N5-[[[(2,3-二氢-2,2,4,6,7-五甲基-5-苯并呋喃基)磺酰基]氨基]亚氨基甲基]-L-鸟氨酸

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: N5-[[[(2,3-二氢-2,2,4,6,7-五甲基-5-苯并呋喃基)磺酰基]氨基]亚氨基甲基]-L-鸟氨酸
• 中文别名: H-Arg(Pbf)-OH
• 英文名称: (S)-2-amino-5-(3-(2,2,4,6,7-pentamethyl-2,3-dihydrobenzofuran-5-ylsulfonyl)guanidino)pentanoic acid
• 英文别名: H-Arg(Pbf)-OH；H-L-Arg(Pbf)-OH；L-Arg(Pbf)-OH；(2S)-5-[[amino-[(2,2,4,6,7-pentamethyl-3H-1-benzofuran-5-yl)sulfonylamino]methylidene]amino]-2-azaniumylpentanoate
• 化学式: C₁₉H₃₀N₄O₅S
• 分子量: 426.537
• InChiKey: GVIXTVCDNCXXSH-AWEZNQCLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  166
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N5-[[[(2,3-二氢-2,2,4,6,7-五甲基-5-苯并呋喃基)磺酰基]氨基]亚氨基甲基]-L-鸟氨酸 在 copper(ll) sulfate pentahydrate 、 triflic azide 、 potassium carbonate 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 以43%的产率得到Nω-Pbf-(2S)-5-guanidino-2-azidovaleric acid
  参考文献：
  名称：

  拟肽抗体-药物缀合物接头具有增强的蛋白酶特异性

  摘要：

  抗体-药物偶联物（ADC）已成为肿瘤学的重要治疗手段，其中三种已获得FDA批准，另外60多项已在临床试验中获得批准。尽管取得了进步，但仍需要改善ADC治疗指数。被溶酶体蛋白酶裂解的基于肽的ADC接头在血清中显示出足够的稳定性，并在靶细胞中有效释放有效负载。如果该接头可以被肿瘤特异性蛋白酶优先水解，则安全系数可能会提高。但是，基于肽的接头的使用限制了我们调节蛋白酶特异性的能力。在这里，我们报告新型非肽类ADC接头的结构指导发现。我们表明，含有环丁烷-1,1-二羧酸的连接子主要被组织蛋白酶B水解，而缬氨酸-瓜氨酸二肽连接子则不被水解。带有非肽接头的ADC在体内与具有二肽接头的ADC一样有效和稳定。我们的结果有力地支持了拟肽连接子的应用，并为改善ADC的选择性提供了新的机会。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.7b01430
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-Pbf-L-精氨酸 在 哌啶 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 16.0h， 以100%的产率得到N5-[[[(2,3-二氢-2,2,4,6,7-五甲基-5-苯并呋喃基)磺酰基]氨基]亚氨基甲基]-L-鸟氨酸
  参考文献：
  名称：

  拟肽抗体-药物缀合物接头具有增强的蛋白酶特异性

  摘要：

  抗体-药物偶联物（ADC）已成为肿瘤学的重要治疗手段，其中三种已获得FDA批准，另外60多项已在临床试验中获得批准。尽管取得了进步，但仍需要改善ADC治疗指数。被溶酶体蛋白酶裂解的基于肽的ADC接头在血清中显示出足够的稳定性，并在靶细胞中有效释放有效负载。如果该接头可以被肿瘤特异性蛋白酶优先水解，则安全系数可能会提高。但是，基于肽的接头的使用限制了我们调节蛋白酶特异性的能力。在这里，我们报告新型非肽类ADC接头的结构指导发现。我们表明，含有环丁烷-1,1-二羧酸的连接子主要被组织蛋白酶B水解，而缬氨酸-瓜氨酸二肽连接子则不被水解。带有非肽接头的ADC在体内与具有二肽接头的ADC一样有效和稳定。我们的结果有力地支持了拟肽连接子的应用，并为改善ADC的选择性提供了新的机会。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.7b01430

文献信息

• Sustainable Peptide Synthesis Enabled by a Transient Protecting Group
  作者：Sascha Knauer、Niklas Koch、Christina Uth、Reinhard Meusinger、Olga Avrutina、Harald Kolmar

  DOI：10.1002/anie.202003676

  日期：2020.7.27

  (Smoc) protecting group. This approach enables peptide assembly under aqueous conditions, real‐time monitoring of building block coupling, and efficient postsynthetic purification. The procedure for the synthesis of all natural and several non‐natural Smoc‐protected amino acids is described, as well as the assembly of 22 peptide sequences and the fundamental issues of SPPS, including the protecting group

  对合成肽的兴趣日益增长，促使人们开发出可持续的生产方法。当前，从受保护的结构单元组装肽需要大量有毒溶剂，并且转换为水作为反应介质仍然是肽化学中的主要障碍。我们报告了一种基于水相容性2,7-二硫代-9-芴基甲氧基羰基（Smoc）保护基的固相肽水合成策略。这种方法可在水性条件下进行肽组装，实时监测构件偶联以及有效的合成后纯化。描述了合成所有天然和几种非天然Smoc保护的氨基酸的程序，以及22种肽序列的组装和SPPS的基本问题，
• [EN] THE 5,6-DIMETHOXY-1, 1-DIOXOBENZO(B)THIOPHENE-2-METHYLOXYCARBONYL (DM-BSMOC) AND RELATED AMINO-PROTECTING GROUPS<br/>[FR] 5,6-DIMÉTHOXY-1, 1-DIOXOBENZO(B)THIOPHÈNE-2-MÉTHYLOXYCARBONYL (DM-BSMOC) ET GROUPES AMINO-PROTECTEURS CORRESPONDANTS
  申请人：UNIV MASSACHUSETTS

  公开号：WO2015009837A1

  公开（公告）日：2015-01-22

  Amino acid protecting groups are provided for use in peptide synthesis. Particular compounds disclosed include 5,6-dimethoxy-l,l-dioxobenzo[b]thiophi methyloxycarbonyl (DM-Bsmoc) and related amino-protecting groups.

  氨基酸保护基可用于肽合成。具体披露的化合物包括5,6-二甲氧基-1,1-二氧代苯并[b]噻吩甲氧羰基（DM-Bsmoc）和相关的氨基保护基。
• Water-soluble NHC-Cu catalysts: applications in click chemistry, bioconjugation and mechanistic analysis
  作者：Heriberto Díaz Velázquez、Yara Ruiz García、Matthias Vandichel、Annemieke Madder、Francis Verpoort

  DOI：10.1039/c4ob01350f

  日期：——

  A series of novel bis(NHC) Cu(i) catalysts enables the production of triazoles with different substitution patterns and bioconjugation via “click” chemistry under homogeneous and/or heterogeneous catalytic conditions in aqueous media.

  一系列新型双(NHC)铜(i)催化剂使得在水性介质中通过均相和/或非均相催化条件，生产具有不同取代模式和生物共轭的三唑类化合物，通过“点击”化学方法。
• A mild removal of Fmoc group using sodium azide
  作者：Chun-Chi Chen、Basker Rajagopal、Xuan Yu Liu、Kuan Lin Chen、Yu-Chang Tyan、FuI Lin、Po-Chiao Lin

  DOI：10.1007/s00726-013-1625-7

  日期：2014.2

  Finally, a biologically significant hexapeptide, angiotensin IV, was successfully synthesized by solid phase peptide synthesis using the developed sodium azide method for all Fmoc removals. The base-free condition provides a complement method for Fmoc deprotection in peptide chemistry and modern organic synthesis. Graphical Abstract

  摘要开发了一种使用叠氮化钠有效去除芴基甲氧基羰基（Fmoc）基团的温和方法。没有碱，叠氮化钠完全脱保护Ñ α-Fmoc-氨基酸在数小时内。仔细研究了溶剂依赖性条件，然后通过筛选不同的叠氮化钠量和反应温度对其进行优化。通过优化的反应，可以有效地，选择性地对各种含有Fmoc保护的氨基酸的残基进行不同程度的保护，这些残基被不同的保护基所掩盖。最后，使用开发的叠氮化钠方法通过固相肽合成成功去除了所有Fmoc，成功地合成了具有生物学意义的六肽血管紧张素IV。无碱条件为肽化学和现代有机合成中的Fmoc脱保护提供了一种补充方法。 图形概要
• SELECTIVE UV CROSSLINKING OF PEPTIDES AND FUNCTIONAL MOIETIES TO IMMUNOGLOBULINS
  申请人：UNIVERSITY OF NOTRE DAME DU LAC

  公开号：US20160022834A1

  公开（公告）日：2016-01-28

  The invention provides for a method of crosslinking a hetero-bifunctional photo crosslinking compound to an immunoglobulin having at least one heterocyclic photo reactive group and at least one non-photo reactive group where the non-photo reactive group is coupled to an effector molecule and the photo reactive group is coupled to the nucleotide binding site of an immunoglobulin. Alternatively, the photo crosslinker contains an orthogonal reactive group such as a thiol, which can be coupled to an effector molecule or functionalized ligand.

  该发明提供了一种将异双功能光交联化合物交联到至少具有一个杂环光反应基团和至少一个非光反应基团的免疫球蛋白的方法，其中非光反应基团与效应分子偶联，光反应基团与免疫球蛋白的核苷酸结合位点偶联。或者，光交联剂包含一个正交反应基团，例如硫醇，可以与效应分子或功能化配体结合。