1-((2R,3R,4R)-4-((叔丁基二甲基硅烷基)氧基)-3-氟-5,5-双(羟甲基) | 1445379-61-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 中文名称: 1-((2R,3R,4R)-4-((叔丁基二甲基硅烷基)氧基)-3-氟-5,5-双(羟甲基)
• 英文名称: 4'-α-methylhydroxyl-3'-tert-butyldimethylsilyl-2'-deoxy-2'-fluorouridine
• 英文别名: 1-((2R,3R,4R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-3-fluoro-5,5-bis(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione；1-[(2R,3R,4R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-3-fluoro-5,5-bis(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1445379-61-2
• 化学式: C₁₆H₂₇FN₂O₆Si
• 分子量: 390.484
• InChiKey: FQCJMRIFHYTBRI-FRRDWIJNSA-N

物化性质

• 密度：
  1.27±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.52
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-((2R,3R,4R)-4-((叔丁基二甲基硅烷基)氧基)-3-氟-5,5-双(羟甲基) 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 氟化铵 、 三苯基氯硅烷 、 silver nitrate 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 4-amino-1-[(2R,3R,4R)-3-fluoro-4-hydroxy-5,5-bis(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
  参考文献：
  名称：

  [EN] SUBSTITUTED NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND ANALOGS THEREOF
  [FR] NUCLÉOSIDES, NUCLÉOTIDES SUBSTITUÉS ET LEURS ANALOGUES

  摘要：

  本文揭示了核苷、核苷酸及其类似物，包括一个或多个核苷、核苷酸及其类似物的药物组合物，以及它们的合成方法。本文还揭示了利用核苷、核苷酸及其类似物改善和/或治疗疾病和/或病况的方法，包括使用核苷、核苷酸和其类似物治疗诺如病毒感染的方法。

  公开号：

  WO2014209979A1
• 作为产物：
  描述：

  叔丁基二甲基氯硅烷 在 吡啶 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 、 sodium hydroxide 、 2-碘酰基苯甲酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 49.5h， 生成 1-((2R,3R,4R)-4-((叔丁基二甲基硅烷基)氧基)-3-氟-5,5-双(羟甲基)
  参考文献：
  名称：

  SUBSTITUTED NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND ANALOGS THEREOF

  摘要：

  本文披露了核苷、核苷酸及其类似物，包括一个或多个核苷、核苷酸及其类似物的药物组合物，以及它们的合成方法。本文还披露了使用核苷、核苷酸和其类似物来改善和/或治疗疾病和/或病况的方法，包括使用核苷、核苷酸和其类似物来治疗副粘病毒和/或正粘病毒感染的方法。

  公开号：

  US20130165400A1

文献信息

• Discovery of 4′-Chloromethyl-2′-deoxy-3′,5′-di-<i>O</i>-isobutyryl-2′-fluorocytidine (ALS-8176), A First-in-Class RSV Polymerase Inhibitor for Treatment of Human Respiratory Syncytial Virus Infection
  作者：Guangyi Wang、Jerome Deval、Jin Hong、Natalia Dyatkina、Marija Prhavc、Joshua Taylor、Amy Fung、Zhinan Jin、Sarah K. Stevens、Vladimir Serebryany、Jyanwei Liu、Qingling Zhang、Yuen Tam、Sushmita M. Chanda、David B. Smith、Julian A. Symons、Lawrence M. Blatt、Leo Beigelman

  DOI：10.1021/jm5017279

  日期：2015.2.26

  Clearly, there is an urgent need for small molecule RSV drugs. This article reports the design, synthesis, anti-RSV activity, metabolism, and pharmacokinetics of a series of 4′-substituted cytidine nucleosides. Among tested compounds 4′-chloromethyl-2′-deoxy-2′-fluorocytidine (2c) exhibited the most promising activity in the RSV replicon assay with an EC50 of 0.15 μM. The 5′-triphosphate of 2c (2c-TP)

  呼吸道合胞病毒（RSV）是儿童期的主要病原体，与明显的发病率和死亡率有关。迄今为止，利巴韦林是唯一获准使用的小分子药物，用途有限。唯一的其他RSV药物是帕利珠单抗（palivizumab），一种单克隆抗体，可用于RSV预防。显然，迫切需要小分子RSV药物。本文报道了一系列4'-取代胞苷核苷的设计，合成，抗RSV活性，代谢和药代动力学。在测试的化合物中，4'-氯甲基-2'-脱氧-2'-氟胞苷（2c）在RSV复制子测定中表现出最有希望的活性，EC 50为0.15μM。2c（2c - TP的5'-三磷酸）抑制RSV聚合酶的IC 50为0.02μM，而对100μM的人DNA和RNA聚合酶没有明显的抑制作用。ALS-8176（71）是2c的3'，5'-二-O-异丁酰基前药，在体内具有良好的口服生物利用度和2c - TP高水平。化合物71是一流的核苷RSV聚合酶抑制剂，在2期临床RSV攻击研究中显示出优异的抗RSV功效和安全性。
• Synthesis and anti-HCV activity of 3′,4′-oxetane nucleosides
  作者：Wonsuk Chang、Jinfa Du、Suguna Rachakonda、Bruce S. Ross、Serge Convers-Reignier、Wei T. Yau、Jean-Francois Pons、Eisuke Murakami、Haiying Bao、Holly Micolochick Steuer、Phillip A. Furman、Michael J. Otto、Michael J. Sofia

  DOI：10.1016/j.bmcl.2010.06.025

  日期：2010.8

  treat this disease. Our first generation nucleoside HCV inhibitor, RG7128 has already established proof-of-concept in the clinic and is currently in phase IIb clinical trials. As part of our continuing efforts to discover novel anti-HCV agents, 3′,4′-oxetane cytidine and adenosine nucleosides were prepared as inhibitors of HCV RNA replication. These nucleosides were shown not to be inhibitors of HCV

  丙型肝炎病毒折磨着全世界大约 1.8 亿人，目前没有可用于治疗这种疾病的直接作用的抗病毒药物。我们的第一代核苷 HCV 抑制剂 RG7128 已经在临床上建立了概念验证，目前处于 IIb 期临床试验中。作为我们不断努力发现新型抗 HCV 药物的一部分，我们制备了 3',4'-氧杂环丁烷胞苷和腺苷核苷作为 HCV RNA 复制的抑制剂。如在全细胞亚基因组复制子测定中所确定的，这些核苷显示不是HCV的抑制剂。然而，2'-单/二氟类似物4、5和6很容易被脱氧胞苷激酶磷酸化为它们的单磷酸盐代谢物，并且它们的三磷酸盐衍生物在体外被证明是 HCV NS5B 聚合酶的抑制剂。复制子测定中缺乏抗 HCV 活性可能是由于单磷酸盐不能转化为其相应的二磷酸盐。
• Exploring Atypical Fluorine-Hydrogen Bonds and Their Effects on Nucleoside Conformations
  作者：Daniel O'Reilly、Robin S. Stein、Mihai Burai Patrascu、Sunit Kumar Jana、Jerry Kurian、Nicolas Moitessier、Masad J. Damha

  DOI：10.1002/chem.201803940

  日期：2018.11.2

  C−H⋅⋅⋅F hydrogen bond in a 2′‐F,4′‐C‐α‐alkyl‐ribonucleoside analogue. This interaction was also supported by QTAIM and NBO analyses, which confirmed a bond critical point for the C−H⋅⋅⋅F interaction (0.74 kcal mol−1). In contrast, although conformational analysis and NMR experiments of 2′‐deoxy‐2′‐fluoro‐arabinonucleosides indicated a close proximity between the 2′‐fluorine and the H6/8 protons of the

  氟作为氢键受体的能力已经争论了很多年。短时间的氢氟接触被认为在稳定某些复杂的超分子系统中起着关键作用。为了直接探查氟氢键的存在，我们对一系列C2'-氟化核苷进行了NMR光谱和计算建模。具体来说，量子力学/分子力学（QM / MM）分析和[ 19 F，1 H] HMBC NMR实验提供了2'-F，4'-C-中C–H⋅⋅⋅F氢键的直接证据。 α-烷基核糖核苷类似物。QTAIM和NBO分析也支持了这种相互作用，这证实了C-H⋅⋅⋅F相互作用的键临界点（0.74 kcal mol -1）。相反，尽管对2'-脱氧-2'-氟-阿拉伯糖核苷的构象分析和NMR实验表明2'-氟与核碱基的H6 / 8质子非常接近，但分子模拟并未提供C的证据。 -H⋅⋅⋅F氢键。
• J. Med. Chem. 2015, 58, 1862-1878
  作者：

  DOI：——

  日期：——