我们先前已经使用三取代的
环丙烷作为肽替代物,以在许多重要酶的已知假肽
抑制剂中诱导构象限制。
环丙烷衍生的
肽模拟物是新颖的,因为它们是少数以预定方式局部定向肽主链和
氨基酸侧链的替代物。尽管已使用这些二肽等排体来模拟模仿chi(1)空间的gauche(-)构象的
氨基酸侧链,但尚未评估它们将侧链投射为反方向的能力。作为朝着这个目标迈出的第一步,制备了构象受限的假肽8和10以及它们相应的柔性类似物9和11并作为基质
金属
蛋白酶(MMP)的
抑制剂进行了测试。这些化合物是4和5的类似物 已知是有效的MMP
抑制剂。相对于
环丙烷上的肽主链取代基,预测8中的异丙基侧链和10中的芳环的反方向对应于5的P1'和P2'侧链与MMP结合时的已知方向。因此,明确设计了8和10,以探测MMP的S1'或S2'结合口袋的拓扑特征。他们还被设计来探索P1'-P2'酰胺基的重要性,该基团已知在几种MMP
抑制剂复合物中形成高度保守的