5'-O-dimethoxytritylthymidylyl-(3',5')-(o-chlorophenyl)-thymidylyl-3'-(o-chlorophenyl)phosphate | 85240-04-6

• 分子结构分类: 有机化合物
• 英文名称: 5'-O-dimethoxytritylthymidylyl-(3',5')-(o-chlorophenyl)-thymidylyl-3'-(o-chlorophenyl)phosphate
• CAS: 85240-04-6
• 化学式: C₅₃H₅₂Cl₂N₄O₁₇P₂
• 分子量: 1149.87
• InChiKey: AHEWSJWNCMETNL-LPGWDLSUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.76
• 重原子数：
  78.0
• 可旋转键数：
  21.0
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  256.39
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  18.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-dimethoxytritylthymidylyl-(3',5')-(o-chlorophenyl)-thymidylyl-3'-(o-chlorophenyl)phosphate 、 2-Desoxy-β-D-ribofuranosyl-2(1H)-pyrimidinon-3'-<(2-chlorophenyl)-(2-cyanoaethyl)-phosphat> 在 吡啶 、 1-(2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl)-3-nitro-1,2,4-triazole 作用下， 反应 0.67h， 生成
  参考文献：
  名称：

  核苷和核苷酸。Teil 22.合成烯类十三烷十二烷基磷酸酯，未知碱基2（1 H）-嘧啶酮†

  摘要：

  核苷和核苷酸。第22部分。包含非天然碱2（1 H）-嘧啶酮的十三碳十二烷基核苷十二磷酸的合成

  DOI：

  10.1002/hlca.19850680221
• 作为产物：
  描述：

  保护胸苷 在 N-甲基咪唑 1-(2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl)-3-nitro-1,2,4-triazole 、 三乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 吡啶 为溶剂， 反应 13.5h， 生成 5'-O-dimethoxytritylthymidylyl-(3',5')-(o-chlorophenyl)-thymidylyl-3'-(o-chlorophenyl)phosphate
  参考文献：
  名称：

  四个十氧代核糖核苷酸的简化液相制备及其初步光谱表征

  摘要：

  dApTpApTpApTpApTpApT，dApTpApTpCpGpApTpApT和dApApApApApApApApApTpTpTly化学合成了四个自互补的十氧杂核糖核苷酸dApTpApTpApTpApTpApT，dApTpApTpCpGpCpApTpApTply。努力集中于使过程尽可能简单，同时在该过程的每个步骤中获得高纯度的产品。根据以下方案，从3'-末端以3'- O-苯甲酰化的单体开始精加工十聚体：单体+单体二聚体+二聚体四聚体+二聚六聚体+四聚体十聚体。中间体和完全封闭的十聚体的纯度通过色谱法和300MHz 1 HN M R.光谱法进行监测。解封闭的十氧杂核糖核苷酸的特征在于它们的UV，CD和1 HNMR。光谱。

  DOI：

  10.1002/hlca.19820650803

文献信息

• Deoxyribonucleic acids and related compounds. XII. Polymer support synthesis of a 46-mer duplex containing the promoter of galactose operon of Escherichia coli.
  作者：EIKO OHTSUKA、TADAAKI OHGI、KATSUHIKO KITANO、TOSHIKAZU FUKUI、MORIO IKEHARA

  DOI：10.1248/cpb.33.1849

  日期：——

  A deoxyribonucleic acid (DNA) duplex with a chain length of 46 which contain binding sites for catabolite gene activator protein and ribonucleic acid (RNA) polymerase was synthesized by the solid-phase phosphotriester method, involving condensation of tetramer or pentamer blocks. Eleven oligonucleotide blocks were used to elongate each chain, beginning from polystyrene-linked N-protected 3'-succinyldeoxynucleoside. The estimated overall yields of upper and lower chains were 18% and 17%, respectively. The products were purified by reversed phase chromatography and characterized by sequence analysis using the Maxam-Gilbert method.

  一种链长为46的脱氧核糖核酸（DNA）双链被合成，具有用于代谢基因激活蛋白和 RNA 聚合酶的结合位点，采用固相磷三酯法合成，涉及四聚体或五聚体片段的缩合。使用了十一种寡核苷酸片段来延长每条链，从聚苯乙烯连接的 N 保护的 3'-琥珀酰脱氧核苷开始。上链和下链的总体产率分别为18%和17%。产品通过反相色谱纯化，并通过 Maxam-Gilbert 方法进行序列分析以进行表征。
• Efficient and flexible access to fully protected trinucleotides suitable for DNA synthesis by automated phosphoramidite chemistry
  作者：Andrea Zehl、Antje Starke、Dieter Cech、Thomas Hartsch、Rainer Merkl、Hans-Joachim Fritz

  DOI：10.1039/cc9960002677

  日期：——

  An efficient synthetic approach to protected trinuclotide phosphoramidites suitable for codon-by-codon synthesis of structural gene combinatorial libraries is described; the procedure rests on the use of pair of orthogonal protecting groups for the two oligomer termini and offers flexibility in the choice of chain elongation direction going from dimer to trimer.

  本文介绍了一种高效的三核苷酸磷酰胺保护合成方法，适用于逐个密码子合成结构基因组合文库；该方法的基础是在两个寡聚体末端使用一对正交的保护基团，并可灵活选择从二聚体到三聚体的链延伸方向。
• Nakahara, Yoshiaki; Ogawa, Tomoya, Agricultural and Biological Chemistry, 1985, vol. 49, # 10, p. 2999 - 3004
  作者：Nakahara, Yoshiaki、Ogawa, Tomoya

  DOI：——

  日期：——