅高于200 microM。重要的是，我们已经发现，尽管这些新试剂尽管具有核苷结构，但它们并不能充当核苷类似物，而且添加时间的研究表明，该化合物在DNA合成之前的病毒复制周期中可能抑制HCMV。它们代表了发现HCMV改良疗法的新线索，尤其是鉴于其新颖的作用机制。