N4-[α-D-mannopyranosyl-(1->3)-[α-D-mannopyranosyl-(1->6)]-β-D-mannopyranosyl-(1->4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl-(1->4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl]-N2-(benzyloxycarbonyl)-L-asparagine methyl ester | 1065009-02-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: N4-[α-D-mannopyranosyl-(1->3)-[α-D-mannopyranosyl-(1->6)]-β-D-mannopyranosyl-(1->4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl-(1->4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl]-N2-(benzyloxycarbonyl)-L-asparagine methyl ester
• 英文别名: N4-α-D-mannopyranosyl-(1->3)-[α-D-mannopyranosyl-(1->6)]-β-D-mannopyranosyl-(1->4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl-(1->4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl-N2-(benzyloxycarbonyl)-L-aspargine methyl ester；methyl (2S)-4-[[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-5-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-5-[(2S,3S,4S,5R,6R)-3,5-dihydroxy-4-[(2S,3S,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-6-[[(2S,3S,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxymethyl]oxan-2-yl]oxy-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]amino]-4-oxo-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoate
• CAS: 1065009-02-0
• 化学式: C₄₇H₇₂N₄O₃₀
• 分子量: 1173.1
• InChiKey: KIYZMXPUJCFVHK-SZBPMPRASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -9.5
• 重原子数：
  81
• 可旋转键数：
  24
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.77
• 拓扑面积：
  518
• 氢给体数：
  18
• 氢受体数：
  30

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  O-[(α-D-mannopyranosyl)-(1->6)-(α-D-mannopyranosyl)-(1->3)-β-D-mannopyranosyl]-(1->4)-(1,2-dideoxy-α-D-glucopyrano)-[2,1-d]-2-methyloxazoline 、 Nα-(benzyloxycarbonyl)-Nγ-(2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-L-asparagine O-methyl ester 在 Arthrobacter protophormiae endohexosaminidase A E₁₇₃Q mutant 作用下， 以 sodium phosphate buffer 、 水 、 丙酮 为溶剂， 反应 0.83h， 以100%的产率得到N4-[α-D-mannopyranosyl-(1->3)-[α-D-mannopyranosyl-(1->6)]-β-D-mannopyranosyl-(1->4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl-(1->4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl]-N2-(benzyloxycarbonyl)-L-asparagine methyl ester
  参考文献：
  名称：

  内异戊酰胺酶与恶唑啉供体的糖基化作用：有机助溶剂和pH对Endo A和Endo M催化的反应的影响

  摘要：

  随着两个反应参数的变化，研究了以N-聚糖恶唑啉为供体的内己糖胺酶催化的糖基化反应的合成效率。发现添加一定量的有机助溶剂和调节反应pH在6.5至8.0之间对Endo A（和两个可用的突变体）或Endo M催化的反应具有不同的影响，表明这两个家族之间存在细微的差异。 GH85酶。通过调节竞争性水解过程的速率，对反应pH值进行微调，或添加一定数量的有机助溶剂，可实现的合成效率得到有益的提高。

  DOI：

  10.1016/j.carres.2009.09.013

文献信息

• Endohexosaminidase-Catalysed Glycosylation with Oxazoline Donors: Fine Tuning of Catalytic Efficiency and Reversibility
  作者：Thomas W. D. F. Rising、Christoph D. Heidecke、James W. B. Moir、Zhenlian Ling、Antony J. Fairbanks

  DOI：10.1002/chem.200800365

  日期：2008.7.18

  A complete series of oxazoline di-, tri-, tetra-, and hexasaccharides, corresponding to the core sections of N-linked glycoprotein high mannose glycans, together with the corresponding oligosaccharides containing a central glucose unit, were synthesised and tested as glycosyl donors for glycosylation of a GlcNAcAsn glycosyl amino acid catalysed by the endohexosaminidases M (Endo M), A (Endo A) and

  合成了一系列完整的恶唑啉二糖、三糖、四糖和六糖，对应于 N-连接糖蛋白高甘露糖聚糖的核心部分，以及相应的含有中心葡萄糖单元的寡糖，并作为糖基供体进行了测试。由内己糖胺酶 M (Endo M)、A (Endo A) 和 H (Endo H) 催化的 GlcNAcAsn 糖基氨基酸的糖基化。虽然 Endo H 没有催化任何糖基化反应，但 Endo M 和 Endo A 都有效地催化了糖基化，这些糖基化不仅限于包含 Manbeta(1-->4)GlcNAc 链接的供体。精确的结构活性关系和时间进程研究揭示了与所用酶和精确恶唑啉结构相关的合成过程效率的微调。Endo M 和 Endo A 均可实现有效的不可逆糖基化，进一步证明使用结构修饰的恶唑啉供体作为过渡态模拟物以促进酶催化合成，同时防止产物水解；在这些情况下，酶表现出“糖基连接酶”活性。
• Endohexosaminidase-catalysed glycosylation with oxazoline donors: effects of organic co-solvent and pH on reactions catalysed by Endo A and Endo M
  作者：Christoph D. Heidecke、Thomas B. Parsons、Antony J. Fairbanks

  DOI：10.1016/j.carres.2009.09.013

  日期：2009.12

  The synthetic efficiency of endohexosaminidase-catalysed glycosylation reactions using N-glycan oxazolines as donors was investigated as two reaction parameters were varied. Both the addition of quantities of an organic co-solvent and modulation of reaction pH between 6.5 and 8.0 were found to have different effects on reactions catalysed by either Endo A (and two available mutants) or Endo M, indicating

  随着两个反应参数的变化，研究了以N-聚糖恶唑啉为供体的内己糖胺酶催化的糖基化反应的合成效率。发现添加一定量的有机助溶剂和调节反应pH在6.5至8.0之间对Endo A（和两个可用的突变体）或Endo M催化的反应具有不同的影响，表明这两个家族之间存在细微的差异。 GH85酶。通过调节竞争性水解过程的速率，对反应pH值进行微调，或添加一定数量的有机助溶剂，可实现的合成效率得到有益的提高。
• Streptococcus pneumoniae endohexosaminidase D; feasibility of using N-glycan oxazoline donors for synthetic glycosylation of a GlcNAc-asparagine acceptor
  作者：Thomas B. Parsons、Mitul K. Patel、Alisdair B. Boraston、David J. Vocadlo、Antony J. Fairbanks

  DOI：10.1039/b926078a

  日期：——

  Endohexosaminidase D, a family 85 glycoside hydrolase from S. pneumoniae and the first endohexosaminidase to be discovered, is found to be capable of catalysing the glycosylation of a glycosyl amino acid bearing a GlcNAc residue using a variety of N-glycan oxazoline donors. Although enzyme-catalysed oxazoline hydrolysis is a significant competing reaction that is not countered by the addition of organic

  内切葡糖胺酶D是来自肺炎链球菌的85家族糖苷水解酶，并且是发现的第一个内切葡糖胺酶，能够使用多种N-聚糖恶唑啉供体催化带有GlcNAc残基的糖基氨基酸的糖基化。虽然是酶催化的恶唑啉 水解是一种重要的竞争性反应，不能通过添加有机助溶剂或改变反应pH来抵消，可以通过依次添加多当量的有机溶剂来实现高收率的合成工艺 恶唑啉供体，证明了该酶作为合成确定的糖缀合物的生物催化剂的合成潜力。值得注意的是，Endo-D在所用条件下似乎不水解所得产物。远藤D展示的合成活性表明，其他未经测试的家族GH85酶可能显示出相似的合成潜力。此外，由于Endo D能够裂解连接到单克隆抗体（mAbs）的N-聚糖，并且还能够裂解被核心岩藻糖基化的聚糖，因此Endo D作为有用的生物催化剂的发展，可能用于合成重要的定义均质复合糖缀合物未来的巨大潜力，但前提是直接恶唑啉 可以克服水解作用。