红外 (IR) 光谱已经为淀粉样蛋白原纤维的结构、动力学和形成机制提供了相当多的见解。红外探针,如主链 13C=18O,已被广泛用于获取位点特异性结构信息,但只能探测二级结构和链间排列。很少有非微扰 IR 探针可用于报告侧链构象和环境,这对于确定淀粉样蛋白内空间拉链中的片对片排列至关重要。极性残基,如谷
氨酰胺,对淀粉样蛋白的稳定性有显着贡献,因此经常出现在淀粉样肽/蛋白质的核心区域。此外,聚谷
氨酰胺 (polyQ) 重复在几种神经退行性疾病中形成有毒聚集体。在这里,我们报告了一种新的非微扰红外探针 - 谷
氨酰胺侧链 13C=18O 的合成和应用。我们使用侧链 13C=18O 标记和同位素稀释来检测淀粉样蛋白形成肽中分子间氢键结合的谷
氨酰胺侧链阵列(Gln 阶梯)的存在。此外,13C=18O 峰的线宽对其局部
水化环境高度敏感。来自侧链标记的 IR 数据使我们能够明确地确定形成淀粉样蛋白的短肽