S-4-fluorobenzoyl coenzyme A

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: S-4-fluorobenzoyl coenzyme A
• 英文别名: 4-Fluorobenzoyl-CoA；S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] 4-fluorobenzenecarbothioate
• 化学式: C₂₈H₃₉FN₇O₁₇P₃S
• 分子量: 889.64
• InChiKey: ORILDBXADZMSHG-TYHXJLICSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.9
• 重原子数：
  57
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  389
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  23

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  S-4-fluorobenzoyl coenzyme A 在 titanium(III) citrate 、 methyl-BzCoA reductase Tcl 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 生成 1,5-dienoyl-CoA
  参考文献：
  名称：

  一种催化多功能的苯甲酰基-CoA还原酶，是反硝化细菌中甲基和卤代苯甲酸酯降解的关键酶。

  摘要：

  I类苯甲酰辅酶A（BzCoA）还原酶（BCR）是芳香族化合物厌氧降解的关键酶。他们可能通过基于自由基的，类似桦木的还原机制催化中央BzCoA中间体及其类似物向ATP依赖性还原成共轭环状1,5-二烯酰基-CoA。于1995年发现的反硝化细菌芳香龙虾（BCRTar）的酶至今仍是唯一分离出的且可从生物化学途径获得的BCR，主要是因为BCR极不稳定，并且迄今为止其异源生产已大大失败。这里，我们描述了一个平台，用于从大肠杆菌中的相关反硝化物种Thauera chlorobenzoica（MBRTcl）编码指定的3-甲基苯甲酰辅酶A还原酶的四个结构基因的异源表达。有人建议参与降解甲基取代的BzCoA类似物。重组的MBRTcl具有一个αβγδ亚基结构，包含三个低电势[4Fe-4S]簇，并且高度不稳定。它催化了BzCoA的ATP依赖性还原脱芳香化反应，每转移两个电子就水解2.3-2.8个ATP，并优先在间

  DOI：

  10.1074/jbc.ra118.003329
• 作为产物：
  描述：

  对氟苯甲酸 、 辅酶 A 在 benzoate-CoA ligase from rhodopseudomonas Palustri 、 5’-三磷酸腺苷 、 magnesium chloride 作用下， 反应 24.0h， 生成 S-4-fluorobenzoyl coenzyme A
  参考文献：
  名称：

  建立用于前体导向的聚酮化合物生物合成的工具包：探索酸性CoA利加斯的底物混杂

  摘要：

  聚酮化合物是化学上多样化且具有医学上重要意义的生物化学物质，它们是通过聚酮化合物合酶从酰基辅酶A前体生物合成的。聚酮化合物的组合生物合成的局限性之一是缺少工具包，该工具包描述了递送聚酮化合物生物合成所必需的新型酰基-CoA前体的方法。使用从各种植物和微生物中获得的5种酸性CoA连接酶，我们通过针对123种羧酸的文库筛选每种酸性CoA连接酶，生物合成了79种酰基CoA硫酯的初始文库。酰基-CoA硫酯库包括肉桂基-CoA，3-苯基丙酰基-CoA，苯甲酰基-CoA，苯乙酰基-CoA，丙二酰-CoA，饱和和不饱和脂族CoA硫酯和双环芳族CoA硫酯的衍生物。在我们对新型酰基辅酶A前体的生物合成路线的搜索中，我们发现了两种以前未报道过的丙二酰辅酶A衍生物（3-硫代苯丙氨酰辅酶A和苯基丙二酰辅酶A），无法通过规范的丙二酰辅酶A合成酶生产。该报告强调了确定常规底物池之外底物混杂的实用性和重要性，并描述了建

  DOI：

  10.1021/bi300425j

文献信息

• Structure–activity analysis of base and enzyme-catalyzed 4-hydroxybenzoyl coenzyme A hydrolysis
  作者：Feng Song、Zhihao Zhuang、Debra Dunaway-Mariano

  DOI：10.1016/j.bioorg.2006.07.002

  日期：2007.2

  a slope (rho) of 1.5. In the case of the enzyme-catalyzed hydrolysis, the kcat/Km values measured for the para-substituted analogs defined substrate specificity. Asp32 was shown to play a key role in substrate recognition, and in particular, in the discrimination between the targeted substrate and other cellular benzoyl-CoA thioesters.

  在这项研究中，碱催化水解的二级速率常数k2和野生型假单胞菌sp的kcat，Km和kcat / Km值。测量了CBS3 4-羟基苯甲酰基辅酶A（4-HBA-CoA）硫酯酶催化的4-HBA-CoA及其对位取代类似物的水解。对于碱催化的水解，logk2对对位取代基的sigma值的图是线性的，斜率（rho）为1.5。在酶催化水解的情况下，对位取代的类似物测得的kcat / Km值定义了底物特异性。Asp32已显示在底物识别中，特别是在目标底物与其他细胞性苯甲酰基-CoA硫酯的区分中起关键作用。
• Dehalogenation of 4-chlorobenzoate
  作者：Frank L�ffler、Franz Lingens、Rudolf M�ller

  DOI：10.1007/bf00700458

  日期：1995.9

  4-chlorobenzoate in a coenzyme A, ATP and Mg2+ dependent reaction to 4-chlorobenzoyl-coenzyme A. This thioester intermediate is dehalogenated by the 4-chlorobenzoyl-coenzyme A dehalogenase. Finally coenzyme A is split off by a 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase to form 4-hydroxybenzoate. The involved 4-chlorobenzoyl-coenzyme A dehalogenase was purified to apparent homogeneity by a five-step purification

  假单胞菌 CBS3能够与4-氯苯甲酸酯一起生长，作为唯一的碳和能量来源。在第一个降解步骤中，通过由三种蛋白质组成的酶系统去除4-氯苯甲酸酯的氯。4-卤代苯甲酸酯-辅酶A连接酶激活辅酶A，ATP和Mg2 +依赖性反应中的4-氯苯甲酸酯成4-氯苯甲酰基-辅酶A。该硫酯中间体通过4-氯苯甲酰基-辅酶A脱卤酶脱卤。最终，辅酶A被4-羟基苯甲酰基-CoA硫酯酶分解形成4-羟基苯甲酸酯。通过五步纯化程序将涉及的4-氯苯甲酰基辅酶A脱卤酶纯化至表观均质。天然酶的表观分子量为120,000，由四个相同的31 kDa的多肽亚基组成。该酶的等电点为6.7。最大的初始催化速率在60℃，pH 10下达到。4-氯苯甲酰基辅酶A的表观Km值为2.4-2.7 microM。Vmax为1.1×10（-7）M sec-1（2.2μmol·min-1mg-1的蛋白质）。确定了NH 2-末端氨基酸序列。除4-氟苯甲酰基辅酶A外
• Thioester-mediated biocatalytic amide bond synthesis with in situ thiol recycling
  作者：Christian Schnepel、Laura Rodríguez Pérez、Yuqi Yu、Antonio Angelastro、Rachel S. Heath、Max Lubberink、Francesco Falcioni、Keith Mulholland、Martin A. Hayes、Nicholas J. Turner、Sabine L. Flitsch

  DOI：10.1038/s41929-022-00889-x

  日期：——

  catalyses the conversion of a wide range of carboxylic acids to acyl-S-Coenzyme A and other thioesters in good yields. CARsr-A was used in situ as part of a recycling system to regenerate thioesters for acyl-S-Coenzyme A-dependent enzymes in one-pot reactions. This concept of thioester recycling is demonstrated with a range of acyltransferases that allow the formation of diverse amides and the non-native

  羧酸活化为硫酯在生物学中起着重要作用。然而，生化研究和生物技术应用受到普遍缺乏硫酯的阻碍，尤其是那些基于辅酶 A (CoA-SH) 的硫酯。在这里，我们通过利用羧酸还原酶 (CAR sr ) 的混杂活性展示了一种通用的硫酯回收酶。CAR sr (CAR sr -A)的腺苷酸化结构域催化各种羧酸以良好的产率转化为酰基-S-辅酶 A 和其他硫酯。汽车_-A 原位用作回收系统的一部分，以在一锅反应中为酰基-S-辅酶 A 依赖性酶再生硫酯。这种硫酯循环的概念通过一系列酰基转移酶得到证明，这些酰基转移酶允许使用表观遗传作者赖氨酸乙酰转移酶 HATp300 形成不同的酰胺和组蛋白衍生肽中赖氨酸侧链的非天然酰化。总的来说，这些结果为硫酯形成向酰胺形成及以后的形成建立了一个通用平台。
• Point Mutations (Q19P and N23K) Increase the Operational Solubility of a 2α-<i>O</i>-Benzoyltransferase that Conveys Various Acyl Groups from CoA to a Taxane Acceptor
  作者：Irosha N. Nawarathne、Kevin D. Walker

  DOI：10.1021/np900524d

  日期：2010.2.26

  Two site-directed Mutations within the wild-type 2-O-benzoyltransferase (tbt) cDNA, from Taxus cuspidata plants, yielded air encoded protein containing replacement amino acids at Q19P and N23K that trial) to a solvent-exposed loop region. The likely significant changes in the biophysical properties invoked by these mutations Caused the overexpressed, modified TBT (mTBT) to partition into the Soluble enzyme fraction about 5-fold greater than the wild-type enzyme. Sufficient protein could now be acquired to examine the scope of the substrate specificity of mTBT by incubation with 7,13-O,O-diacetyl-2-O-debenzoylbaceatin III that was mixed individually with various substituted benzoyls, alkanoyls, and (E)-butenoyl CoA donors. The mTBT catalyzed the conversion of each 7,13-O,O-diacetyl-2-O-debenzoylbaccatin III to several 7,13-O,O-diacetyl-2-O-acyl-2-O-debenzoylbaccatin III analogues. The relative catalytic efficiency of mTBT with the 7,13-O,O-diacetyl-2-O-debenzoyl surrogate Substrate and heterole carbonyl CoA substrates was slightly greater than with the natural aroyl substrate benzoyl CoA, While substituted benzoyl CoA thioesters were less productive. Short-chain hydrocarbon carbonyl and cyclohexanoyl CoA thioesters were also productive, where C-4 Substrates were transferred by mTBT with similar to 10- to 17-fold greater catalytic efficiency compared to the transfer of benzoyl. The described broad specificity of mTBT suggests (flat a plethora of 2-O-acyl variants of the antimitotic paclitaxel can be assembled through biocatalytic sequences.
• Establishing a Toolkit for Precursor-Directed Polyketide Biosynthesis: Exploring Substrate Promiscuities of Acid-CoA Ligases
  作者：Maybelle Kho Go、Jeng Yeong Chow、Vivian Wing Ngar Cheung、Yan Ping Lim、Wen Shan Yew

  DOI：10.1021/bi300425j

  日期：2012.6.5

  biosynthesized from acyl-CoA precursors by polyketide synthases. One of the limitations to combinatorial biosynthesis of polyketides has been the lack of a toolkit that describes the means of delivering novel acyl-CoA precursors necessary for polyketide biosynthesis. Using five acid-CoA ligases obtained from various plants and microorganisms, we biosynthesized an initial library of 79 acyl-CoA thioesters by screening

  聚酮化合物是化学上多样化且具有医学上重要意义的生物化学物质，它们是通过聚酮化合物合酶从酰基辅酶A前体生物合成的。聚酮化合物的组合生物合成的局限性之一是缺少工具包，该工具包描述了递送聚酮化合物生物合成所必需的新型酰基-CoA前体的方法。使用从各种植物和微生物中获得的5种酸性CoA连接酶，我们通过针对123种羧酸的文库筛选每种酸性CoA连接酶，生物合成了79种酰基CoA硫酯的初始文库。酰基-CoA硫酯库包括肉桂基-CoA，3-苯基丙酰基-CoA，苯甲酰基-CoA，苯乙酰基-CoA，丙二酰-CoA，饱和和不饱和脂族CoA硫酯和双环芳族CoA硫酯的衍生物。在我们对新型酰基辅酶A前体的生物合成路线的搜索中，我们发现了两种以前未报道过的丙二酰辅酶A衍生物（3-硫代苯丙氨酰辅酶A和苯基丙二酰辅酶A），无法通过规范的丙二酰辅酶A合成酶生产。该报告强调了确定常规底物池之外底物混杂的实用性和重要性，并描述了建