2-(2,4-dioxo-4,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-6-(hydroxymethyl)morpholine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 2-(2,4-dioxo-4,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-6-(hydroxymethyl)morpholine
• 英文别名: 1-(6-(hydroxymethyl)morpholin-2-yl)uracil；1-((2R,6S)-6-(hydroxymethyl)morpholin-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione；1-[(2R,6S)-6-(hydroxymethyl)morpholin-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• 化学式: C₉H₁₃N₃O₄
• 分子量: 227.22
• InChiKey: IDNAQZWHCIFRFA-POYBYMJQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  90.9
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(2,4-dioxo-4,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-6-(hydroxymethyl)morpholine 在 吡啶 、 potassium tert-butylate 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 methyl 6-(trityloxymethyl)-2-(uracil-1-yl)morpholine-4-carbodithioate
  参考文献：
  名称：

  N-氟烷基化吗啉代——一类新的核苷类似物

  摘要：

  报道了首次合成N-氟烷基化吗啉代核苷衍生物。这些程序基于双还原胺化-环化反应，使用市售的单、二和三氟烷基化胺，或基于吗啉代氮的环化后三氟甲基化，通过氧化脱硫-氟化与 NBS 和二乙基氨基三氟化硫。

  DOI：

  10.1002/chem.202203248
• 作为产物：
  描述：

  2',3',5'-三乙酰尿苷 在 sodium periodate 、 ammonium cerium (IV) nitrate 、 氨 、 碘 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.75h， 生成 2-(2,4-dioxo-4,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-6-(hydroxymethyl)morpholine
  参考文献：
  名称：

  嘧啶吗啉核苷5-碘衍生物的有效合成

  摘要：

  核苷的吗啉衍生物作为合成 DNA 或 siRNA 类似物的单体广泛用于医学和生物学。它们被认为是抗癌、抗病毒、抗菌和抗寄生虫治疗以及生物分析应用的有前途的药物。Morpholino 寡核苷酸是反义治疗中影响深远的候选者。Eteplirsen，吗啉代磷酸二酰胺寡核苷酸，于 2016 年被 FDA 批准用于治疗杜兴氏肌营养不良症。吗啉代核苷三磷酸似乎是 DNA 聚合酶 b 和 HIV-1 逆转录酶的底物，而吗啉代胸苷三磷酸被发现是 Taq DNA 聚合酶的底物. 使用杂环碱基处卤化的核苷衍生物为核苷、核苷酸、和寡核苷酸。核苷的碘衍生物最常用于交叉偶联反应中的进一步官能化，因为它们比溴和氯更具反应性。此前，已报道了含有 1a 的 N-Tr 保护的吗啉代核苷的合成。同一作者发表了一种制备含有 5-碘胞嘧啶作为杂环碱基的 40-N-Trand 20-OCH2-甲硅烷基保护的吗啉代核苷的程序。该方法包

  DOI：

  10.1080/00304948.2018.1462063

文献信息

• Synthesis of Components for the Generation of Constitutional Dynamic Analogues of Nucleic Acids
  作者：David T. Hickman、Nampally Sreenivasachary、Jean-Marie Lehn

  DOI：10.1002/hlca.200890022

  日期：2008.1

  medium, template), would provide an alternative approach to the de novo design of functional dynamic bio-macromolecules. As a first step towards this goal, various mono- and bifunctionalised (hetero- and homotopic) nucleic acid-derived building blocks of type I–X have been synthesised for the generation of dynamic main-chain and side-chain reversible nucleic acid analogues. Hydrazide- and/or acetal

  动态共价聚合物的引入（其中单体单元通过可逆共价键连接并且可以进行组分交换）为功能材料的产生开辟了新的可能性。将这种方法扩展到能够在水介质中生成动态生物聚合物的过程中，能够使构造（序列，长度）适应外部因素（例如环境，介质，模板），这将为功能动力学的从头设计提供一种替代方法。生物大分子。作为朝着这个目标迈出的第一步，各种I - X型单官能和双官能（异位和同位）核酸衍生构件已经合成了用于产生动态主链和侧链可逆核酸类似物的化合物。选择了由酰肼和/或乙缩醛（受保护的羰基）官能化的组分，它们在柔韧性，长度，净形式电荷和酰肼/缩醛取代基方面有所不同，以探讨这些因素如何影响性能（结构，溶解度） ，分子识别特征）可能由缩聚产生的聚合物产物。
• Synthesis and Biophysical Properties of Phosphorodiamidate Piperidino Oligomers
  作者：Atanu Ghosh、Masaaki Akabane-Nakata、Jayanta Kundu、Joel M. Harp、Mimouna Madaoui、Martin Egli、Muthiah Manoharan、Surajit Sinha

  DOI：10.1021/acs.orglett.2c04067

  日期：2023.2.17

  We report the synthesis of piperidino nucleoside phosphoramidates functionalized with uracil, cytosine, guanine, and adenine and their incorporation into oligomers. High-performance liquid chromatography analyses demonstrated that a phosphorodiamidate piperidino oligomer (PPO) is more lipophilic than a phosphorodiamidate morpholino oligomer (PMO) of the same tetrameric sequence. A PMO containing piperidino

  我们报告了用尿嘧啶、胞嘧啶、鸟嘌呤和腺嘌呤功能化的哌啶核苷氨基磷酸酯的合成及其与低聚物的结合。高效液相色谱分析表明，二氨基磷酸酯哌啶低聚物 (PPO) 比具有相同四聚体序列的二氨基磷酸酯吗啉代低聚物 (PMO) 更具亲脂性。含有哌啶子残基的 PMO 与 DNA 和 RNA 形成双链体，并且 PPO 比 PMO 在内体溶解 pH 下具有更高的稳定性和更高的疏水性。
• Nucleic acid-polypeptide compositions and uses thereof
  申请人：AVIDITY BIOSCIENCES, INC.

  公开号：US11110180B2

  公开（公告）日：2021-09-07

  Disclosed herein are compositions and pharmaceutical formulations that comprise a binding moiety conjugated to a modified polynucleic acid molecule and a polymer. Also described herein include methods for treating a cancer which utilize a composition or a pharmaceutical formulation comprising a binding moiety conjugated to a polynucleic acid molecule and a polymer.

  本文公开的组合物和药物制剂包括与修饰的多核酸分子和聚合物共轭的结合分子。本文还描述了利用组合物或药物制剂治疗癌症的方法，组合物或药物制剂包含与多核酸分子和聚合物共轭的结合分子。