Discovery of Antibacterials That Inhibit Bacterial RNA Polymerase Interactions with Sigma Factors
作者:Jiqing Ye、Adrian Jun Chu、Rachel Harper、Shu Ting Chan、Tsun Lam Shek、Yufeng Zhang、Margaret Ip、Mariya Sambir、Irina Artsimovitch、Zhong Zuo、Xiao Yang、Cong Ma
DOI:10.1021/acs.jmedchem.0c00520
日期:2020.7.23
Formation of a bacterial RNA polymerase (RNAP) holoenzyme by a catalytic core RNAP and a sigma (σ) initiation factor is essential for bacterial viability. As the primary binding site for the housekeeping σ factors, the RNAP clamp helix domain represents an attractive target for novel antimicrobial agent discovery. Previously, we designed a pharmacophore model based on the essential amino acids of the
通过催化核心RNAP和σ(σ)起始因子形成细菌RNA聚合酶(RNAP)全酶对于细菌的生存能力至关重要。作为管家σ因子的主要结合位点,RNAP钳螺旋结构域代表了新型抗菌剂发现的诱人靶标。以前,我们基于钳形螺旋的必需氨基酸(例如R278,R281和I291(大肠杆菌编号))设计了药效团模型,并鉴定出具有抗微生物活性的命中化合物,这些化合物会干扰核心-σ相互作用。在这项工作中,我们合理地设计和合成了一种命中化合物的三芳基衍生物,并成功地大大提高了对肺炎链球菌的抗菌活性,最低抑菌浓度从256降至1μg/ mL。抗微生物活性,转录抑制,体外药理特性和优化化合物的细胞毒性的其他表征证明了其进一步开发的潜力。