tert-butyl 14-azido-3,6,9,12-tetraoxatetradecanoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机1,3-偶极化合物 - 烯丙基型1,3-偶极有机化合物
• 英文名称: tert-butyl 14-azido-3,6,9,12-tetraoxatetradecanoate
• 英文别名: Azido-PEG4-CH2-Boc；tert-butyl 2-[2-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]acetate
• 化学式: C₁₄H₂₇N₃O₆
• 分子量: 333.385
• InChiKey: SIOLYQZSIFQODW-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.93
• 拓扑面积：
  77.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl 14-azido-3,6,9,12-tetraoxatetradecanoate 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 14-azido-3,6,9,12-tetraoxatetradecanoic acid
  参考文献：
  名称：

  基于吡咯并吡啶酮衍生物的小分子BRD4降解物的开发。

  摘要：

  含溴结构域的蛋白质4（BRD4）在基因转录的表观遗传调控中起着至关重要的作用，一些BRD4抑制剂已被推进临床试验。但是，BRD4抑制剂的临床应用可能会受到耐药性的限制。作为一种替代策略，新兴的靶向靶向嵌合体蛋白水解（PROTAC）技术具有克服传统小分子药物耐药性的潜力。基于PROTACs方法，开发了几种BRD4降解物，并已证明它们可降解BRD4蛋白并抑制肿瘤生长。本文中，我们介绍了基于吡咯并吡啶酮衍生物的BRD4降解物的设计，合成和生物学评估。四种合成的化合物在低纳摩尔浓度下对IC50的BRD4 BD1表现出相对的效力。与BRD4抑制剂ABBV-075相比，32a对BxPC3细胞系（IC50 = 0.165μM）的抗增殖活性提高了约7倍。此外，降解物32a以时间依赖性方式有效诱导BRD4的降解并抑制BxPC3细胞系中c-Myc的表达。对细胞内抗肿瘤机制的探索显示了32a诱导的细胞周期阻滞和

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2020.103817
• 作为产物：
  描述：

  四乙二醇单对甲苯磺酸酯 在 sodium azide 、 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 丙酮 、 mineral oil 为溶剂， 反应 12.5h， 生成 tert-butyl 14-azido-3,6,9,12-tetraoxatetradecanoate
  参考文献：
  名称：

  KRASG12C-PROTACs 的设计、合成和生物学评价

  摘要：

  几种KRAS G 12 C的小分子共价抑制剂在治疗KRAS突变癌方面取得了突破性进展。然而，KRAS G 12 C小分子抑制剂的临床应用可能会受到适应性耐药的限制。新兴的PROTAC策略可以与小分子抑制剂实现优势互补，提高抗肿瘤疗效。基于AMG-510，设计并合成了一系列新型KRAS G 12 C -PROTACs。蛋白降解实验表明PROTACs I-1、II-1、III-2和IV-1对KRAS G具有结合和降解能力12 ℃。III-2和IV-1显示出对下游 p-ERK 的有效抑制作用，并且比 AMG-510 更有效。机理研究表明，PROTACs 通过泛素-蛋白酶体途径发挥降解作用。使用对 KRAS G 12 C敏感的细胞系，评估了化合物的抗增殖活性。测试的 PROTAC 显示出总体抗增殖活性。此外，还总结了 KRAS G 12 C -PROTAC 的构效关系 (SARs) 。这些结果支持使用

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2023.117153

文献信息

• Amide bond-containing monodisperse polyethylene glycols beyond 10 000 Da
  作者：Zihong Wan、Yu Li、Shaowei Bo、Ming Gao、Xuemeng Wang、Kai Zeng、Xin Tao、Xuefei Li、Zhigang Yang、Zhong-Xing Jiang

  DOI：10.1039/c6ob01286h

  日期：——

  valuable in biomedical applications, their synthesis remains a long-standing challenge. To this end, a peptide-based strategy for such M-PEGs was developed. With macrocyclic sulfates as the key intermediates, a panel of oligoethylene glycol (OEG) containing ω-amino acids were prepared with high efficiency. Through solid phase peptide synthesis (SPPS), these amino acids were conveniently assembled into a series

  尽管大于4000 Da的单分散聚乙二醇（M-PEG）在生物医学应用中特别有价值，但其合成仍然是一项长期的挑战。为此，开发了用于这种M-PEG的基于肽的策略。以大环硫酸盐为主要中间体，高效制备了一组含有ω-氨基酸的低聚乙二醇（OEG）。通过固相肽合成（SPPS），这些氨基酸可以方便地组装成一系列具有酰胺键的M-PEG，在分子量和酰胺密度选择方面具有很高的灵活性。通过这种策略，以克为单位制备了10 262 Da的M-PEG，并在小鼠模型中评估了其生物相容性。
• [EN] TARGETED DRUG DELIVERY THROUGH AFFINITY BASED LINKERS<br/>[FR] ADMINISTRATION CIBLÉE D'UN MÉDICAMENT FAISANT APPEL À DES COUPLEURS FONDÉS SUR L'AFFINITÉ
  申请人：INVICTUS ONCOLOGY PVT LTD

  公开号：WO2015148126A1

  公开（公告）日：2015-10-01

  The current invention discloses targeted drug delivery conjugates comprising a targeting moiety linked to a drug via a molecule having an affinity for the targeting moiety. Typically, the conjugate comprises a targeting ligand and a molecule of interest, e.g., a therapeutic agent. The targeting ligand and the molecule of interest are linked to each other via an affinity ligand. The affinity ligand is further covalently or non-covalently linked to a drug or therapeutic agent. The drug can be modified to make it more soluble and so that it cleaves from the linking molecule at the target site.

  当前的发明揭示了包括通过具有与靶向基团亲和力的分子连接到药物的靶向药物传递共轭物。通常，该共轭物包括一个靶向配体和一个感兴趣的分子，例如，一个治疗剂。靶向配体和感兴趣的分子通过一个亲和配体相互连接。该亲和配体进一步以共价或非共价方式连接到药物或治疗剂。药物可以被修改以使其更溶解，并使其在靶点处从连接分子中解离。
• COMPOUNDS AND METHODS FOR THE TARGETED DEGRADATION OF ENHANCER OF ZESTE HOMOLOG 2 POLYPEPTIDE
  申请人：Arvinas, Inc.

  公开号：US20180177750A1

  公开（公告）日：2018-06-28

  The present disclosure relates to bifunctional compounds, which find utility as modulators of enhancer of zeste homolog 2 (target protein). In particular, the present disclosure is directed to bifunctional compounds, which contain on one end a Von Hippel-Lindau, cereblon, Inhibitors of Apotosis Proteins or mouse double-minute homolog 2 ligand which binds to the respective E3 ubiquitin ligase and on the other end a moiety which binds the target protein, such that the target protein is placed in proximity to the ubiquitin ligase to effect degradation (and inhibition) of target protein. The present disclosure exhibits a broad range of pharmacological activities associated with degradation/inhibition of target protein. Diseases or disorders that result from aggregation or accumulation of the target protein are treated or prevented with compounds and compositions of the present disclosure.

  本公开涉及双功能化合物，其作为增强子锁定同源2的调节剂而发挥作用。具体而言，本公开涉及包含一端为Von Hippel-Lindau、cereblon、凋亡抑制蛋白或鼠双分子同源2配体的双功能化合物，该配体与相应的E3泛素连接酶结合，另一端含有结合目标蛋白的基团，使目标蛋白靠近泛素连接酶以实现目标蛋白的降解（和抑制）。本公开展示了与目标蛋白的降解/抑制相关的广泛药理活性范围。本公开的化合物和组合物用于治疗或预防由目标蛋白聚集或积累导致的疾病或紊乱。
• Intracellular Protein-Labeling Probes for Multicolor Single-Molecule Imaging of Immune Receptor–Adaptor Molecular Dynamics
  作者：Ryota Sato、Jun Kozuka、Masahiro Ueda、Reiko Mishima、Yutaro Kumagai、Akimasa Yoshimura、Masafumi Minoshima、Shin Mizukami、Kazuya Kikuchi

  DOI：10.1021/jacs.7b08262

  日期：2017.12.6

  multicolor SMI of intracellular proteins is challenging because of high background signals and other limitations of current fluorescence labeling approaches. To achieve reproducible intracellular SMI, a labeling probe ensuring both efficient membrane permeability and minimal non-specific binding to cell components is essential. We developed near-infrared fluorescent probes for protein labeling that specifically

  单分子成像 (SMI) 已被广泛用于研究活细胞中的生物分子动力学和蛋白质 - 蛋白质相互作用。然而，由于高背景信号和当前荧光标记方法的其他限制，细胞内蛋白质的多色 SMI 具有挑战性。为了实现可重复的细胞内 SMI，确保有效的膜通透性和与细胞成分的非特异性结合最小的标记探针是必不可少的。我们开发了用于蛋白质标记的近红外荧光探针，该探针与突变的 β-内酰胺酶标签特异性结合。通过细胞通透性的结构微调和最小化非特异性结合，SiRcB4 与基于 HaloTag 的红色荧光探针结合实现了多色 SMI。在加入亚纳摩尔浓度的两种化学探针后，单分子成像揭示了 TLR4 及其衔接蛋白 TIRAP 的动态，它们参与了先天免疫系统。对动力学中的定量特性和时间推移变化的统计分析揭示了响应配体刺激的蛋白质-蛋白质相互作用。
• METHOD FOR CELL MEMBRANE PERMEATION FOR COMPOUND
  申请人：HitGen LTD.

  公开号：US20160153002A1

  公开（公告）日：2016-06-02

  The present invention discloses a cell-penetrating method for compounds, comprising the following steps of: (1) preparing raw materials, i.e., the compounds and DNA or RNA; (2) linking: linking the compounds to the DNA or RNA to obtain a molecular conjugate; and (3) transferring: transferring the molecular conjugate obtained in the step (2) into cells by a gene transfer method. The present invention further discloses a structure of a molecular conjugate for transmembrane transfer and a method for synthesizing the molecular conjugate. The method of the present invention effectively solves a problem of low membrane permeability of compounds, so that the compounds enter the cell to act on targets thereof, thus to provide a novel drug-delivery way. The method of the present invention may be used for clinical treatment by drugs with low membrane permeability. This method significantly increases the quantity of potential drugs, and the clinical application of many drugs which are eliminated due to their low membrane permeability becomes possible. The method of the present invention may be used for capturing unknown targets of drugs in cells and conducting researches on the target mechanism. This method significantly shortens the course of research and development of drugs and has excellent application prospect.

  本发明公开了一种化合物的细胞穿透方法，包括以下步骤：(1)准备原材料，即化合物和DNA或RNA；(2)连接：将化合物连接到DNA或RNA以获得分子共轭物；和(3)转移：通过基因转移方法将在步骤(2)中获得的分子共轭物转移到细胞中。本发明还公开了一种用于跨膜转移的分子共轭物的结构和合成该分子共轭物的方法。本发明的方法有效解决了化合物低膜通透性的问题，使化合物进入细胞作用于其靶标，从而提供了一种新的药物传递方式。本发明的方法可用于具有低膜通透性的药物的临床治疗。该方法显著增加了潜在药物的数量，并使许多因其低膜通透性而被淘汰的药物的临床应用成为可能。本发明的方法可用于在细胞中捕获药物的未知靶标并对靶标机制进行研究。该方法显著缩短了药物研发过程，并具有极佳的应用前景。