人烟酰胺
磷酸核糖转移酶 (N
AMPT) 补充
NAD 库并控制
去乙酰化酶、单和聚 (
ADP-
核糖) 聚合酶以及
NAD 核苷酶的活性。酶过渡态 (
TS) 的性质对于理解 N
AMPT 的功能至关重要。我们通过动力学同位素效应 (KIE) 确定了烟酰胺单核苷酸 (
NMN)
焦磷酸解的
TS 结构。使用天然底物
NMN 和
焦磷酸盐 (PPi),内在 KIE 为 [1'-(14)C]、[1-(15)N]、[1'-(3)H] 和 [2'- (3)H]分别为1.047、1.029、1.154和1.093。使用独特的量子计算方法进行
TS 分析,其中包括催化位点的结构元素。在没有约束(例如施加扭转角)的情况下,理论数据和实验数据非常一致。量子力学计算纳入了一个关键的催化位点残基(D313)、两个
镁原子和配位
水分子。
TS 模型预测初级 (14)C、α-次级 (3)H、β-次级 (3)H 和初级 (15)N