(1S,3S,4R)-3-苄氧基-4-苄氧基甲基环戊烷-1-醇 | 114826-94-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 中文名称: (1S,3S,4R)-3-苄氧基-4-苄氧基甲基环戊烷-1-醇
• 中文别名: 环戊醇,3-(苯基甲氧基)-4-[(苯基甲氧基)甲基]-,(1S,3S,4R)-
• 英文名称: (1S,3S,4R)-3-benzyloxy-4-benzyloxymethylcyclopentan-1-ol
• 英文别名: 4a'-carba-α-(D)-5',3'-dibenzyl-2'-deoxyribose；(3S,4R)-3-(benzyloxy)-4-(benzyloxymethyl)cyclopentanol；α-D-5',2'-dibenzyl-carba-2'-desoxyribose；(1S,3S,4R)-3-benzyloxy-4-(benzyloxymethyl)cyclopentanol；(1S,3S,4R)-3-phenylmethoxy-4-(phenylmethoxymethyl)cyclopentan-1-ol
• CAS: 114826-94-7
• 化学式: C₂₀H₂₄O₃
• 分子量: 312.409
• InChiKey: VCEMXZUJUHCNIX-AABGKKOBSA-N

物化性质

• 沸点：
  443.2±40.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.14±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  38.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1S,3S,4R)-3-苄氧基-4-苄氧基甲基环戊烷-1-醇 在 吡啶 、 sodium azide 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 (1R,3S,4R)-1-azido-3-benzyloxy-4-benzyloxymethylcyclopentane
  参考文献：
  名称：

  一种核酸配体、其缀合物、制备方法及用途

  摘要：

  本公开提供了一种核酸配体、其缀合物、制备方法及用途。具体而言，本公开提供一种配体，结构如式(I)所示，本公开提供的配体通过与核酸缀合达到了优异的表达抑制效果。

  公开号：

  CN114853829A
• 作为产物：
  描述：

  (1R,3S,4R)-3-苄氧基-4-苄氧基甲基环戊烷-1-醇 在 sodium hydroxide 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 三苯基膦 作用下， 以 甲醇 、 乙醚 为溶剂， 生成 (1S,3S,4R)-3-苄氧基-4-苄氧基甲基环戊烷-1-醇
  参考文献：
  名称：

  New Convergent Synthesis of Carbocyclic Nucleoside Analogues

  摘要：

  将描述两种趋同的方法用于合成碳环核苷类似物。这两种方法均以从烷基化环戊二烯中选择性制备的立体化学纯环戊醇8为起点。通过这些方法，已合成出dT、FdU和BVdU的碳环类似物。此外，还将展示一种例子中转化为环Sal-前核苷酸及相应核苷酸的过程。

  DOI：

  10.1055/s-2003-41455

文献信息

• Influence of theN3-Protection Group onN1- vs.O2-Alkylation in the Mitsunobu Reaction
  作者：Olaf R. Ludek、Chris Meier

  DOI：10.1002/ejoc.200500801

  日期：2006.2

  The influence of the N3-protection group of thymine on the regioselectivity of the N1- vs. O2-alkylation under Mitsunobu conditions is described. A series of N3-protected thymine derivatives 8a–f was prepared and coupled to cyclopentanol as model compound for carbocyclic nucleoside precursors. Finally, the N3-BOM group was selected to improve our previously reported synthetic strategy to carbocyclic

  描述了在 Mitsunobu 条件下胸腺嘧啶的 N3-保护基团对 N1-与 O2-烷基化的区域选择性的影响。制备了一系列 N3 保护的胸腺嘧啶衍生物 8a-f，并与环戊醇偶联作为碳环核苷前体的模型化合物。最后，选择 N3-BOM 组来改进我们之前报道的碳环胸苷 (carba-dT) 合成策略。此外，2,6-二甲基-Bz 基团专门导致了carba-dT 的O2-类似物。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2006)
• Stereoselective Synthesis of<scp>D</scp>- and<scp>L</scp>-Carbocyclic Nucleosides by Enzymatically Catalyzed Kinetic Resolution
  作者：Miriam Mahler、Bastian Reichardt、Philip Hartjen、Jan van Lunzen、Chris Meier

  DOI：10.1002/chem.201200733

  日期：2012.8.27

  the starting materials for the syntheses of carbocyclic D‐ and L‐nucleoside analogues were readily accessible. 3′,4′‐Unsaturated D‐ or L‐carbocyclic nucleosides were obtained from the condensation of various nucleobases with (S)‐ or (R)‐cyclopentenol. Functionalization of the double bond in 3′‐deoxy‐3′,4′‐didehydro‐carba‐D‐thymidine led to a variety of new nucleoside analogues. By using the cycloSal

  通过应用酶催化动力学拆分方法开发了（S）-或（R）-3-（苄氧基甲基）环戊-3-烯醇的有效合成方法。该方法允许合成具有高光学纯度（> 98％ee）的对映体结构单元（S）-和（R）-环戊烯醇。与以前的方法相比，此方法的主要优势在于，可在仅包含一个立体生成中心的对映异构体水平上进行拆分。由于该特征，可以将对映异构体彼此化学转化。通过这种途径，合成碳环D-和L的原料核苷类似物很容易获得。3'，4'-不饱和D-或L-碳环核苷是通过各种核碱基与（S）-或（R）-环戊烯醇的缩合获得的。3'-脱氧-3'，4'-二氢-卡巴-D-胸苷中双键的功能化导致了许多新的核苷类似物。通过使用环Sal方法，可以轻松获得其相应的磷酸化代谢产物。此外，碳环2'-脱氧核苷组成的新的合成路线被开发，从而导致d -和大号-卡巴-dT。d -卡巴-dT是为测试抗病毒活性对多药耐药的HIV-1菌株和E2-2相对于已知的抗病毒剂的d4T，以及大号-卡巴-dT。虽然发现L
• Facile Synthesis of Fluorinated Benzofuro- and Benzothieno[2,3-b]pyridines, α-Carbolines and Nucleosides Containing the α-Carboline Framework
  作者：Viktor Iaroshenko、Yan Wang、Biao Zhang、Dmitriy Volochnyuk、Vyacheslav Sosnovskikh

  DOI：10.1055/s-0029-1217396

  日期：2009.7

  Fluorinated benzofuro[2,3-b]pyridines, benzo­thieno[2,3-b]pyridines and 9H-pyrido[2,3-b]indoles (α-carbolines) were synthesized via regiospecific pyridine core annulation of a number of fluoro-containing 1,3-CCC-dielectrophiles to benzofuran-2-amine, benzothiophen-2-amine and 1H-indol-2-amine. Based on the 2,4-bis(trifluoromethyl)-9H-pyrido[2,3-b]indole thus synthesized, the preparative approach towards a set of nucleosides and nucleoside mimetics bearing the α-carboline framework was elaborated.

  合氟苯并呋喃[2,3-b]吡啶、苯并噻吩[2,3-b]吡啶和9H-吡啶[2,3-b]吲哚（α-卡宾）通过多种含氟的1,3-CCC-双电亲体与苯并呋喃-2-胺、苯并噻吩-2-胺和1H-吲哚-2-胺进行区域选择性的吡啶核心环化反应合成。基于所合成的2,4-二（三氟甲基）-9H-吡啶[2,3-b]吲哚，进一步阐述了制备一系列具有α-卡宾结构的核苷和核苷类似物的方法。
• Single Labeled DNA FIT Probes for Avoiding False-Positive Signaling in the Detection of DNA/RNA in qPCR or Cell Media
  作者：Felix Hövelmann、Lucas Bethge、Oliver Seitz

  DOI：10.1002/cbic.201200397

  日期：2012.9.24

  FIT for the right track: The fluorescence response of DNA probes that contain a single thiazole orange (TO) “base” is specific for complementary RNA and DNA targets. Strong fluorescence enhancements are obtained at varied temperatures and in challenging media such as cell lysates.

  正确的FIT：包含单个噻唑橙（TO）“碱基”的DNA探针的荧光响应对互补的RNA和DNA靶标具有特异性。在变化的温度和挑战性的培养基（如细胞裂解液）中获得了强大的荧光增强作用。
• Synthesis and Conformational Analysis of Locked Carbocyclic Analogues of 1,3-Diazepinone Riboside, a High-Affinity Cytidine Deaminase Inhibitor
  作者：Olaf R. Ludek、Gottfried K. Schroeder、Chenzhong Liao、Pamela L. Russ、Richard Wolfenden、Victor E. Marquez

  DOI：10.1021/jo901127a

  日期：2009.8.21

  site. Nucleoside analogues where the leaving NH3 group is replaced by a proton and prevent conversion of the transition state to product are very potent inhibitors of the enzyme. However, stable carbocyclic versions of these analogues are less effective as the role of the ribose in facilitating formation of hydrated species is abolished. The discovery that a 1,3-diazepinone riboside (4) operated as a

  胞苷脱氨酶 (CDA) 通过由锌结合水在活性位点的亲核攻击产生的水合过渡态中间体催化胞苷脱氨。离开的NH 3基团被质子取代并防止过渡态转化为产物的核苷类似物是非常有效的酶抑制剂。然而，这些类似物的稳定碳环形式不太有效，因为核糖在促进水合物种形成方面的作用被取消。发现 1,3-二氮杂酮核苷 ( 4) 作为 CDA 的紧密结合抑制剂，独立于水合作用，为研究构建为构象锁定的碳环 1,3-二氮杂酮核苷的新型抑制剂提供了机会，以确定酶对特定形式的糖褶的构象偏好。这项工作描述了两个目标双环 [3.1.0] 己烷核苷的合成，锁定为北 ( 5 ) 和南 ( 6 ) 构象异构体，以及一个灵活的类似物 ( 7) 由环戊烷环构成。所有三个目标中的七元 1,3-二氮杂环酮环是通过闭环复分解由相应的苯甲酰基保护的碳环双烯丙基脲构建的。结果表明 CDA 对南糖褶皱的结合偏好与结合在活性位点的其他 CDA 抑制剂的高分辨率晶体结构一致。