去甲糖胺基万古霉素 | 101485-50-1

• 物质功能分类: 分析化学 - 标准品 - 药典标准品和杂质标准品
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: 去甲糖胺基万古霉素
• 中文别名: 万古霉素杂质
• 英文名称: vancomycin pseudoaglycon
• 英文别名: Devancoaminyl-vancomycin；(1S,2R,18R,19R,22S,25R,28R,40S)-22-(2-amino-2-oxoethyl)-5,15-dichloro-2,18,32,35,37-pentahydroxy-19-[[(2R)-4-methyl-2-(methylazaniumyl)pentanoyl]amino]-20,23,26,42,44-pentaoxo-48-[(2S,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-7,13-dioxa-21,24,27,41,43-pentazaoctacyclo[26.14.2.23,6.214,17.18,12.129,33.010,25.034,39]pentaconta-3,5,8(48),9,11,14,16,29(45),30,32,34(39),35,37,46,49-pentadecaene-40-carboxylate
• CAS: 101485-50-1
• 化学式: C₅₉H₆₂Cl₂N₈O₂₂
• 分子量: 1306.09
• InChiKey: QCHYVJAUGVHJHX-PZIRYZLHSA-N

物化性质

• 密度：
  1.70±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于DMSO（轻微）、甲醇（轻微、加热）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.4
• 重原子数：
  91
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  11.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  486
• 氢给体数：
  18
• 氢受体数：
  23

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  去甲糖胺基万古霉素 在 三氟乙酸 作用下， 反应 3.0h， 生成 万古霉素糖苷配基
  参考文献：
  名称：

  从万古霉素和相关抗生素中选择性裂解凡可可胺，葡萄糖和N-甲基亮氨酸

  摘要：

  万古霉素和相关抗生素与三氟乙酸在–15°C的条件下反应40小时，可选择性裂解氨基糖类香豆素。通过与三氟乙酸在50°C下反应3小时，除去第二个糖（葡萄糖），并使用Edman降解程序裂解N末端亮氨酸部分。

  DOI：

  10.1039/c39880001306
• 作为产物：
  描述：

  万古霉素 在 三氟乙酸 作用下， 反应 40.0h， 生成 去甲糖胺基万古霉素
  参考文献：
  名称：

  从万古霉素和相关抗生素中选择性裂解凡可可胺，葡萄糖和N-甲基亮氨酸

  摘要：

  万古霉素和相关抗生素与三氟乙酸在–15°C的条件下反应40小时，可选择性裂解氨基糖类香豆素。通过与三氟乙酸在50°C下反应3小时，除去第二个糖（葡萄糖），并使用Edman降解程序裂解N末端亮氨酸部分。

  DOI：

  10.1039/c39880001306

文献信息

• [EN] METHODS OF USING SEMI-SYNTHETIC GLYCOPEPTIDES AS ANTIBACTERIAL AGENTS<br/>[FR] PROCÉDÉS D'UTILISATION DE GLYCOPEPTIDES SEMI-SYNTHÉTIQUES EN TANT QU'AGENTS ANTIBACTÉRIENS
  申请人：BIOMARIN PHARM INC

  公开号：WO2011140009A1

  公开（公告）日：2011-11-10

  Methods of using semi-synthetic glycopeptides of formula I-XIV having antibacterial activity are described.

  描述了利用具有抗菌活性的半合成糖肽（化学式I-XIV）的方法。
• Total Syntheses and Initial Evaluation of [Ψ[C(═S)NH]Tpg⁴]vancomycin, [Ψ[C(═NH)NH]Tpg⁴]vancomycin, [Ψ[CH₂NH]Tpg⁴]vancomycin, and Their (4-Chlorobiphenyl)methyl Derivatives: Synergistic Binding Pocket and Peripheral Modifications for the Glycopeptide Antibiotics
  作者：Akinori Okano、Atsushi Nakayama、Kejia Wu、Erick A. Lindsey、Alex W. Schammel、Yiqing Feng、Karen C. Collins、Dale L. Boger

  DOI：10.1021/jacs.5b01008

  日期：2015.3.18

  derivatives and full details of the peripheral chlorobiphenyl functionalization of all of the binding-pocket-modified vancomycin analogues designed for dual D-Ala-D-Ala/D-Ala-D-Lac binding. Their collective assessment indicates that combined binding pocket and chlorobiphenyl peripherally modified analogues exhibit a remarkable spectrum of antimicrobial activity (VSSA, MRSA, and VanA and VanB VRE) and impressive

  公开了关于万古霉素结合口袋类似物的全合成研究的全部细节，该类似物带有外周 L-vancoSAminyl-1,2-D-葡糖基二糖，其包含对残基 4 酰胺（残基 4 羰基）中的一个关键单原子的改变。 O → S、NH、H2) 旨在直接解决万古霉素耐药性的潜在分子基础。还公开了对合成上更易接近的 C 端羟甲基苷元衍生物进行后期转化的试验研究，以及为双 D-Ala-D-设计的所有结合口袋修饰的万古霉素类似物的外围氯联苯官能化的全部细节。 Ala/D-Ala-D-Lac 结合。他们的集体评估表明，结合口袋和氯联苯外周修饰类似物的组合表现出显着的抗菌活性谱（VSSA、MRSA 和 VanA 和 VanB VRE）以及对万古霉素敏感和万古霉素耐药细菌的显着效力（MIC = 0.06-0.005脒和亚甲基类似物分别为 0.5-0.06 μg/mL）并且可能受益于两种独立的协同作用机制，其中只有一种依赖于
• [EN] NOVEL SEMI-SYNTHETIC GLYCOPEPTIDES AS ANTIBACTERIAL AGENTS<br/>[FR] NOUVEAUX GLYCOPEPTIDES SEMI-SYNTHÉTIQUES COMME AGENTS ANTIBACTÉRIENS
  申请人：LEAD THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2009085562A1

  公开（公告）日：2009-07-09

  Semi-synthetic glycopeptides having antibacterial activity are described, in particular, the semi-synthetic glycopeptides described herein are made by chemical modification of a glycopeptide (Compound A, Compound B, Compound H or Compound C) or monosaccharide made by hydrolyzing the disaccharide moiety of the amino acid-4 of the parent glycopeptide in acidic medium to give the amino acid-4 monosaccharide; conversion of the monosaccharide to the amino-sugar derivative; acylation of the amino substituent on the amino acid-4 amino-substituted sugar moiety on these scaffolds with certain acyl groups; and conversion of the acid moiety on the macrocyclic ring of these scaffolds to certain substituted amides. Key reaction is the treatment of properly protected intermediate compound with isocyanate or carrying a Hofmann degradation of the primary amide of the 3rd amino acid asparagines with phenyl-bis-trifluoroacetate to give the primary amine. Also provided are methods for the synthesis of the compounds, pharmaceutical compositions containing the compounds, and methods of use of the compounds for the treatment and/or prophylaxis of diseases, especially bacterial infections.

  本文描述了具有抗菌活性的半合成糖肽，特别是在此处描述的半合成糖肽是通过对一种糖肽（化合物A、化合物B、化合物H或化合物C）或通过在酸性介质中水解母体糖肽的氨基酸-4的二糖基团以获得氨基酸-4单糖；将单糖转化为氨基糖衍生物；酰化这些支架上氨基酸-4氨基取代糖基团上的氨基取代基团；以及将这些支架的大环环上的酸基团转化为某些取代酰胺。关键反应是将适当保护的中间化合物与异氰酸酯处理，或者将第3个氨基酸天冬氨酸的主要酰胺通过苯基-双三氟乙酸酯进行霍夫曼降解以获得主要胺基。还提供了合成这些化合物的方法，含有这些化合物的药物组合物，以及用于治疗和/或预防疾病，特别是细菌感染的化合物的使用方法。
• Enzymatic Glycosylation of Vancomycin Aglycon: Completion of a Total Synthesis of Vancomycin and N- and C-Terminus Substituent Effects of the Aglycon Substrate
  作者：Atsushi Nakayama、Akinori Okano、Yiqing Feng、James C. Collins、Karen C. Collins、Christopher T. Walsh、Dale L. Boger

  DOI：10.1021/ol501568t

  日期：2014.7.3

  Studies on the further development of the sequential glycosylations of the vancomycin aglycon catalyzed by the glycosyltransferases GtfE and GtfD and the observation of unusual, perhaps unexpected, aglycon substrate substituent effects on the rate and efficiency of the initial glycosylation reaction are reported.

  报告了由糖基转移酶 GtfE 和 GtfD 催化的万古霉素苷元连续糖基化的进一步发展的研究，以及观察到不寻常的、也许是意想不到的苷元底物取代基对初始糖基化反应的速率和效率的影响。
• A Systematic Investigation of the Synthetic Utility of Glycopeptide Glycosyltransferases
  作者：Markus Oberthür、Catherine Leimkuhler、Ryan G. Kruger、Wei Lu、Christopher T. Walsh、Daniel Kahne

  DOI：10.1021/ja052945s

  日期：2005.8.1

  bacterial secondary metabolites may be useful for the generation of sugar-modified analogues of bioactive natural products. Some glycosyltransferases have relaxed substrate specificity, and it has been assumed that promiscuity is a feature of the class. As part of a program to explore the synthetic utility of these enzymes, we have analyzed the substrate selectivity of glycosyltransferases that attach similar

  参与细菌次级代谢产物生物合成的糖基转移酶可用于生成生物活性天然产物的糖修饰类似物。一些糖基转移酶具有宽松的底物特异性，并且已经假定滥交是该类的一个特征。作为探索这些酶合成效用计划的一部分，我们使用纯化的酶和化学合成的 TDP β- 分析了将类似的 2-脱氧-L-糖连接到万古霉素型糖肽苷元的糖基转移酶的底物选择性。 2-脱氧-L-糖类似物。我们表明，虽然这些糖肽糖基转移酶中的一些是混杂的，但其他糖肽糖基转移酶只能容忍它们将处理的底物的微小修改。例如，糖基转移酶 GtfC 和 GtfD，分别将 4-epi-L-vancosamine 和 L-vancosamine 转移到万古霉素假糖苷和氯定向素 B 的葡萄糖单元的 C-2，显示出适度放松的供体底物特异性对其天然苷元的糖基化。相比之下，GtfA，一种将 4-epi-L-vancosamine 连接到苄基位置的转移酶，仅利用与其天然 TDP 糖底