N-((1S,2R,3R,4R)-4-{(S)-1-[(1H-Benzoimidazol-2-ylmethyl)-carbamoyl]-2-methyl-butylcarbamoyl}-1-cyclohexylmethyl-2,3-dihydroxy-5-methyl-hexyl)-2-{2-[2-(2-methoxy-ethoxy)-ethoxy]-ethoxy}-benzamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: N-((1S,2R,3R,4R)-4-{(S)-1-[(1H-Benzoimidazol-2-ylmethyl)-carbamoyl]-2-methyl-butylcarbamoyl}-1-cyclohexylmethyl-2,3-dihydroxy-5-methyl-hexyl)-2-{2-[2-(2-methoxy-ethoxy)-ethoxy]-ethoxy}-benzamide
• 英文别名: N-[(1S,2R,3R,4R)-4-[[(1S)-1-(1H-benzimidazol-2-ylmethylcarbamoyl)-2-methyl-butyl]carbamoyl]-1-(cyclohexylmethyl)-2,3-dihydroxy-5-methyl-hexyl]-2-[2-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]ethoxy]benzamide；N-[(2S,3R,4R,5R)-5-[[(2S)-1-(1H-benzimidazol-2-ylmethylamino)-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]carbamoyl]-1-cyclohexyl-3,4-dihydroxy-6-methylheptan-2-yl]-2-[2-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]ethoxy]benzamide
• 化学式: C₄₃H₆₅N₅O₉
• 分子量: 796.017
• InChiKey: QTHQMCPKFJNBFV-SLRAAWEXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.4
• 重原子数：
  57
• 可旋转键数：
  25
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.63
• 拓扑面积：
  193
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  水杨酸乙酯 在 sodium hydroxide 、 氰基磷酸二乙酯 、 potassium carbonate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 N-((1S,2R,3R,4R)-4-{(S)-1-[(1H-Benzoimidazol-2-ylmethyl)-carbamoyl]-2-methyl-butylcarbamoyl}-1-cyclohexylmethyl-2,3-dihydroxy-5-methyl-hexyl)-2-{2-[2-(2-methoxy-ethoxy)-ethoxy]-ethoxy}-benzamide
  参考文献：
  名称：

  来自人类免疫缺陷病毒的蛋白酶的抑制剂：一系列含有二羟基乙烯过渡态等排体的化合物的合成，酶抑制和抗病毒活性。

  摘要：

  制备了许多含有二羟基乙烯等排物的潜在HIV蛋白酶抑制肽，并评估了它们在细胞培养物中的酶结合亲和力和抗病毒活性。从先前报道的活性肽A的模板中，评估在N-和C-末端基团上的修饰以潜在维持所得肽的良好抑制活性。在发现的活性肽中，肽X显示出有效的酶抑制活性。有趣的是，先前报道的用于制备非常活性的HIV蛋白酶抑制肽的有效的1（S）-氨基-2（R）-羟基茚满C-末端基团不能应用于肽XVIII的模板。以肽A的X射线晶体结构为起点，研究了肽XVIII的分子模型，以便研究活性部位裂口中肽XVIII的可能构象。获得了肽A和XVIII的相对结合构象，尽管在本报告中对许多同类肽的结合亲和力差的原因尚不十分清楚。然而，更重要的是，发现肽XVIII在HIV-1 / PBMC分析中显示出比参考肽A更有效的抗病毒活性，参考肽A先前据报道在该分析中的功效与逆转录酶抑制剂AZT大致相等。尽管在本报告中对许多同类肽的结合亲和力

  DOI：

  10.1021/jm00060a001

文献信息

• Inhibitors of the protease from human immunodeficiency virus: synthesis, enzyme inhibition, and antiviral activity of a series of compounds containing the dihydroxyethylene transition-state isostere
  作者：Suvit Thaisrivongs、Steve R. Turner、Joseph W. Strohbach、Ruth E. TenBrink、W. Gary Tarpley、Thomas J. McQuade、Robert L. Heinrikson、Alfredo G. Tomasselli、John O. Hui、W. Jeffrey Howe

  DOI：10.1021/jm00060a001

  日期：1993.4

  A number of potential HIV protease inhibitory peptides that contain the dihydroxyethylene isostere were prepared and evaluated for their enzyme binding affinity and antiviral activity in cell cultures. From the template of a previously reported active peptide A, modifications at the N- and C-terminal groups were assessed for potential maintenance of good inhibitory activity of the resulting peptides

  制备了许多含有二羟基乙烯等排物的潜在HIV蛋白酶抑制肽，并评估了它们在细胞培养物中的酶结合亲和力和抗病毒活性。从先前报道的活性肽A的模板中，评估在N-和C-末端基团上的修饰以潜在维持所得肽的良好抑制活性。在发现的活性肽中，肽X显示出有效的酶抑制活性。有趣的是，先前报道的用于制备非常活性的HIV蛋白酶抑制肽的有效的1（S）-氨基-2（R）-羟基茚满C-末端基团不能应用于肽XVIII的模板。以肽A的X射线晶体结构为起点，研究了肽XVIII的分子模型，以便研究活性部位裂口中肽XVIII的可能构象。获得了肽A和XVIII的相对结合构象，尽管在本报告中对许多同类肽的结合亲和力差的原因尚不十分清楚。然而，更重要的是，发现肽XVIII在HIV-1 / PBMC分析中显示出比参考肽A更有效的抗病毒活性，参考肽A先前据报道在该分析中的功效与逆转录酶抑制剂AZT大致相等。尽管在本报告中对许多同类肽的结合亲和力