4’-[(7-amino-2,5-oxa)heptyl]-4,5’,8-trimethylpsoralen

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 香豆素及其衍生物
• 英文名称: 4’-[(7-amino-2,5-oxa)heptyl]-4,5’,8-trimethylpsoralen
• 英文别名: 3-[2-(2-Aminoethoxy)ethoxymethyl]-2,5,9-trimethylfuro[3,2-g]chromen-7-one
• 化学式: C₁₉H₂₃NO₅
• 分子量: 345.395
• InChiKey: UJZKJTNHMYJIJV-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.6
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  83.9
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  4,5‘,8-三甲基]补骨脂素 在 盐酸 、 sodium azide 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 丙酮 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 4’-[(7-amino-2,5-oxa)heptyl]-4,5’,8-trimethylpsoralen
  参考文献：
  名称：

  用于高效、多功能 miRNA-mRNA 交联的 miRNA 探针迷你文库的设计和应用

  摘要：

  MicroRNA 构成一类影响细胞内各种过程的内源性非编码 RNA。通过与目标信使 RNA 3' 非翻译区的部分互补位点进行碱基配对，microRNA 参与大多数人类蛋白质编码基因的转录后调控。它们的失调与许多病理过程和疾病有关。因此，深入了解 microRNA 的作用机制至关重要。在这里，我们提出了探针设计的新概念，以实现高效且与序列无关的 miRNA-mRNA 交联。新策略基于针对所选miRNA使用受控探针混合物，其中通过短的基于寡聚乙二醇的接头将trioxsalen部分引入所选胞苷的N 4 -位置。使用感兴趣的 microRNA 探针微型文库进行的体外光交联实验显示出不同的交联效率，证明了所提出方法的普遍适用性。

  DOI：

  10.1002/chem.202101171

文献信息

• Design and Application of Mini‐libraries of miRNA Probes for an Efficient and Versatile miRNA‐mRNA Cross‐linking
  作者：Anna L. Malinowska、Artur Laski、Jonathan Hall

  DOI：10.1002/chem.202101171

  日期：2021.7.12

  microRNA mechanisms of action is crucial. Here, we present a new concept of probe design to achieve an efficient and sequence-independent miRNA-mRNA cross-linking. The new strategy is based on the utilization of a controlled mixture of probes for a chosen miRNA, in which a trioxsalen moiety is introduced at the N4-position of a selected cytidine through short oligoethylene glycol-based linkers. In vitro

  MicroRNA 构成一类影响细胞内各种过程的内源性非编码 RNA。通过与目标信使 RNA 3' 非翻译区的部分互补位点进行碱基配对，microRNA 参与大多数人类蛋白质编码基因的转录后调控。它们的失调与许多病理过程和疾病有关。因此，深入了解 microRNA 的作用机制至关重要。在这里，我们提出了探针设计的新概念，以实现高效且与序列无关的 miRNA-mRNA 交联。新策略基于针对所选miRNA使用受控探针混合物，其中通过短的基于寡聚乙二醇的接头将trioxsalen部分引入所选胞苷的N 4 -位置。使用感兴趣的 microRNA 探针微型文库进行的体外光交联实验显示出不同的交联效率，证明了所提出方法的普遍适用性。