5`-O-三苯甲基-2`-脱氧-Β-D-LYXO喃糖基胸腺嘧啶 | 55612-11-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 中文名称: 5`-O-三苯甲基-2`-脱氧-Β-D-LYXO喃糖基胸腺嘧啶
• 英文名称: 5'-O-trityldeoxyxylothymidine
• 英文别名: 1-(5-O-trityl-2-deoxy-β-D-lyxofuranosyl)thymine；5-methyl-1-(O⁵-trityl-β-D-threo-2-deoxy-pentofuranosyl)-1H-pyrimidine-2,4-dione；1-[5'-O-triphenylmethyl-2'-deoxy-β-D-threopentofuranosyl]thymine；1-(5-O-trityl-2-deoxy-β-D-threo-pentofuranosyl)thymine；5'-O-trityl-xylothymidine；1-(2-deoxy-5-O-trityl-beta-D-threopentofuranosyl)thymine；1-[(2R,4R,5R)-4-hydroxy-5-(trityloxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 55612-11-8
• 化学式: C₂₉H₂₈N₂O₅
• 分子量: 484.552
• InChiKey: FZDHVUVGQXVYOP-TWJOJJKGSA-N

物化性质

• 熔点：
  246-248 °C(lit.)
• 溶解度：
  可溶于氯仿、可溶于二氯甲烷、甲醇
• 稳定性/保质期：
  遵照规定使用和储存，则不会分解。

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  88.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 安全说明：
  S61
• 危险类别码：
  R53
• WGK Germany：
  1
• 危险性描述：
  H413
• 储存条件：
  保持贮藏器密封，将其放入一个紧密封装的容器中，并存放在阴凉、干燥的地方。

SDS

1.1 产品标识符
: 5′-O-三苯代甲基-2′-脱氧-β-D-呋喃来苏糖基胸苷
产品名称
1.2 鉴别的其他方法
无数据资料
1.3 有关的确定了的物质或混合物的用途和建议不适合的用途
仅供科研用途，不作为药物、家庭备用药或其它用途。

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模块 2. 危险性概述
2.1 GHS分类
慢性水生毒性 (类别4)
2.2 GHS 标记要素，包括预防性的陈述
象形图 无
警示词 无
危险申明
H413 可能对水生生物造成长期持续有害影响。
警告申明
预防
P273 避免释放到环境中。
处理
P501 将内容物/ 容器处理到得到批准的废物处理厂。
2.3 其它危害物 - 无

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模块 3. 成分/组成信息
3.1 物 质
: C29H28N2O5
分子式
: 484.54 g/mol
分子量
组分 浓度或浓度范围
1-(2-Deoxy-5-O-trityl-ß-D-threopentofuranosyl)thymine
-
CAS 号 55612-11-8
EC-编号 407-120-6
索引编号 616-072-00-7

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模块 4. 急救措施
4.1 必要的急救措施描述
一般的建议
请教医生。 出示此安全技术说明书给到现场的医生看。
吸入
如果吸入,请将患者移到新鲜空气处。 如果停止了呼吸,给于人工呼吸。 请教医生。
皮肤接触
用肥皂和大量的水冲洗。 请教医生。
眼睛接触
用水冲洗眼睛作为预防措施。
食入
切勿给失去知觉者从嘴里喂食任何东西。 用水漱口。 请教医生。
4.2 主要症状和影响，急性和迟发效应
据我们所知，此化学，物理和毒性性质尚未经完整的研究。
4.3 及时的医疗处理和所需的特殊处理的说明和指示
无数据资料

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模块 5. 消防措施
5.1 灭火介质
灭火方法及灭火剂
用水雾,耐醇泡沫,干粉或二氧化碳灭火。
5.2 源于此物质或混合物的特别的危害
碳氧化物, 氮氧化物
5.3 给消防员的建议
如必要的话,戴自给式呼吸器去救火。
5.4 进一步信息
无数据资料

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模块 6. 泄露应急处理
6.1 人员的预防,防护设备和紧急处理程序
防止粉尘的生成。 防止吸入蒸汽、气雾或气体。 保证充分的通风。
6.2 环境保护措施
在确保安全的前提下，采取措施防止进一步的泄漏或溢出。 不要让产物进入下水道。
防止排放到周围环境中。
6.3 抑制和清除溢出物的方法和材料
收集、处理泄漏物，不要产生灰尘。 扫掉和铲掉。 存放进适当的闭口容器中待处理。
6.4 参考其他部分
丢弃处理请参阅第13节。

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模块 7. 操作处置与储存
7.1 安全操作的注意事项
在有粉尘生成的地方,提供合适的排风设备。
7.2 安全储存的条件,包括任何不兼容性
贮存在阴凉处。 容器保持紧闭，储存在干燥通风处。
7.3 特定用途
无数据资料

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模块 8. 接触控制和个体防护
8.1 容许浓度
最高容许浓度
没有已知的国家规定的暴露极限。
8.2 暴露控制
适当的技术控制
按照良好工业和安全规范操作。 休息前和工作结束时洗手。
个体防护设备
眼/面保护
请使用经官方标准如NIOSH (美国) 或 EN 166(欧盟) 检测与批准的设备防护眼部。
皮肤保护
戴手套取 手套在使用前必须受检查。
请使用合适的方法脱除手套(不要接触手套外部表面),避免任何皮肤部位接触此产品.
使用后请将被污染过的手套根据相关法律法规和有效的实验室规章程序谨慎处理. 请清洗并吹干双手
所选择的保护手套必须符合EU的89/686/EEC规定和从它衍生出来的EN 376标准。
身体保护
根据危险物质的类型，浓度和量，以及特定的工作场所来选择人体保护措施。,
防护设备的类型必须根据特定工作场所中的危险物的浓度和含量来选择。
呼吸系统防护
不需要保护呼吸。如需防护粉尘损害，请使用N95型（US）或P1型（EN 143)防尘面具。
呼吸器使用经过测试并通过政府标准如NIOSH（US）或CEN（EU）的呼吸器和零件。

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模块 9. 理化特性
9.1 基本的理化特性的信息
a) 外观与性状
形状: 粉末
颜色: 白色
b) 气味
无数据资料
c) 气味阈值
无数据资料
d) pH值
无数据资料
e) 熔点/凝固点
熔点/凝固点: 246 - 248 °C - lit.
f) 起始沸点和沸程
无数据资料
g) 闪点
无数据资料
h) 蒸发速率
无数据资料
i) 易燃性(固体,气体)
无数据资料
j) 高的/低的燃烧性或爆炸性限度 无数据资料
k) 蒸汽压
无数据资料
l) 蒸汽密度
无数据资料
m) 相对密度
无数据资料
n) 水溶性
无数据资料
o) n-辛醇/水分配系数
辛醇--水的分配系数的对数值: 5
p) 自燃温度
无数据资料
q) 分解温度
无数据资料
r) 粘度
无数据资料

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模块 10. 稳定性和反应活性
10.1 反应性
无数据资料
10.2 稳定性
无数据资料
10.3 危险反应的可能性
无数据资料
10.4 应避免的条件
无数据资料
10.5 不兼容的材料
强氧化剂
10.6 危险的分解产物
其它分解产物 - 无数据资料

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模块 11. 毒理学资料
11.1 毒理学影响的信息
急性毒性
无数据资料
皮肤刺激或腐蚀
无数据资料
眼睛刺激或腐蚀
无数据资料
呼吸道或皮肤过敏
无数据资料
生殖细胞突变性
无数据资料
致癌性
IARC:
此产品中没有大于或等于 0。1%含量的组分被 IARC鉴别为可能的或肯定的人类致癌物。
生殖毒性
无数据资料
特异性靶器官系统毒性（一次接触）
无数据资料
特异性靶器官系统毒性（反复接触）
无数据资料
吸入危险
无数据资料
潜在的健康影响
吸入 吸入可能有害。 可能引起呼吸道刺激。
摄入 如服入是有害的。
皮肤 如果通过皮肤吸收可能是有害的。 可能引起皮肤刺激。
眼睛 可能引起眼睛刺激。
接触后的征兆和症状
据我们所知，此化学，物理和毒性性质尚未经完整的研究。
附加说明
化学物质毒性作用登记: 无数据资料

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模块 12. 生态学资料
12.1 生态毒性
无数据资料
12.2 持久存留性和降解性
无数据资料
12.3 潜在的生物蓄积性
无数据资料
12.4 土壤中的迁移性
无数据资料
12.5 PBT 和 vPvB的结果评价
无数据资料
12.6 其它不利的影响

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模块 13. 废弃处置
13.1 废物处理方法
产品
将剩余的和未回收的溶液交给处理公司。
与易燃溶剂相溶或者相混合，在备有燃烧后处理和洗刷作用的化学焚化炉中燃烧
受污染的容器和包装
作为未用过的产品弃置。

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模块 14. 运输信息
14.1 联合国危险货物编号
欧洲陆运危规: - 国际海运危规: - 国际空运危规: -
14.2 联合国（UN）规定的名称
欧洲陆运危规: 非危险货物
国际海运危规: 非危险货物
国际空运危规: 非危险货物
14.3 运输危险类别
欧洲陆运危规: - 国际海运危规: - 国际空运危规: -
14.4 包裹组
欧洲陆运危规: - 国际海运危规: - 国际空运危规: -
14.5 环境危险
欧洲陆运危规: 否 国际海运危规 海运污染物: 否 国际空运危规: 否
14.6 对使用者的特别提醒
无数据资料

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模块 16. 其他信息
进一步信息
版权所有：2012 Co. LLC. 公司。许可无限制纸张拷贝，仅限于内部使用。
上述信息视为正确，但不包含所有的信息，仅作为指引使用。本文件中的信息是基于我们目前所知，就正
确的安全提示来说适用于本品。该信息不代表对此产品性质的保证。
参见发票或包装条的反面。

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模块 15 - 法规信息
N/A

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5`-O-三苯甲基-2`-脱氧-Β-D-LYXO喃糖基胸腺嘧啶 在 吡啶 、 叠氮化锂 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 13.0h， 生成 3'-叠氮基-3'-脱氧-5'-O-三苯甲基胸苷
  参考文献：
  名称：

  Solid-Phase synthesis of positively charged deoxynucleic guanidine (DNG) oligonucleotide mixed sequences

  摘要：

  Positively charged DNG oligonucleotide mixed sequences containing A/T bases were prepared by solid-phase synthesis. Synthesis proceeds in 3'-->5' direction and involves coupling of 3'-Fmoc protected thiourea in the presence of HgCl2/TEA with the corresponding 5'-amine of the growing oligo chain. DNG binding characteristics with complementary DNA and with itself have been evaluated. (C) 2003 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/s0960-894x(03)00119-7
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-tritylthymidine 在 吡啶 、 sodium hydroxide 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 33.0h， 生成 5`-O-三苯甲基-2`-脱氧-Β-D-LYXO喃糖基胸腺嘧啶
  参考文献：
  名称：

  3'-氟-3'-脱氧胸腺嘧啶核苷的合成及其18 F-放射性标记的研究，作为无创性监测抗艾滋病药物生物分布的示踪剂

  摘要：

  3'-叠氮基胸苷（AZT）的氟化类似物3'-Fluoro-3'-脱氧胸苷（FDT）对HIV病毒更具活性，但比AZT毒性更大。由于它具有氟原子，因此可以用18 F标记，以监测该药物的生物分布和靶向性。已经开发出适用于18 F标记的FDT的新合成方法。在用三苯甲基保护5'-羟基后，将3'-羟基用Lyxo构型的甲磺酰基取代。用18 F氟化钾和Crown-18醚处理可得到18 F标记的氟代衍生物，在去三苯甲基化后可得到18 FF FDT具有7％的标记效率。这是首次报道使用氟化钾合成3'-氟-5'-O-三苯甲基脱氧胸苷并制备其18 F标记的类似物。在中间体化合物中掺入18 F并分离终产物所需的时间相当短（大约2小时），这将有足够的时间对这种短寿命的放射性核素进行生物学研究。

  DOI：

  10.1016/s0022-1139(00)82356-8

文献信息

• PRECURSOR COMPOUND CONNECTED TO SOLID SUPPORT FOR MANUFACTURING 18F RADIOPHARMACEUTICAL, METHOD FOR MANUFACTURING SAME, AND APPLICATION THEREOF
  申请人：Chi Dae-Yoon

  公开号：US20140011961A1

  公开（公告）日：2014-01-09

  The present invention relates to a solid precursor in the form of an organic salt, the solid precursor having a solid support, a method for manufacturing same, and an application thereof. The solid precursor of the present invention enables omission of the [ 18 F]fluoride refining process using additional cartridge, and the use of excessive phase-transfer catalyst, and can easily remove remaining substance after reaction through the solid support inside the precursor. The solid precursor of the present invention is very appropriate for an automated synthesis device as an all-in-one system that can carry out overall process of [ 18 F]fluorosis reaction, when used by charging in a cartridge.

  本发明涉及一种有机盐形式的固体前体，该固体前体具有固体支撑物，以及制造该固体前体的方法和其应用。本发明的固体前体使得可以省略使用额外的装置进行[ 18 F]氟化物精制过程，并且可以使用过量的相转移催化剂，并且可以通过前体内部的固体支撑物轻松去除反应后剩余物质。本发明的固体前体非常适用于作为一种全自动合成装置，可以通过在装置中充电使用，执行[ 18 F]氟化反应的整个过程。
• Antiviral Activity of Various 1-(2′-Deoxy-β-<scp>d</scp>-lyxofuranosyl), 1-(2′-Fluoro-β-<scp>d</scp>-xylofuranosyl), 1-(3′-Fluoro-β-<scp>d</scp>-arabinofuranosyl), and 2′-Fluoro-2′,3′-didehydro-2′,3′-dideoxyribose Pyrimidine Nucleoside Analogues against Duck Hepatitis B Virus (DHBV) and Human Hepatitis B Virus (HBV) Replication
  作者：Naveen C. Srivastav、Neeraj Shakya、Michelle Mak、Babita Agrawal、D. Lorne Tyrrell、Rakesh Kumar

  DOI：10.1021/jm100803c

  日期：2010.10.14

  3′-fluoroarabinofuranosyl, and 2′-fluoro-2′,3′-didehydro-2′,3′-dideoxyribose pyrimidine nucleoside analogues for antiviral activities against hepatitis B virus. Among the compounds examined, 1-(2-deoxy-β-d-lyxofuranosyl)thymine (23), 1-(2-deoxy-β-d-lyxofuranosyl)-5-trifluoromethyluracil (25), 1-(2-deoxy-2-fluoro-β-d-xylofuranosyl)uracil (38), 1-(2-deoxy-2-fluoro-β-d-xylofuranosyl)thymine (39), 2′,3′-dideoxy-2′,3′-d

  尽管存在成功的疫苗和抗病毒疗法，但乙型肝炎病毒（HBV）的感染仍然是急性和慢性肝病以及高死亡率的全球主要原因。我们合成并评估了几种lyxofuranosyl，2'-fluorooxylofuranosyl，3'-fluoroarabinofuranosyl和2'-fluoro-2'，3'-didehydro-2'，3'-dideoxyribose嘧啶核苷类似物对乙型肝炎病毒的抗病毒活性。在所检查的化合物中，1-（2-脱氧-β - d-呋喃呋喃糖基）胸腺嘧啶（23），1-（2-脱氧-β - d-呋喃呋喃糖基）-5-三氟甲基尿嘧啶（25），1-（2-脱氧-2-氟-β - d-木呋喃糖基）尿嘧啶（38），1-（2-脱氧-2-氟-β- d-二呋喃呋喃糖基）胸腺嘧啶（39），2'，3'-二脱氧-2'，3'-二脱氢-2'-氟胸苷（48）和2'，3'-二脱氧-2'，3'-二脱氢-2在原代鸭肝细胞中发现'
• Method for sequencing DNA and RNA by synthesis
  申请人：——

  公开号：US07544794B1

  公开（公告）日：2009-06-09

  This invention relates to the field of nucleic acid chemistry, more specifically to the field of compositions and processes that are nucleic acid analogs. More specifically, this invention relates to compositions that allow the sequencing of oligonucleotides by synthesis, and processes for sequencing by synthesis that exploit these compositions. Most specifically, the instant invention discloses compositions of matter that are 5′-triphosphates of ribo- and 2′-deoxyribonucleosides wherein the 3′-OH group is replaced by a 3′-ONHR group in the alpha configuration, wherein R is either a H or CH3 group. Also disclosed are these triphosphates where the nucleobase carries, via a linker, a reporter groups, such as a fluorescent species that can be used in single- or multi-copy DNA sequencing, or a tag that can be visualized by ultramicroscopy. Also disclosed are processes that use these compositions to do sequencing by synthesis.

  这项发明涉及核酸化学领域，更具体地涉及核酸类似物的组合物和过程领域。更具体地说，这项发明涉及一种允许通过合成测序寡核苷酸的组合物，以及利用这些组合物进行合成测序的过程。最具体地，本发明揭示了一种物质组合物，其中为核糖核苷酸和2'-脱氧核糖核苷酸的5'-三磷酸，其中3'-OH基团被3'-ONHR基团取代，且R为H或CH3基团。还公开了这些三磷酸，其中核碱基通过连接物携带报告基团，例如可用于单拷贝或多拷贝DNA测序的荧光物种，或者可通过超微显微镜可视化的标签。还公开了利用这些组合物进行合成测序的过程。
• Optimized synthesis of 3′-<i>O</i>-aminothymidine and evaluation of its oxime derivative as an anti-HIV agent
  作者：Pavel N. Solyev、Maxim V. Jasko、Tatiana A. Martynova、Ludmila B. Kalnina、Dmitry N. Nosik、Marina K. Kukhanova

  DOI：10.1515/hc-2015-0150

  日期：2015.10.1

  The synthesis and isolation of 3′-O-aminothymidine oximes have been optimized. Synthesized compounds were characterized by NMR and UV spectral and analytical data. A mixture of previously not reported syn and anti isomers of acetaldoximes was assessed for anti-HIV activity and the prevention of syncytia formation caused by HIV-1 infection.

  摘要：优化了3'-氨基胸苷肟的合成和分离。合成的化合物通过核磁共振和紫外光谱以及分析数据进行了表征。对以前未报道的乙醛肟的syn和anti异构体混合物进行了评估，以了解其抗HIV活性和预防HIV-1感染引起的合胞体形成。
• Synthesis of an oxyamide linked nucleotide dimer and incorporation into antisense oligonucleotide sequences
  作者：Kevin Burgess、Richard A. Gibbs、Michael L. Metzker、Ramesh Raghavachari

  DOI：10.1039/c39940000915

  日期：——

  Two derivatives of thymidine, a 5′-protected 3-hydroxylamine and 5′-carboxy-3′-protected compound, were prepared and coupled to form an oxyamide-linked dinucleotide analogue; this dimer was incorporated into an oligodeoxynucleotide then shown to anneal to complementary DNA with nearly the same affinity as the natural sequence.

  两种胸苷的衍生物，5′-保护的3-羟胺和5′-羧基-3′-保护化合物，被制备并连接形成一个含有氧酰胺键的二核苷酸类似物；该二聚体被纳入一个寡脱氧核糖核酸中，随后显示出与自然序列具有几乎相同的结合亲和力，能够与互补DNA退火。