tert-butyl 2-[[4-(1,3-dioxoisoindol-2-yl)butyl-[(8S)-5,6,7,8-tetrahydroquinolin-8-yl]amino]methyl]benzimidazole-1-carboxylate | 1044264-94-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 异吲哚及其衍生物
• 英文名称: tert-butyl 2-[[4-(1,3-dioxoisoindol-2-yl)butyl-[(8S)-5,6,7,8-tetrahydroquinolin-8-yl]amino]methyl]benzimidazole-1-carboxylate
• CAS: 1044264-94-9
• 化学式: C₃₄H₃₇N₅O₄
• 分子量: 579.699
• InChiKey: ODXJNZHCGMWNKI-NDEPHWFRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.2
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  97.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl 2-[[4-(1,3-dioxoisoindol-2-yl)butyl-[(8S)-5,6,7,8-tetrahydroquinolin-8-yl]amino]methyl]benzimidazole-1-carboxylate 在 肼 作用下， 以 乙醇 、 水 为溶剂， 以84 %的产率得到N’-(1H-苯并咪唑-2-甲基)-N’-((S)-5,6,7,8-四氢喹啉-8-基)丁烷-1,4-二胺
  参考文献：
  名称：

  CXCR4 趋化因子受体的小分子荧光配体

  摘要：

  C–X–C 趋化因子受体 4 型或 CXCR4 是一种趋化因子受体，被发现可促进各种癌细胞类型的癌症进展和转移。为了研究这种受体的药理学，并进一步阐明它在癌症中的作用，需要新的化学工具。在本研究中，使用经典的药物化学方法，基于先前报道的小分子拮抗剂设计并合成了基于小分子的荧光探针。在这里，我们报告了三种不同化学类别的荧光探针的开发，这些荧光探针在基于荧光的新型 NanoBRET 结合测定中显示出与 CXCR4 受体的特异性结合（p K D范围 6.6–7.1)。由于它们在 CXCR4 上保留了亲和力，我们进一步报告了它们在竞争结合实验和共聚焦显微镜中的用途，以研究该受体的药理学和细胞分布。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.3c00151
• 作为产物：
  描述：

  4-(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)丁酰氯 在 2,6-二甲基吡啶 、 sodium tetrahydroborate 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 potassium carbonate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 potassium iodide 、 zinc(II) chloride 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙腈 为溶剂， -20.0~50.0 ℃ 、103.42 kPa 条件下， 反应 13.0h， 生成 tert-butyl 2-[[4-(1,3-dioxoisoindol-2-yl)butyl-[(8S)-5,6,7,8-tetrahydroquinolin-8-yl]amino]methyl]benzimidazole-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  CXCR4趋化因子受体拮抗剂AMD070：实用的大规模实验室合成

  摘要：

  已经开发了一种有效且收敛的四步合成路线，可合成CXCR4趋化因子受体拮抗剂AMD070（1），在整个序列中仅使用一个色谱步骤。已经开发了用于2和3的偶联的新型还原胺化方法，其中脱水亚胺的形成随后是用减毒的硼氢化物试剂（氯化锌和硼氢化钠）还原。采用选择性提取方法纯化合成中间体并去除试剂和杂质。的过程也被开发以隔离1在纯结晶形式。

  DOI：

  10.1021/op8000993

文献信息

• Chemokine combinations to mobilize progenitor/stem cells
  申请人：Bridger J. Gary

  公开号：US20060035829A1

  公开（公告）日：2006-02-16

  Methods to elevate progenitor and stem cell counts in animal subjects using compounds which bind to the chemokine receptor CXCR4 in combination with the CXCR2 chemokine GROβ, including its modified forms, are disclosed.

  使用与趋化因子受体CXCR4结合的化合物与CXCR2趋化因子GROβ及其改良形式结合，揭示了提高动物主体中祖细胞和干细胞数量的方法。
• Process for the synthesis of CXCR4 antagonist
  申请人：Crawford B. Jason

  公开号：US20050209277A1

  公开（公告）日：2005-09-22

  This invention relates to a process for synthesizing heterocyclic pharmaceutical compound which binds to the CXCR4 chemokine receptor. In one embodiment, the process comprises: a) reacting a 5,6,7,8-tetrahydroquinolinylamine and an alkyl aldehyde bearing a phthalimide or a di-tertiary-butoxycarbonyl (di-BOC) protecting group to form an imine; b) reducing the imine to form a secondary amine; c) reacting the secondary amine with a haloalkyl substituted heterocyclic compound, to form a phthalimido-protected or di-tert-butoxycarbonyl protected tertiary amine; and d) hydrolyzing the protected amine to obtain a compound having Formula I′

  本发明涉及一种合成与CXCR4趋化因子受体结合的杂环药物化合物的方法。在一种实施方式中，该方法包括：a）反应5,6,7,8-四氢喹啉基胺和带有邻苯二甲酰亚胺或双叔丁基氧羰基（双-BOC）保护基的烷基醛，形成亚胺；b）还原亚胺，形成二级胺；c）将二级胺与卤代烷基取代的杂环化合物反应，形成邻苯二甲酰亚胺保护或双叔丁基氧羰基保护的三级胺；d）水解保护胺，得到具有I'式的化合物。
• US7332605B2
  申请人：——

  公开号：US7332605B2

  公开（公告）日：2008-02-19
• AMD070, a CXCR4 Chemokine Receptor Antagonist: Practical Large-Scale Laboratory Synthesis
  作者：Jason B. Crawford、Gang Chen、David Gauthier、Trevor Wilson、Bryon Carpenter、Ian R. Baird、Ernie McEachern、Alan Kaller、Curtis Harwig、Bem Atsma、Renato T. Skerlj、Gary J. Bridger

  DOI：10.1021/op8000993

  日期：2008.9.19

  An efficient and convergent four-step synthetic route to the CXCR4 chemokine receptor antagonist AMD070 (1) has been developed which employs only a single chromatographic step in the entire sequence. Novel reductive amination methods have been developed for the coupling of 2 and 3 in which a dehydrative imine formation is followed by reduction with an attenuated borohydride reagent (zinc chloride and

  已经开发了一种有效且收敛的四步合成路线，可合成CXCR4趋化因子受体拮抗剂AMD070（1），在整个序列中仅使用一个色谱步骤。已经开发了用于2和3的偶联的新型还原胺化方法，其中脱水亚胺的形成随后是用减毒的硼氢化物试剂（氯化锌和硼氢化钠）还原。采用选择性提取方法纯化合成中间体并去除试剂和杂质。的过程也被开发以隔离1在纯结晶形式。
• Small-Molecule Fluorescent Ligands for the CXCR4 Chemokine Receptor
  作者：Sebastian Dekkers、Birgit Caspar、Joëlle Goulding、Nicholas D. Kindon、Laura E. Kilpatrick、Leigh A. Stoddart、Stephen J. Briddon、Barrie Kellam、Stephen J. Hill、Michael J. Stocks

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.3c00151

  日期：——

  The C–X–C chemokine receptor type 4, or CXCR4, is a chemokine receptor found to promote cancer progression and metastasis of various cancer cell types. To investigate the pharmacology of this receptor, and to further elucidate its role in cancer, novel chemical tools are a necessity. In the present study, using classic medicinal chemistry approaches, small-molecule-based fluorescent probes were designed

  C–X–C 趋化因子受体 4 型或 CXCR4 是一种趋化因子受体，被发现可促进各种癌细胞类型的癌症进展和转移。为了研究这种受体的药理学，并进一步阐明它在癌症中的作用，需要新的化学工具。在本研究中，使用经典的药物化学方法，基于先前报道的小分子拮抗剂设计并合成了基于小分子的荧光探针。在这里，我们报告了三种不同化学类别的荧光探针的开发，这些荧光探针在基于荧光的新型 NanoBRET 结合测定中显示出与 CXCR4 受体的特异性结合（p K D范围 6.6–7.1)。由于它们在 CXCR4 上保留了亲和力，我们进一步报告了它们在竞争结合实验和共聚焦显微镜中的用途，以研究该受体的药理学和细胞分布。