5-iodo-5′-O-triisopropylsilyl-2′-deoxyuridine | 129696-31-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-iodo-5′-O-triisopropylsilyl-2′-deoxyuridine
• 英文别名: 5'-O-(triisopropylsilyl)-5-iodo-2'-deoxyuridine；1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-[tri(propan-2-yl)silyloxymethyl]oxolan-2-yl]-5-iodopyrimidine-2,4-dione
• CAS: 129696-31-7
• 化学式: C₁₈H₃₁IN₂O₅Si
• 分子量: 510.445
• InChiKey: SLYVJDRFFZNREQ-ARFHVFGLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.98
• 重原子数：
  27.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  93.55
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-iodo-5′-O-triisopropylsilyl-2′-deoxyuridine 在 camphor-10-sulfonic acid 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 3’-O-[1-(2-hydroxyethoxy)ethyl]-5-iodo-5’-O-triisopropylsilyl-2’-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  用于黑色素瘤选择性递送方法的新缀合物的间隔位优化†

  摘要：

  在寻找更具选择性的抗癌药物中，我们设计并合成了7种偶联物，这些偶联物改变了将5-碘2'-脱氧尿苷（IUdR）连接到ICF 01012黑色素瘤载体的连接子的结构，以实现潜在的肿瘤内特异性药物释放。化学和体外代谢稳定性评估表明，除酯缀合物（1）外，缩酮（2b），乙缩醛（2a），碳酸盐（4）和氨基甲酸酯（3）缀合物与我们的方法兼容。缩醛（2a）及其聚乙二醇化衍生物（2c）对于进一步的体内发育特别感兴趣。 由于它们各自的pH依赖性稳定性和有限的代谢降解作用而导致细胞的发育，以便利用恶性黑素细胞的酸性亚细胞环境在细胞内化后触发治疗剂的释放。

  DOI：

  10.1039/c3ob41428k
• 作为产物：
  描述：

  三异丙基氯硅烷 、 碘苷 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 19.0h， 以83%的产率得到5-iodo-5′-O-triisopropylsilyl-2′-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  用于黑色素瘤选择性递送方法的新缀合物的间隔位优化†

  摘要：

  在寻找更具选择性的抗癌药物中，我们设计并合成了7种偶联物，这些偶联物改变了将5-碘2'-脱氧尿苷（IUdR）连接到ICF 01012黑色素瘤载体的连接子的结构，以实现潜在的肿瘤内特异性药物释放。化学和体外代谢稳定性评估表明，除酯缀合物（1）外，缩酮（2b），乙缩醛（2a），碳酸盐（4）和氨基甲酸酯（3）缀合物与我们的方法兼容。缩醛（2a）及其聚乙二醇化衍生物（2c）对于进一步的体内发育特别感兴趣。 由于它们各自的pH依赖性稳定性和有限的代谢降解作用而导致细胞的发育，以便利用恶性黑素细胞的酸性亚细胞环境在细胞内化后触发治疗剂的释放。

  DOI：

  10.1039/c3ob41428k

文献信息

• Pre-organized dinucleosides with pendant porphyrins for the formation of sandwich type complexes with DABCO with high association constants
  作者：Sonja Merkas、Souhaila Bouatra、Régis Rein、Ivo Piantanida、Mladen Zinic、Nathalie Solladié

  DOI：10.1142/s1088424615500431

  日期：2015.1

  We report herein the synthesis of a dinucleotide bearing pendant porphyrins dedicated to adopt a pre-organized coformation with face-to-face porphyrins, and capable to self-organize in a stable sandwich type complexe with bidentate base such as DABCO. Earlier studies demonstrated that a peptidic linker does not provide sufficient pre-organization to enhance significantly the association constant with bidentate bases such as DABCO on the contrary of some other flexible linkers such as uridine or 2′-deoxyuridine. We document herein that the gain in stability for the formation of sandwich type host–guest complex with DABCO can be even greater when a dinucleotide linker is used. Such pre-organization increases the association constants by one to two orders of magnitude when compared to the association constants of the same bidentate ligands with a reference Zn(II) porphyrin. Comparison of these results with those obtained for rigid tweezers shows a better efficiency of the flexible nucleosidic dimers. We thus document the fact that the choice of rigid spacers is not the only way to pre-organize bis-porphyrins, and that some well-chosen nucleosidic linkers offer an interesting option for the synthesis of such devices. Furthermore, the chirality and enantio-purity of the nucleosidic linkers paves the way toward the selective complexation of enantio-pure bidentate guests and the resolution of racemates.

  我们在本文中报告了一种二核苷酸的合成过程，这种二核苷酸带有专门用于与面对面卟啉形成预组织共形的下垂卟啉，并且能够与双叉碱基（如 DABCO）自组织成稳定的三明治型络合物。早先的研究表明，与尿苷或 2′-脱氧尿苷等其他柔性连接体相反，肽连接体并不能提供足够的预组织能力来显著增强与双叉碱基（如 DABCO）的结合常数。我们在本文中发现，当使用二核苷酸连接体时，与 DABCO 形成三明治型主客复合物的稳定性会有更大的提高。与相同的双齿配体与参考锌（II）卟啉的结合常数相比，这种预组织会将结合常数提高一到两个数量级。将这些结果与刚性镊子的结果进行比较，可以发现柔性核苷酸二聚体的效率更高。因此，我们证明了一个事实：选择刚性间隔物并不是预组织双卟啉的唯一方法，一些精心选择的核苷酸连接物为合成这种装置提供了一种有趣的选择。此外，核苷酸连接体的手性和对映体纯度为选择性地与对映体纯度较高的二叉宾客复合以及解析外消旋物铺平了道路。
• Efficiency of Dinucleosides as the Backbone to Pre-Organize Multi-Porphyrins and Enhance Their Stability as Sandwich Type Complexes with DABCO
  作者：Sonja Merkaš、Souhaila Bouatra、Régis Rein、Ivo Piantanida、Mladen Zinic、Nathalie Solladié

  DOI：10.3390/molecules22071112

  日期：——

  Flexible linkers such as uridine or 2′-deoxyuridine pre-organize bis-porphyrins in a face-to-face conformation, thus forming stable sandwich complexes with a bidentate base such as 1,4-diazabicyclo[2.2.2]octane (DABCO). Increased stability can be even greater when a dinucleotide linker is used. Such pre-organization increases the association constant by one to two orders of magnitude when compared

  灵活的接头，如尿苷或 2'-脱氧尿苷，以面对面的构象预组织双卟啉，从而与双齿碱基如 1,4-二氮杂双环 [2.2.2] 辛烷 (DABCO) 形成稳定的夹心复合物. 当使用二核苷酸接头时，稳定性甚至可以更高。与 DABCO 与参考卟啉的结合常数相比，这种预组织使结合常数增加了一到两个数量级。与刚性镊子相比，核苷二聚体的效率更高。因此，刚性间隔物的选择并不是预先组织双卟啉的唯一方法，精心选择的核苷连接物为此类装置的合成提供了一个有趣的选择。
• 3′-O-Substituted 5-(perylen-3-ylethynyl)-2′-deoxyuridines as tick-borne encephalitis virus reproduction inhibitors
  作者：Gleb V. Proskurin、Alexey A. Orlov、Vladimir A. Brylev、Liubov I. Kozlovskaya、Alexey A. Chistov、Galina G. Karganova、Vladimir A. Palyulin、Dmitry I. Osolodkin、Vladimir A. Korshun、Andrey V. Aralov

  DOI：10.1016/j.ejmech.2018.05.040

  日期：2018.7

  A series of analogues of potent antiviral perylene nucleoside dUY11 with methylthiomethyl (MTM), azidomethyl (AZM) and HO-C1-4-alkyl-1,2,3-triazol-1,4-diyl groups at 3'-O-position as well as the two products of copper-free alkyne-azide cycloaddition of the AZM derivative were prepared and evaluated against tick-borne encephalitis virus (TBEV). Four compounds (4, 6, 8a, 8b) showed EC50 <= 10 nM, thus appearing the most potent TBEV inhibitors to date. Moreover, these nucleosides have higher lipophilicity (clogP) and increased solubility in aq. DMSO vs. parent compound dUY11. (C) 2018 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.
• SPROAT, BRIAN S.;LAMOND, ANGUS;BEIJER, BARBRO;NEUER, PHILIPPE;RYDER, URSU+, NUCL. ACIDS. RES., 17,(1989) N, C. 3373-3386
  作者：SPROAT, BRIAN S.、LAMOND, ANGUS、BEIJER, BARBRO、NEUER, PHILIPPE、RYDER, URSU+

  DOI：——

  日期：——