N-芴甲氧羰基-N'-苄氧羰基-L-2,4-二氨基丁酸 | 252049-08-4

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物 - 其他氨基酸衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: N-芴甲氧羰基-N'-苄氧羰基-L-2,4-二氨基丁酸
• 中文别名: N-芴甲氧羰基-N’-苄氧羰基-L-2,4-二氨基丁酸；Fmoc-Dab(Z)-OH
• 英文名称: (2S)-4-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-({[(9H-fluoren-9-yl)methoxy]carbonyl}amino)butanoic acid
• 英文别名: Fmoc-Dab(Cbz)-OH；Fmoc-L-Dab(Z)-OH；(2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-4-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoic acid
• CAS: 252049-08-4
• 化学式: C₂₇H₂₆N₂O₆
• 分子量: 474.513
• InChiKey: VHBSCTCUNZLWCT-DEOSSOPVSA-N

物化性质

• 熔点：
  118 °C
• 沸点：
  739.8±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.299±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.3
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  114
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335
• 储存条件：
  2-8°C

制备方法与用途

N-芴甲氧羰基-N'-苄氧 Carbonyl-L-2,4-二氨基丁酸是一种氨基酸类衍生物，常用于制备医药中间体。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-芴甲氧羰基-N'-苄氧羰基-L-2,4-二氨基丁酸 在 吡啶 、 二乙胺基三氟化硫 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.33h， 生成 Fmoc-Dab(Z)-F
  参考文献：
  名称：

  使用串联天然化学连接/脱硫反应化学合成强效抗菌肽 Murepavadin

  摘要：

  用于多肽骨架环化的经典方法需要在环化反应的活化步骤期间可能损害 C 末端残基手性的条件。在这里，我们描述了一种有效的无差向异构化方法，用于使用分子内天然化学连接结合伴随的脱硫反应来合成基于 Fmoc 的 murepavadin。使用这种方法，生物活性 murepavadin 分两步以高产率生产。合成的肽类抗生素对不同的临床铜绿假单胞菌分离株显示出有效的活性。这种方法可以很容易地用于生产 murepavadin 类似物和其他骨架环化肽。

  DOI：

  10.1021/acs.joc.1c01858
• 作为产物：
  描述：

  N^α-Fmoc-Glu-5-oxazolidinone 在 N-甲基吗啉 、 lithium hydroxide 、 sodium azide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲苯 为溶剂， 反应 0.75h， 生成 N-芴甲氧羰基-N'-苄氧羰基-L-2,4-二氨基丁酸
  参考文献：
  名称：

  Practical and Efficient Synthesis of Orthogonally Protected α‐2,3‐Diaminopropionic Acid (2,3‐Dap), 2,4‐Diaminobutanoic Acid (2,4‐Dab), and their N‐Methylated Derivatives

  摘要：

  DOI：

  10.1080/00397910600772827

文献信息

• Polymyxin B₃–Tobramycin Hybrids with <i>Pseudomonas aeruginosa</i>-Selective Antibacterial Activity and Strong Potentiation of Rifampicin, Minocycline, and Vancomycin
  作者：Ronald Domalaon、Xuan Yang、Yinfeng Lyu、George G. Zhanel、Frank Schweizer

  DOI：10.1021/acsinfecdis.7b00145

  日期：2017.12.8

  need to develop novel antibacterial agents able to eradicate drug-resistant Gram-negative pathogens such as Pseudomonas aeruginosa. Antimicrobial hybrids have emerged as a promising strategy to combat bacterial resistance, as a stand-alone drug but also as an adjuvant in combination with existing antibiotics. Herein, we report for the first time the synthesis and biological evaluation of polymyxin-aminoglycoside

  迫切需要开发能够根除铜绿假单胞菌等耐药革兰氏阴性病原体的新型抗菌剂。抗菌杂种已成为对抗细菌耐药性的一种有前途的策略，既可以作为独立药物使用，也可以作为佐剂与现有抗生素结合使用。在此，我们首次报道了由多粘菌素B 3经由脂族烃接头与妥布霉素共价连接的多粘菌素B 3组成的多粘菌素-氨基糖苷异二聚体的合成和生物学评估。多粘菌素B 3-妥布霉素杂种显示出对碳青霉烯耐药性以及对多种药物或广泛耐药性（MDR / XDR）的铜绿假单胞菌有效的活性临床分离株。此外，最有效的杂种能够与目前使用的针对野生型和MDR / XDR铜绿假单胞菌的抗生素协同作用，而且还针对鲍曼不动杆菌。本文所述的有前途的生物活性值得对能够克服抗药性问题的新型抗微生物杂种进行设计和开发的进一步研究。
• Discovery of Diphenyloxazole and Nδ-Z-Ornithine Derivatives as Highly Potent and Selective Human Prostaglandin EP₄ Receptor Antagonists
  作者：Kouji Hattori、Akira Tanaka、Naoaki Fujii、Hisashi Takasugi、Yoshiyuki Tenda、Masayuki Tomita、Shoko Nakazato、Keiko Nakano、Yasuko Kato、Yutaka Kono、Hidetsugu Murai、Kazuo Sakane

  DOI：10.1021/jm050085k

  日期：2005.5.1

  Two novel classes of diphenyloxazole and Ndelta-Z-ornithine derivatives as highly potent and selective EP(4) antagonists have been discovered. The optimized diphenyloxzole 8 and Ndelta-Z-ornithine 11 effectively competed with [(3)H]PGE(2) binding to human recombinant EP(4), with K(i) values of 0.30 nM and 0.91 nM, respectively, and were selective for all members of the human prostanoid receptor family

  已发现两类新型的二苯基恶唑和Ndelta-Z-鸟氨酸衍生物作为高效和选择性的EP（4）拮抗剂。优化的二苯并恶唑8和Ndelta-Z-鸟氨酸11有效竞争与[（3）H] PGE（2）绑定到人类重组EP（4），K（i）值分别为0.30 nM和0.91 nM，分别为对人类前列腺素受体家族的所有成员具有选择性。8已显示在大鼠和狗中表现出良好的药代动力学特性，并且对体外PGE（2）促进的IgE合成具有强大的抑制活性。
• Influence of Lipophilicity on the Antibacterial Activity of Polymyxin Derivatives and on Their Ability to Act as Potentiators of Rifampicin
  作者：Pamela Brown、Omar Abdulle、Steven Boakes、Naomi Divall、Esther Duperchy、Sonia Ganeshwaran、Roy Lester、Stephen Moss、Dean Rivers、Mona Simonovic、Jaspal Singh、Steven Stanway、Antoinette Wilson、Michael J. Dawson

  DOI：10.1021/acsinfecdis.0c00917

  日期：2021.4.9

  systematic investigation of the influence of lipophilicity on microbiological activity (including against strains with reduced susceptibility to polymyxins), potentiation of rifampicin, and in vitro toxicity within a series of next-generation polymyxin nonapeptides. We demonstrate that the lipophilicity at the N-terminus and amino acids 6 and 7 in the cyclic peptide core is interchangeable and that the activity

  新型多粘菌素衍生物通常被归类为对革兰氏阴性病原体具有直接活性或作为本身无活性的化合物，其通过外膜的透化作用充当其他抗生素的增效剂。在这里，我们报告了亲脂性对微生物活性（包括对多粘菌素敏感性降低的菌株）、利福平增强作用和体外影响的系统研究一系列下一代多粘菌素九肽的毒性。我们证明了 N 末端的亲脂性以及环肽核心中的氨基酸 6 和 7 是可互换的，并且活性、增强能力和细胞毒性似乎都主要由整体亲脂性驱动。我们的工作还表明，多粘菌素分子作为直接作用化合物或增效剂的表征更多地是受亲脂性强烈影响的连续体，而不是根本不同的作用模式的结果。
• Parallel imaging of coagulation pathway proteases activated protein C, thrombin, and factor Xa in human plasma
  作者：Sylwia Modrzycka、Sonia Kołt、Stéphanie G. I. Polderdijk、Ty E. Adams、Stanisław Potoczek、James A. Huntington、Paulina Kasperkiewicz、Marcin Drąg

  DOI：10.1039/d2sc01108e

  日期：——

  Activated protein C (APC), thrombin, and factor (f) Xa are vitamin K-dependent serine proteases that are key factors in blood coagulation. Moreover, they play important roles in inflammation, apoptosis, fibrosis, angiogenesis, and viral infections. Abnormal activity of these coagulation factors has been related to multiple conditions, such as bleeding and thrombosis, Alzheimer's disease, sepsis, multiple

  活化蛋白 C (APC)、凝血酶和因子 (f) Xa 是维生素 K 依赖性丝氨酸蛋白酶，它们是血液凝固的关键因素。此外，它们在炎症、细胞凋亡、纤维化、血管生成和病毒感染中发挥重要作用。这些凝血因子的异常活动与多种疾病有关，例如出血和血栓形成、阿尔茨海默病、败血症、多发性硬化症和 COVID-19。APC、凝血酶和 fXa 在凝血和各种疾病中的个体活性很难确定，因为这些蛋白酶是相关的并且具有相似的底物偏好。所以，开发能够成像和区分生物样品中凝血因子的选择性化学工具可以更好地了解它们在各种条件下的作用，并可能有助于建立新的诊断测试。在我们的研究中，我们使用了大量非天然氨基酸，这使我们能够广泛探索酶活性位点的结合口袋。基于获得的特异性谱，我们设计了高选择性底物、抑制剂和基于荧光活性的探针 (ABP)，用于快速、直接和同时检测人血浆中的 APC、凝血酶和 fXa。这使我们能够广泛探索酶活性位点的结
• Spiroligomer‐Based Macrocycles for Atomically Precise Membranes
  作者：Yihui Xie、Danni Luo、Jesse A. Wiener、Alexander B. Koval、Conrad T. Pfeiffer、Christian E. Schafmeister

  DOI：10.1002/anie.202302809

  日期：2023.7.3

  Here, we report a new class of peptidomimetic macrocycles with well‐defined three‐dimensional structures and low conformational flexibility. They are assembled from fused‐ring spiro‐ladder oligomers (spiroligomers) by modular solid‐phase synthesis. Two‐dimensional nuclear magnetic resonance confirms their shape persistency. Triangular macrocycles of tunable sizes assemble into membranes with atomically precise pores, which exhibit size and shape‐dependent molecular sieving towards a series of structurally similar compounds. The exceptional structural diversity and stability of spiroligomer‐based macrocycles will be explored for more applications.

  摘要我们在此报告了一类新的拟肽大环，它们具有明确的三维结构和较低的构象灵活性。它们是通过模块化固相合成法由融合环螺梯形低聚物（螺梯形低聚物）组装而成的。二维核磁共振证实了它们的形状持久性。尺寸可调的三角形大环组装成具有原子精度孔隙的膜，对一系列结构相似的化合物表现出与尺寸和形状相关的分子筛分作用。我们将探索基于螺配体的大环的特殊结构多样性和稳定性，使其应用于更多领域。