5-((benzoyloxy)methyl)-2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3-vinyltetrahydrofuran-3,4-diyl dibenzoate | 188413-95-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-((benzoyloxy)methyl)-2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3-vinyltetrahydrofuran-3,4-diyl dibenzoate
• 英文别名: [(2R,3R,4R,5R)-3,4-dibenzoyloxy-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-ethenyloxolan-2-yl]methyl benzoate
• CAS: 188413-95-8
• 化学式: C₃₂H₂₆N₂O₉
• 分子量: 582.566
• InChiKey: VAOKZDPZYIRBTL-YJDNVBHCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.3
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.16
• 拓扑面积：
  138
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-((benzoyloxy)methyl)-2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3-vinyltetrahydrofuran-3,4-diyl dibenzoate 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 sodium tetrahydroborate 、 sodium periodate 、 N-碘代丁二酰亚胺 、 四氧化锇 、 ammonium cerium (IV) nitrate 、 四丁基氟化铵 、 碘 、 sodium methylate 、 三氯化硼 、 sodium hydride 、 potassium carbonate 、 N-甲基吗啉氧化物 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 61.67h， 生成 [(2R,3S,4R,5R)-4-benzoyloxy-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2-fluoro-4-(fluoromethyl)-2-(iodomethyl)oxolan-3-yl] benzoate
  参考文献：
  名称：

  4'-Fluoro-2'-取代尿苷三磷酸和核苷酸前药的合成和抗 HCV 活性：发现用于治疗肝炎的 4'-Fluoro-2'-C-甲基尿苷 5'-氨基磷酸酯前药 (AL-335) C 感染。

  摘要：

  我们报告了一系列 4'-fluoro-2'- C-取代尿苷的合成和生物学评价。尿苷类似物的三磷酸盐表现出对丙型肝炎病毒 (HCV) NS5B 聚合酶的有效抑制作用，IC50 值低至 27 nM。在 HCV 亚基因组复制子测定中，这些尿苷类似物的氨基磷酸酯前药表现出非常有效的活性，EC50 值低至 20 nM。先导化合物 AL-335 (53) 在体外单次口服剂量后，在人原代肝细胞和 Huh-7 细胞以及狗肝脏中表现出高水平的三磷酸核苷。化合物 53 被选择用于临床开发，在 1 期和 2 期试验中显示出有希望的结果。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.9b00143
• 作为产物：
  描述：

  1,3,5-三苯甲酰基-D-呋喃核糖 在 4-二甲氨基吡啶 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 三乙胺 、 2-碘酰基苯甲酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 39.0h， 生成 5-((benzoyloxy)methyl)-2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3-vinyltetrahydrofuran-3,4-diyl dibenzoate
  参考文献：
  名称：

  SUBSTITUTED NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND ANALOGS THEREOF

  摘要：

  本文披露了核苷、核苷酸类似物、合成核苷酸类似物的方法，以及利用一个或多个核苷和/或核苷酸类似物治疗Filoviridae病毒感染等疾病和/或症状的方法。

  公开号：

  US20150366887A1

文献信息

• [EN] SUBSTITUTED NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND ANALOGS THEREOF<br/>[FR] NUCLÉOSIDES, NUCLÉOTIDES SUBSTITUÉS ET LEURS ANALOGUES
  申请人：ALIOS BIOPHARMA INC

  公开号：WO2014209979A1

  公开（公告）日：2014-12-31

  Disclosed herein are nucleosides, nucleotides and analogs thereof, pharmaceutical compositions that include one or more of nucleosides, nucleotides and analogs thereof, and methods of synthesizing the same. Also disclosed herein are methods of ameliorating and/or treating a disease and/or a condition, including an infection from a norovirus, with a nucleoside, a nucleotide and an analog thereof.

  本文揭示了核苷、核苷酸及其类似物，包括一个或多个核苷、核苷酸及其类似物的药物组合物，以及它们的合成方法。本文还揭示了利用核苷、核苷酸及其类似物改善和/或治疗疾病和/或病况的方法，包括使用核苷、核苷酸和其类似物治疗诺如病毒感染的方法。
• Activity of Selected Nucleoside Analogue ProTides against Zika Virus in Human Neural Stem Cells
  作者：Jean A. Bernatchez、Michael Coste、Sungjun Beck、Grace A. Wells、Lucas A. Luna、Alex E. Clark、Zhe Zhu、David Hecht、Jeremy N. Rich、Christal D. Sohl、Byron W. Purse、Jair L. Siqueira-Neto

  DOI：10.3390/v11040365

  日期：——

  an aryloxyl phosphoramidate masking group. Substitution of a 2-(methylthio) ethyl phosphoramidate for the aryloxyl phosphoramidate ProTide group of 2'-C-methyluridine completely abolished antiviral activity of the compound. The aryloxyl phosphoramidate ProTide of 2'-C-methyluridine outperformed the hepatitis C virus (HCV) drug sofosbuvir in suppression of viral titers and protection from cytopathic

  Zika病毒（ZIKV）是一种新兴的黄病毒，可导致胎儿神经发育受损，并与Guillain-Barré综合征有关，由于缺乏针对性的预防或治疗，仍在威胁全球健康。核苷类似物是有效的抗病毒抑制剂的良好实例，使用磷酸掩蔽基团（ProTides）的前药策略已被用于改善核糖核苷类似物的生物利用度。在这里，我们合成并测试了在人类神经干细胞中针对ZIKV的13个ProTides的小型文库。对于具有芳氧基氨基磷酸氨基酯掩蔽基团的2'-C-甲基尿苷和2'-C-乙炔基尿苷脯氨酸，观察到强活性。用2'（甲硫基）氨基磷酸乙酯取代2'的芳氧基氨基磷酸酯ProTide基团 -C-甲基尿苷完全消除了该化合物的抗病毒活性。2'-C-甲基尿苷的芳氧基氨基磷酸氨基甲酸酯ProTide在抑制病毒滴度和防止细胞病变作用方面优于丙型肝炎病毒（HCV）药物sofosbuvir，而随着时间的推移，前者化合物的三磷酸盐活性代谢产物可以更好地与纯化的ZIKV
• Substituted nucleosides, nucleotides and analogs thereof
  申请人：ALIOS BIOPHARMA, INC.

  公开号：US10307439B2

  公开（公告）日：2019-06-04

  Disclosed herein are nucleosides, nucleotides and nucleotide analogs, methods of synthesizing the same and methods of treating diseases and/or conditions such as a Coronaviridae virus, a Togaviridae virus, a Hepeviridae virus and/or a Bunyaviridae virus infection with one or more nucleosides, nucleotides and nucleotide analogs.

  本文公开了核苷、核苷酸和核苷酸类似物、合成方法以及用一种或多种核苷、核苷酸和核苷酸类似物治疗冠状病毒科病毒、妥加病毒科病毒、肝病毒科病毒和/或布尼亚病毒科病毒感染等疾病和/或病症的方法。
• A Short, Flexible Route toward 2‘-<i>C</i>-Branched Ribonucleosides
  作者：Rogers E. Harry-O'kuru、Jennifer M. Smith、Michael S. Wolfe

  DOI：10.1021/jo961893+

  日期：1997.3.1

  A five-step synthesis of 2'-C-branched ribonucleosides from commercially obtained 1,3,5-tri-0-benzoyl-alpha-D-ribofuranose (4) is described. The free hydroxyl group of 4 was oxidized in high yield with Dess-Martin periodane reagent. The resultant 2-ketosugar was treated with MeMgBr/TiCl4, CH2=CHMgBr/CeCl3, or TMSC drop CLi/CeCl3, and in each case addition to the ketone proceeded stereoselectively to provide 2-alkylated ribofuranosides. After conversion to the corresponding tetrabenzoyl derivatives, the 2-alkylribofuranosides were coupled to nucleobases under Vorbruggen persilylation conditions, giving the beta-nucleosides with high stereoselectivity. Deprotection with methanolic ammonia provided the title compounds in 17-49% overall yields from 4.
• 2′-<i>C</i>-Alkylribonucleosides: Design, Synthesis, and Conformation
  作者：Rogers E. Harry-O'kuru、Emily A. Kryjak、Michael S. Wolfe

  DOI：10.1080/07328319708006205

  日期：1997.7

  Certain 2'-C-alkylribonucleotides have been designed as potential mechanism-based inactivators of ribonucleotide reductases. A short, flexible route toward the corresponding nucleosides and NMR evidence concerning their preferred solution conformations are discussed.