methyl 4-(methyl(2-oxo-2-(phenylamino)ethyl)amino)butanoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl 4-(methyl(2-oxo-2-(phenylamino)ethyl)amino)butanoate
• 英文别名: Methyl 4-[(2-anilino-2-oxoethyl)-methylamino]butanoate
• 化学式: C₁₄H₂₀N₂O₃
• 分子量: 264.324
• InChiKey: BIBBRQPEBJZHBU-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.3
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  58.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 4-(methyl(2-oxo-2-(phenylamino)ethyl)amino)butanoate 在 potassium cyanide 、 羟胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 以73 %的产率得到N-hydroxy-4-(methyl(2-oxo-2-(phenylamino)ethyl)amino)butanamide
  参考文献：
  名称：

  Aza-SAHA 衍生物是选择性组蛋白脱乙酰酶 10 化学探针，可抑制多胺脱乙酰化和表型 HDAC10 敲除

  摘要：

  我们报告了第一个充分表征的组蛋白脱乙酰酶 10 (HDAC10) 选择性化学探针，与其他 HDAC 同工酶相比具有前所未有的选择性。HDAC10 使多胺去乙酰化并具有独特的底物特异性，使其在 11 种锌依赖性 HDAC 水解酶中独一无二。从 HDAC10 多胺底物中汲取灵感，我们系统地将一个氨基（“aza-scan”）插入到获批药物 Vorinostat (SAHA) 的己基连接部分中。这种单原子置换 (C→N) 将 SAHA 从非选择性泛 HDAC 抑制剂转化为特异性 HDAC10 抑制剂。aza-SAHA 结构的优化产生了 HDAC10 化学探针DKFZ-748, 具有通过细胞和生化目标参与以及热转移分析证明的效力和选择性。我们的 aza-SAHA 衍生物与 HDAC10 的共晶结构提供了效力的结构原理，并且化学蛋白质组学分析证实了DKFZ-748在 HDAC 药物靶标景观中具有出色的细胞

  DOI：

  10.1021/jacs.2c05030
• 作为产物：
  描述：

  甲醇 、 2-溴-N-苯乙酰胺 、 4-（甲胺）丁酸氢酯 在 potassium carbonate 、 盐酸 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以26 %的产率得到methyl 4-(methyl(2-oxo-2-(phenylamino)ethyl)amino)butanoate
  参考文献：
  名称：

  Aza-SAHA 衍生物是选择性组蛋白脱乙酰酶 10 化学探针，可抑制多胺脱乙酰化和表型 HDAC10 敲除

  摘要：

  我们报告了第一个充分表征的组蛋白脱乙酰酶 10 (HDAC10) 选择性化学探针，与其他 HDAC 同工酶相比具有前所未有的选择性。HDAC10 使多胺去乙酰化并具有独特的底物特异性，使其在 11 种锌依赖性 HDAC 水解酶中独一无二。从 HDAC10 多胺底物中汲取灵感，我们系统地将一个氨基（“aza-scan”）插入到获批药物 Vorinostat (SAHA) 的己基连接部分中。这种单原子置换 (C→N) 将 SAHA 从非选择性泛 HDAC 抑制剂转化为特异性 HDAC10 抑制剂。aza-SAHA 结构的优化产生了 HDAC10 化学探针DKFZ-748, 具有通过细胞和生化目标参与以及热转移分析证明的效力和选择性。我们的 aza-SAHA 衍生物与 HDAC10 的共晶结构提供了效力的结构原理，并且化学蛋白质组学分析证实了DKFZ-748在 HDAC 药物靶标景观中具有出色的细胞

  DOI：

  10.1021/jacs.2c05030

文献信息

• [EN] NOVEL INHIBITORS OF HISTONE DEACETYLASE 10<br/>[FR] NOUVEAUX INHIBITEURS DE L'HISTONE DÉSACÉTYLASE 10
  申请人：DEUTSCHES KREBSFORSCH

  公开号：WO2020193431A1

  公开（公告）日：2020-10-01

  The present invention relates to novel inhibitors of histone deacetylase 10 (HDAC10), novel pharmaceutical compositions comprising such inhibitors, and to novel methods of treating diseases, such as cancer, autoimmune disorders or neurodegeneration, using such novel inhibitors or methods of using such novel inhibitors in organ transplantation.

  本发明涉及新型组蛋白去乙酰化酶10（HDAC10）抑制剂，包括这种抑制剂的新型药物组合物，以及利用这种新型抑制剂治疗疾病（如癌症、自身免疫性疾病或神经退行性疾病）的新方法，或者利用这种新型抑制剂在器官移植中的使用方法。
• NOVEL INHIBITORS OF HISTONE DEACETYLASE 10
  申请人：Deutsches Krebsforschungszentrum

  公开号：EP3941900A1

  公开（公告）日：2022-01-26
• Aza-SAHA Derivatives Are Selective Histone Deacetylase 10 Chemical Probes That Inhibit Polyamine Deacetylation and Phenocopy HDAC10 Knockout
  作者：Raphael R. Steimbach、Corey J. Herbst-Gervasoni、Severin Lechner、Tracy Murray Stewart、Glynis Klinke、Johannes Ridinger、Magalie N. E. Géraldy、Gergely Tihanyi、Jackson R. Foley、Ulrike Uhrig、Bernhard Kuster、Gernot Poschet、Robert A. Casero、Guillaume Médard、Ina Oehme、David W. Christianson、Nikolas Gunkel、Aubry K. Miller

  DOI：10.1021/jacs.2c05030

  日期：2022.10.19

  transformed SAHA from an unselective pan-HDAC inhibitor into a specific HDAC10 inhibitor. Optimization of the aza-SAHA structure yielded the HDAC10 chemical probe DKFZ-748, with potency and selectivity demonstrated by cellular and biochemical target engagement, as well as thermal shift assays. Cocrystal structures of our aza-SAHA derivatives with HDAC10 provide a structural rationale for potency, and

  我们报告了第一个充分表征的组蛋白脱乙酰酶 10 (HDAC10) 选择性化学探针，与其他 HDAC 同工酶相比具有前所未有的选择性。HDAC10 使多胺去乙酰化并具有独特的底物特异性，使其在 11 种锌依赖性 HDAC 水解酶中独一无二。从 HDAC10 多胺底物中汲取灵感，我们系统地将一个氨基（“aza-scan”）插入到获批药物 Vorinostat (SAHA) 的己基连接部分中。这种单原子置换 (C→N) 将 SAHA 从非选择性泛 HDAC 抑制剂转化为特异性 HDAC10 抑制剂。aza-SAHA 结构的优化产生了 HDAC10 化学探针DKFZ-748, 具有通过细胞和生化目标参与以及热转移分析证明的效力和选择性。我们的 aza-SAHA 衍生物与 HDAC10 的共晶结构提供了效力的结构原理，并且化学蛋白质组学分析证实了DKFZ-748在 HDAC 药物靶标景观中具有出色的细胞