cyclo(-D-Tyr-L-Arg-L-Arg-[3-(2-naphthyl)-L-Ala]-β-Ala-)

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: cyclo(-D-Tyr-L-Arg-L-Arg-[3-(2-naphthyl)-L-Ala]-β-Ala-)
• 英文别名: 1-[3-[(2R,5S,8S,11S)-8-(3-guanidinopropyl)-2-[(4-hydroxyphenyl)methyl]-11-(2-naphthylmethyl)-3,6,9,12,16-pentaoxo-1,4,7,10,13-pentazacyclohexadec-5-yl]propyl]guanidine；2-[3-[(2R,5S,8S,11S)-8-[3-(diaminomethylideneamino)propyl]-2-[(4-hydroxyphenyl)methyl]-11-(naphthalen-2-ylmethyl)-3,6,9,12,16-pentaoxo-1,4,7,10,13-pentazacyclohexadec-5-yl]propyl]guanidine
• 化学式: C₃₇H₄₉N₁₁O₆
• 分子量: 743.866
• InChiKey: IBJHGVXJAHTFBW-GCXHJFECSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.1
• 重原子数：
  54
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  295
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  FMOC-beta-丙氨酸 、 Fmoc-O-叔丁基-D-酪氨酸 、 Fmoc-3-(2-萘基)-L-丙氨酸 、 Fmoc-Pbf-L-精氨酸 以75%的产率得到cyclo(-D-Tyr-L-Arg-L-Arg-[3-(2-naphthyl)-L-Ala]-β-Ala-)
  参考文献：
  名称：

  基于环肽的趋化因子受体CXCR4拮抗剂的结构活性关系：揭示了侧链和骨架功能的重要性。

  摘要：

  以前，我们已经确定了高效CXCR4拮抗剂2 [cyclo（-D-Tyr1-Arg2-Arg3-Nal4-Gly5-）]及其Arg2差向异构体3 [cyclo（-D-Tyr1-D-Arg2-Arg3-Nal4- （Gly5-）]通过筛选基于五残基CXCR4拮抗剂1的结构-活性关系研究而设计的环状五肽文库。在本研究中，合成了一系列新的类似物2和3，以评估肽侧链和骨架修饰对生物活性的影响。根据Ala扫描研究，其中2和3中的每个残基都被具有相同手性的Ala取代，用Ala取代Arg3和Nal4 [Nal = L-3-（2-萘基）丙氨酸]（化合物6， 7，10，11）导致效力显着降低，表明这些氨基酸是生物活性的重要贡献者。对于环状肽主链，进行了几种修饰，包括在Gly5位置的d / I-Ala或环状氨基酸取代以及酰胺氮上的连续N-甲基化。在类似物中，化合物13 [环（-D-Tyr1-Arg2-Arg3-Nal4-D-Ala5-）]和32

  DOI：

  10.1021/jm0607350

文献信息

• Structure−Activity Relationships of Cyclic Peptide-Based Chemokine Receptor CXCR4 Antagonists:  Disclosing the Importance of Side-Chain and Backbone Functionalities
  作者：Satoshi Ueda、Shinya Oishi、Zi-xuan Wang、Takanobu Araki、Hirokazu Tamamura、Jérôme Cluzeau、Hiroaki Ohno、Shuichi Kusano、Hideki Nakashima、John O. Trent、Stephen C. Peiper、Nobutaka Fujii

  DOI：10.1021/jm0607350

  日期：2007.1.1

  2. NMR and conformational analysis indicated that both of these analogues favor the same backbone conformation as 2, whereas similar analysis of less potent analogues indicates that an altered backbone conformation is favored. The conformational analysis showed that steric repulsion by a 1,3-allylic strain-like effect across the planar peptide bond might contribute to the conformational preferences

  以前，我们已经确定了高效CXCR4拮抗剂2 [cyclo（-D-Tyr1-Arg2-Arg3-Nal4-Gly5-）]及其Arg2差向异构体3 [cyclo（-D-Tyr1-D-Arg2-Arg3-Nal4- （Gly5-）]通过筛选基于五残基CXCR4拮抗剂1的结构-活性关系研究而设计的环状五肽文库。在本研究中，合成了一系列新的类似物2和3，以评估肽侧链和骨架修饰对生物活性的影响。根据Ala扫描研究，其中2和3中的每个残基都被具有相同手性的Ala取代，用Ala取代Arg3和Nal4 [Nal = L-3-（2-萘基）丙氨酸]（化合物6， 7，10，11）导致效力显着降低，表明这些氨基酸是生物活性的重要贡献者。对于环状肽主链，进行了几种修饰，包括在Gly5位置的d / I-Ala或环状氨基酸取代以及酰胺氮上的连续N-甲基化。在类似物中，化合物13 [环（-D-Tyr1-Arg2-Arg3-Nal4-D-Ala5-）]和32