4-{4-[bis(2-chloroethyl)amino]phenyl}-N-[(10S,11S,15R,16R)-16-(4-hydroxy-3,5-dimethoxyphenyl)-14-oxo-4,6,13-trioxatetracyclo[7.7.0.0³,⁷.0¹¹,¹⁵]hexadeca-1,3(7),8-trien-10-yl]butanamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 木脂素、新木脂素和相关化合物 - 木脂素内酯
• 英文名称: 4-{4-[bis(2-chloroethyl)amino]phenyl}-N-[(10S,11S,15R,16R)-16-(4-hydroxy-3,5-dimethoxyphenyl)-14-oxo-4,6,13-trioxatetracyclo[7.7.0.0³,⁷.0¹¹,¹⁵]hexadeca-1,3(7),8-trien-10-yl]butanamide
• 英文别名: N-[(5S,5aS,8aR,9R)-9-(4-hydroxy-3,5-dimethoxyphenyl)-8-oxo-5a,6,8a,9-tetrahydro-5H-[2]benzofuro[5,6-f][1,3]benzodioxol-5-yl]-4-[4-[bis(2-chloroethyl)amino]phenyl]butanamide
• 化学式: C₃₅H₃₈Cl₂N₂O₈
• 分子量: 685.601
• InChiKey: PVKZPUJQGFOGCG-SRWWWFMASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.2
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  4β-azido-4-deoxy-4′-demethylepipodophyllotoxin 在 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 4-{4-[bis(2-chloroethyl)amino]phenyl}-N-[(10S,11S,15R,16R)-16-(4-hydroxy-3,5-dimethoxyphenyl)-14-oxo-4,6,13-trioxatetracyclo[7.7.0.0³,⁷.0¹¹,¹⁵]hexadeca-1,3(7),8-trien-10-yl]butanamide
  参考文献：
  名称：

  依托泊苷类似物表鬼臼毒素-N-芥末杂合化合物的基于结构的设计、合成和生物学测试，旨在与拓扑异构酶 II 和 DNA 共价结合

  摘要：

  靶向 DNA 拓扑异构酶 II 异构体和烷基化 DNA 的药物代表了两种机制不同且临床上重要的抗癌药物。在分子建模和对接的指导下，设计、合成和生物学表征了一系列依托泊苷类似物表鬼臼毒素-N-芥末杂化化合物。这些杂交体被设计为烷基化拓扑异构酶 II 上的亲核蛋白残基，从而产生无活性的共价加合物，并且也烷基化 DNA。最强大的杂交种的平均 GI 为50在 NCI-60 细胞筛选中，比依托泊苷低 17 倍。使用各种体外和基于细胞的测定，所有测试的杂交体都显示靶向拓扑异构酶 II。比较分析表明，这些杂种的 NCI 60 细胞生长抑制谱与它们所源自的依托泊苷和 N-芥末化合物相匹配。这些结果支持这样的结论，即杂种表现出的特征与同时靶向拓扑异构酶 II 和 DNA 一致。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2014.09.014

文献信息

• Structure-based design, synthesis and biological testing of etoposide analog epipodophyllotoxin–N-mustard hybrid compounds designed to covalently bind to topoisomerase II and DNA
  作者：Arun A. Yadav、Xing Wu、Daywin Patel、Jack C. Yalowich、Brian B. Hasinoff

  DOI：10.1016/j.bmc.2014.09.014

  日期：2014.11

  docking a series of etoposide analog epipodophyllotoxin–N-mustard hybrid compounds were designed, synthesized and biologically characterized. These hybrids were designed to alkylate nucleophilic protein residues on topoisomerase II and thus produce inactive covalent adducts and to also alkylate DNA. The most potent hybrid had a mean GI50 in the NCI-60 cell screen 17-fold lower than etoposide. Using a variety

  靶向 DNA 拓扑异构酶 II 异构体和烷基化 DNA 的药物代表了两种机制不同且临床上重要的抗癌药物。在分子建模和对接的指导下，设计、合成和生物学表征了一系列依托泊苷类似物表鬼臼毒素-N-芥末杂化化合物。这些杂交体被设计为烷基化拓扑异构酶 II 上的亲核蛋白残基，从而产生无活性的共价加合物，并且也烷基化 DNA。最强大的杂交种的平均 GI 为50在 NCI-60 细胞筛选中，比依托泊苷低 17 倍。使用各种体外和基于细胞的测定，所有测试的杂交体都显示靶向拓扑异构酶 II。比较分析表明，这些杂种的 NCI 60 细胞生长抑制谱与它们所源自的依托泊苷和 N-芥末化合物相匹配。这些结果支持这样的结论，即杂种表现出的特征与同时靶向拓扑异构酶 II 和 DNA 一致。