1-((3aR,4R,6R,6aS)-6-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-2,2-dimethyl-tetrahydrothieno[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-((3aR,4R,6R,6aS)-6-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-2,2-dimethyl-tetrahydrothieno[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• 英文别名: 1-[(3aR,4R,6R,6aS)-6-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrothieno[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]pyrimidine-2,4-dione
• 化学式: C₁₈H₃₀N₂O₅SSi
• 分子量: 414.598
• InChiKey: ZKVMWIYTBYGONP-NMFUWQPSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.69
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  102
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-((3aR,4R,6R,6aS)-6-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-2,2-dimethyl-tetrahydrothieno[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 在 DOWEX 50WX₈ 作用下， 生成 4'-硫代尿苷
  参考文献：
  名称：

  白霉素核苷抗生素硫庚糖核中非典型立体化学的生物合成起源

  摘要：

  白霉素是肽基硫代核苷天然产物，对临床上重要的病原体显示出抗菌活性。它们的结构以具有非典型立体化学的硫庚糖为特征，包括用 d-氨基酸部分修饰的 d-呋喃木糖环。在本文中证明，AbmH 是一种依赖于 5'-磷酸 (PLP) 的吡哆醛转醛缩酶，其催化苏式选择性醛醇型反应以生成具有 d-呋喃核糖环和 l-氨基酸部分的硫庚糖核心。L-氨基酸构型向d-氨基酸构型的转化由PLP依赖性差向异构酶AbmD催化。根据基因缺失实验，硫代呋喃糖环从 d-核糖到 d-木糖的转化似乎是由 AbmJ 介导的，AbmJ 被注释为自由基 S-腺苷-l-甲硫氨酸 (SAM) 酶。

  DOI：

  10.1021/jacs.8b12565
• 作为产物：
  描述：

  2,3-O-异亚丙基-D-核糖酸 gamma-内酯 在 吡啶 、 咪唑 、 sodium tetrahydroborate 、 sodiumsulfide nonahydrate 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 三乙胺 、 间氯过氧苯甲酸 、 potassium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 29.0h， 生成 1-((3aR,4R,6R,6aS)-6-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-2,2-dimethyl-tetrahydrothieno[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  [EN] RIBONUCLEIC ACIDs WITH 4'-THIO-MODIFIED NUCLEOTIDES AND RELATED METHODS
  [FR] ACIDES RIBONUCLÉIQUES AYANT DES NUCLÉOTIDES 4'-THIO-MODIFIÉS ET PROCÉDÉS ASSOCIÉS

  摘要：

  本文揭示了信使RNA分子及相关组合物，其中至少一个核苷酸残基的呋喃糖环中包含4'-硫代修饰，并且使用这些mRNA来在体内产生编码的治疗蛋白质并用于治疗或预防疾病或紊乱的方法。在某些实施例中，4'-硫代修饰的mRNA在体内疗法中提供了增强的稳定性和/或减少的免疫原性。

  公开号：

  WO2014152513A1

文献信息

• A practical synthesis of 4′-thioribonucleosides
  作者：Yuichi Yoshimura、Tetsuya Kuze、Mari Ueno、Fumiko Komiya、Kazuhiro Haraguchi、Hiromichi Tanaka、Fumitaka Kano、Kohei Yamada、Kazuhiro Asami、Nobuaki Kaneko、Hiroki Takahata

  DOI：10.1016/j.tetlet.2005.11.049

  日期：2006.1

  A practical synthesis of 4′-thioribonucleosides starting from inexpensive l-arabinose is described. 1,4-Anhydro-2,3-O-isopropylidene-4-thioribitol, which was prepared by using a novel reductive ring-contraction reaction, was converted to the 5-O-silylated sulfoxides. The Pummerer-type thioglycosylation of the sulfoxides gave the 4′-thioribonucleosides stereoselectively.

  描述了从廉价的1-阿拉伯糖开始的4'-硫代核糖核苷的实际合成。通过使用新型的还原性环收缩反应制备的1,4-脱水-2,3 - O-异亚丙基-4-硫代核糖醇被转化为5-O-甲硅烷基化的亚砜。亚砜的Pummerer型硫糖基化立体选择性地产生了4'-硫代核糖核苷。
• RIBONUCLEIC ACIDs WITH 4'-THIO-MODIFIED NUCLEOTIDES AND RELATED METHODS
  申请人：SHIRE HUMAN GENETIC THERAPIES, INC.

  公开号：US20160031928A1

  公开（公告）日：2016-02-04

  Disclosed are messenger RNA molecules and related compositions incorporating a 4′-thio modification in the furanose ring of at least one nucleotide residue, and methods of using these mRNAs to produce an encoded therapeutic protein in vivo and to treat or prevent diseases or disorders. In certain embodiments, the 4′-thio modified mRNA provides for enhanced stability and/or reduced immunogenicity in in vivo therapies.

  本发明涉及一种信使RNA分子及相关组合物，其中至少一个核苷酸残基的呋喃糖环中包含4'-硫修饰，并且使用这些mRNA在体内产生编码的治疗蛋白质并治疗或预防疾病或疾病的方法。在某些实施方式中，4'-硫修饰的mRNA提供了增强的稳定性和/或减少了体内治疗中的免疫原性。