作者:Bopha Kong、Tanmaya Joshi、Matthew J. Belousoff、Yitzhak Tor、Bim Graham、Leone Spiccia
DOI:10.1016/j.jinorgbio.2015.11.029
日期:2016.9
ribosomal A-site RNA revealed that they bind to the A-site with slightly higher affinities than the parent aminoglycoside (e.g., IC50 at pH 7 = 1.42–2.30 μM vs. 2.35 μM for neomycin B). This is attributed to the higher overall positive charge of the conjugates, resulting from protonation of the macrocylic amines. Consistent with a predominantly electrostatic mode of interaction, the binding affinities of
通过常规肽偶联方案,由这些前体的适当保护的衍生物合成了三种新的偶联物,其特征在于氨基糖苷类抗生素新霉素B通过不同长度的烷基链连接到1,4,7,10-四氮杂环十二烷(环素)大环上。最终产物通过1 H NMR光谱,质谱和元素分析进行表征。基于FRET的测量方法检查了化合物从Dy547标记的原核糖体A位点RNA置换香豆素标记的卡那霉素A或新霉素B的能力,发现它们以比亲代氨基糖苷稍高的亲和力与A位点结合(例如,pH值7时的IC 50 = 1.42–2.30μM,相对于。新霉素B为2.35μM)。这归因于由大环胺的质子化导致的结合物的更高的总正电荷。与主要的静电相互作用方式一致,发现缀合物的结合亲和力随pH降低而增加,反映出在较低pH下质子化程度更高。发现新霉素B-细胞周期蛋白缀合物的锌(II)配合物以更高的亲和力与A位点RNA结合(IC 50 = 0.85-1.32μM),这是因为Zn(II)-周