通过基于结构的从头设计,开发了一种新型的,高达单个数微摩尔活性(IC 50值)的疟疾
天冬氨酸蛋白酶-纤溶酶II(PMII)的非肽类
抑制剂。设计中使用的活性部位基质基于PMII的X射线晶体结构,在4-芳基
哌啶络合后,肾素结构上看到的主要构象变化–包括解锁新的疏
水性(瓣)口袋–被建模。成熟的肾素和PMII之间35%的序列同一性促使我们假设,如在肾素中观察到的,围绕活性位点的诱导适应适应在PMII中也可能有效。新的
抑制剂含有一个中心的11-氮杂
三环[6.2.1.0 2,7] undeca-2(7),3,5-
三烯核,质子化形式,与两个PMII活性位点的催化Asp残基进行离子H键合(图1和2)。通过活化的
吡咯和就地产生的苯并species物质之间的狄尔斯-阿尔德反应,可以容易地制备该
三环支架(方案1)。两个与
萘基或1,3-
苯并噻唑基部分取代基连接到中央芯体(方案1 - 4),用于容纳在疏
水襟翼和S1