5'-N-(2,2,2-trifluoroethyl)-[(2,3-O-isopropylidene-β-D-ribofuranosyl)adenine]uronamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 5'-N-(2,2,2-trifluoroethyl)-[(2,3-O-isopropylidene-β-D-ribofuranosyl)adenine]uronamide
• 英文别名: 5'-N-(2,2,2-trifluoroethyl)-2',3'-O-isopropylidenecarboxamidoadenosine；(3aR,4R,6S,6aS)-4-(6-aminopurin-9-yl)-2,2-dimethyl-N-(2,2,2-trifluoroethyl)-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxole-6-carboxamide
• 化学式: C₁₅H₁₇F₃N₆O₄
• 分子量: 402.333
• InChiKey: ITCXCNLPGBXWFJ-LOKDSWTASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.2
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  126
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-N-(2,2,2-trifluoroethyl)-[(2,3-O-isopropylidene-β-D-ribofuranosyl)adenine]uronamide 在 三氟乙酸 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 4.0h， 以76%的产率得到(2S,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxy-N-(2,2,2-trifluoroethyl)tetrahydrofuran-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  8-取代的、syn 配置的腺苷衍生物作为来自类异戊二烯生物合成的非甲羟戊酸途径的酶 IspE 的潜在抑制剂

  摘要：

  用于类异戊二烯生物合成的非甲羟戊酸途径的酶是治疗各种疾病（包括疟疾）的药物的有吸引力的靶点。我们在此描述了在 C(5') 具有不同取代基的几种 8-溴化或 8-胺化腺苷衍生物的基于结构的设计、合成、构象分析和生物学评估，靶向 IspE 蛋白的 ATP-腺嘌呤结合位点。非甲羟戊酸途径。溶液中和固态中腺苷衍生物的详尽构象分析证实了所需的腺嘌呤部分的顺式取向。尽管这种与辅因子袋结合的有利预组织，抑制剂的生物学评估仅显示非常温和的抑制活性。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201501150
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-异丙叉腺苷 在 对硝基苯酚 、 2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物 、 碘苯二乙酸 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 5'-N-(2,2,2-trifluoroethyl)-[(2,3-O-isopropylidene-β-D-ribofuranosyl)adenine]uronamide
  参考文献：
  名称：

  8-取代的、syn 配置的腺苷衍生物作为来自类异戊二烯生物合成的非甲羟戊酸途径的酶 IspE 的潜在抑制剂

  摘要：

  用于类异戊二烯生物合成的非甲羟戊酸途径的酶是治疗各种疾病（包括疟疾）的药物的有吸引力的靶点。我们在此描述了在 C(5') 具有不同取代基的几种 8-溴化或 8-胺化腺苷衍生物的基于结构的设计、合成、构象分析和生物学评估，靶向 IspE 蛋白的 ATP-腺嘌呤结合位点。非甲羟戊酸途径。溶液中和固态中腺苷衍生物的详尽构象分析证实了所需的腺嘌呤部分的顺式取向。尽管这种与辅因子袋结合的有利预组织，抑制剂的生物学评估仅显示非常温和的抑制活性。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201501150

文献信息

• Synthesis and General Biological Activity of a Small Adenosine-5′-(Carboxamide and Sulfanilamide) Library
  作者：Omar Moukha-Chafiq、Robert C. Reynolds

  DOI：10.1080/15257770.2014.931588

  日期：2014.11.2

  A small library of fifty-five adenosine peptide analogs was synthesized, under the Pilot Scale Library (PSL) Program of the NIH Roadmap initiative, from 2′,3′-O-isopropylideneadenosine-5′-carboxylic acid 2. The coupling of amine or sulfanilamide reactants to the free 5′-carboxylic acid moiety of 2, in automated solution-phase fashion, led after acid-mediated hydrolysis to target compounds 3–57 in good

  在NIH路线图倡议的中试规模图书馆（PSL）计划下，从2'，3'-O-异丙基亚氨腺苷-5'-羧酸2合成了一个55个腺苷肽类似物的小图书馆。胺或磺胺反应物，以游离5'-羧酸部分联接2，在自动化的解决方案相时尚，酸介导的水解以目标后导致化合物3-57以良好的收率和高的纯度。初步细胞测试未发现明显的抗癌或抗疟活性。但是，通过MLPCN程序进行的初步筛选表明，这些类似物可能显示出多样而有趣的生物学活性。
• 5‘-<i>N</i>-Substituted Carboxamidoadenosines as Agonists for Adenosine Receptors
  作者：Maarten de Zwart、Angeliki Kourounakis、Huub Kooijman、Anthony L. Spek、Regina Link、Jacobien K. von Frijtag Drabbe Künzel、Ad P. IJzerman

  DOI：10.1021/jm9804984

  日期：1999.4.22

  Novel as well as known 5'-N-substituted carboxamidoadenosines were prepared via new routes that provided shorter reaction times and good yields. Binding affinities were determined for rat A1 and A2A receptors and human A3 receptors. EC50 values were determined for cyclic AMP production in CHO cells expressing human A2B receptors. On all receptor subtypes relatively small substituents on the carboxamido

  通过新的途径制备了新颖的和已知的5'-N-取代的羧酰胺基腺苷，它们提供了较短的反应时间和良好的产率。测定对大鼠A1和A2A受体以及人A3受体的结合亲和力。确定表达人A2B受体的CHO细胞中环状AMP产生的EC50值。在所有受体亚型上，羧酰胺基部分上相对较小的取代基是最佳的。已发现几种类似物（1a，1d，1h和1k）对A3受体的选择性。在A1受体上，许多化合物（但不是5'-N-乙基羧酰胺基腺苷）（NECA，1b）显示出小的GTP位移，这可能表明A1受体的内在活性较低。在A2B受体上，与A2B参考激动剂NECA（1b）相比，具有修饰的乙基取代基的衍生物1i-k的活性降低。硫代甲酰胺基衍生物（8b和8c）虽然A2B受体活性降低，但显示出可观的性能。进行化合物8b的X射线结构测定。由于晶体结构中羧酰胺基NH和嘌呤N3之间的分子内氢键，该化合物的核糖部分处于顺式构象。但是，理论计算支持NECA（1b
• Optimization of Adenosine 5′-Carboxamide Derivatives as Adenosine Receptor Agonists Using Structure-Based Ligand Design and Fragment Screening
  作者：Dilip K. Tosh、Khai Phan、Zhan-Guo Gao、Andrei A. Gakh、Fei Xu、Francesca Deflorian、Ruben Abagyan、Raymond C. Stevens、Kenneth A. Jacobson、Vsevolod Katritch

  DOI：10.1021/jm300095s

  日期：2012.5.10

  Structures of G protein-coupled receptors (GPCRs) have a proven utility in the discovery of new antagonists and inverse ago fists modulating signaling of this important family of clinical targets. Applicability of active-state GPCR structures to virtual screening and rational optimization of agonists, however, remains to be assessed. In this study of adenosine 5' derivatives, we evaluated the performance of an agonist-bound A(2A) adenosine receptor (AR) structure in retrieval of known agonists and then employed the structure to screen for new fragments optimally fitting the corresponding subpocket. Biochemical and functional assays demonstrate high affinity of new derivatives that include polar heterocycles. The binding models also explain modest selectivity gain for some substituents toward the closely related A(1)AR subtype and the modified agonist efficacy of some of these ligands. The study suggests further applicability of in silico fragment screening to rational lead optimization in GPCRs.
• 8-Substituted,<i>syn</i>-Configured Adenosine Derivatives as Potential Inhibitors of the Enzyme IspE from the Non-Mevalonate Pathway of Isoprenoid Biosynthesis
  作者：Michael Harder、Elisabeth Schäfer、Tobias Kümin、Boris Illarionov、Adelbert Bacher、Markus Fischer、François Diederich、Bruno Bernet

  DOI：10.1002/ejoc.201501150

  日期：2015.11

  The enzymes of the non-mevalonate pathway for isoprenoid biosynthesis are attractive targets for drugs against various diseases, including malaria. We describe herein the structure-based design, synthesis, conformational analysis, and biological evaluation of several 8-brominated or 8-aminated adenosine derivatives with different substituents at C(5′), targeting the ATP-adenine binding site of the

  用于类异戊二烯生物合成的非甲羟戊酸途径的酶是治疗各种疾病（包括疟疾）的药物的有吸引力的靶点。我们在此描述了在 C(5') 具有不同取代基的几种 8-溴化或 8-胺化腺苷衍生物的基于结构的设计、合成、构象分析和生物学评估，靶向 IspE 蛋白的 ATP-腺嘌呤结合位点。非甲羟戊酸途径。溶液中和固态中腺苷衍生物的详尽构象分析证实了所需的腺嘌呤部分的顺式取向。尽管这种与辅因子袋结合的有利预组织，抑制剂的生物学评估仅显示非常温和的抑制活性。