此处描述了修饰的
胞苷类似物的合成和光谱性质。为了赋予荧光特性,
胞苷荧光团在
胞嘧啶5位上通过肉桂基部分扩展(类似物1a – c),或在苯基
咪唑环上扩展(类似物3a – d)。这些化合物分别通过Suzuki-Miyaura偶联反应和5-
氨基
胞苷与对位取代的
苯甲醛的缩合反应合成。所有的类似物在蓝色区域为荧光(λ
EM:402-436纳米)。在上述类似物中,对-CF 3-苯基-
咪唑并
胞苷3d被发现是一种很有前途的荧光探针,其量子产率比
胞苷大7000倍(Φ = 0.617),并且红移约为。最大发射108 nm(411 nm)。其保留的Watson-Crick氢键键合面使3d可以与
鸟苷特异性碱基配对,类似于
胞苷。另外,苯基-
咪唑并
胞苷类似物优选反构象和C 3'-内切(N)糖折叠。这些特性使3d成为吸引人的荧光探针,可潜在地用于核酸
化学的各个方面。