(1S,3R,4R,7S)-7-Benzyloxy-1-methanesulfonyloxymethyl-3-(guanine-9-yl)-2,5-dioxabicyclo[2:2:1]heptane

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (1S,3R,4R,7S)-7-Benzyloxy-1-methanesulfonyloxymethyl-3-(guanine-9-yl)-2,5-dioxabicyclo[2:2:1]heptane
• 英文别名: [(1S,3R,4R,7S)-3-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-7-phenylmethoxy-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-1-yl]methyl methanesulfonate
• 化学式: C₁₉H₂₁N₅O₇S
• 分子量: 463.471
• InChiKey: OGONTUKTNBLIEK-AHMDFLBRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  165
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-(2-O-acetyl-3-O-benzyl-4-C-methanesulfonyloxymethyl-5-O-methanesulfonyl-β-D-ribofuranosyl)-2-amino-6-chloro purine 、 3-羟基丙腈 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 、 mineral oil 为溶剂， 生成 (1S,3R,4R,7S)-7-Benzyloxy-1-methanesulfonyloxymethyl-3-(guanine-9-yl)-2,5-dioxabicyclo[2:2:1]heptane
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of purine locked nucleic acid analogues

  摘要：

  本发明涉及一种用于合成嘌呤LNA（Locked Nucleic Acid）类似物的新方法，该方法提供了更高的总产率。该方法包括选择性区域9-N嘌呤糖基化反应，然后是在嘌呤环中的6-取代基上进行一锅核亲电芳香取代反应，同时核亲电引发的C-支链碳水化合物的分子内环闭合，形成新的嘌呤LNA类似物。新策略通过合成新化合物（1S,3R,4R,7S）-7-苄氧基-1-甲磺酰甲基-3-(鸟嘌呤-9-基)-2,5-二氧杂二环［2.2.1］庚烷来加以说明，该化合物易于转化为（1S,3R,4R,7S）-7-羟基-1-羟甲基-3-((2-N-异丁酰鸟嘌呤-9-基)-2,5-二氧杂二环［2.2.1］庚烷，经过对2-氨基嘌呤基的异丁酰保护和随后的1-甲磺酰与苯甲酸苄酯取代、去苯甲酰和去苄基化反应。

  公开号：

  US20020086998A1

文献信息

• Synthesis of [2.2.1]bicyclo nucleosides
  申请人：Exiqon A/S

  公开号：US20030092905A1

  公开（公告）日：2003-05-15

  A synthesis of [2.2.1]bicyclo nucleosides which is shorter and provides higher overall yields proceeds via the key intermediate of the general formula III, wherein R 4 and R 5 are, for instance, sulfonates and R 7 is, for instance, a halogen or an acetate. From compounds of the general formula II, such as 3-O-aryl-4-C-hydroxymethyl-1,2-O-isopropylidene-&agr;-D-ribofuranose, intermediates of the general formula III are suitable for coupling with silylated nucleobases. Upon one-pot base-induced ring-closure and desulfonation of the formed [2.2.1]bicyclo nucleoside, a short route to each the LNA (Locked Nucleic Acid) derivatives of adenosine, cytosine, uridine, thymidine and guanidine is demonstrated. The use of the 5′-sulfonated ring-closed intermediate also allows for synthesis of 5′-amino- and thio-LNAs. 1

  通过通式III的关键中间体进行合成[2.2.1]双环核苷，该方法较短且提供更高的总收率，其中R4和R5例如为磺酸盐，R7例如为卤素或醋酸盐。从通式II的化合物，例如3-O-芳基-4-C-羟甲基-1,2-O-异丙基亚-D-核糖，通式III的中间体适用于与硅化核苷碱进行偶联。通过一锅法碱催化环闭合和去磺酸化形成的[2.2.1]双环核苷，演示了腺嘌呤、胞嘧啶、尿嘧啶、胸腺嘧啶和鸟嘌呤的LNA（锁定核酸）衍生物的短路线。使用5'-磺酸化环闭合中间体还允许合成5'-氨基和硫代-LNA。
• IMPROVED SYNTHESIS OF ¬2.2.1|BICYCLO NUCLEOSIDES
  申请人：Exiqon A/S

  公开号：EP1163250B1

  公开（公告）日：2006-07-12
• US6639059B1
  申请人：——

  公开号：US6639059B1

  公开（公告）日：2003-10-28
• US6998484B2
  申请人：——

  公开号：US6998484B2

  公开（公告）日：2006-02-14
• Synthesis of purine locked nucleic acid analogues
  申请人：——

  公开号：US20020086998A1

  公开（公告）日：2002-07-04

  The present invention relates to a new method for the synthesis of purine LNA (Locked Nucleic Acid) analogues which provides a higher overall yield. The method comprising a regioselective 9-N purine glycosylation reaction followed by a one-pot nucleophilic aromatic substitution reaction of the 6-substituent in the purine ring and simultaneous nucleophile-induced intramolecular ring closure of the C-branched carbohydrate to form novel purine LNA analogues. The novel strategy is illustrated by the synthesis of the novel compound (1S,3R,4R,7S)-7-benzyloxy-1-methanesulfonylmethyl-3-(guanin-9-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane which is easily converted into (1S,3R,4R,7S)-7-hydroxy-1-hydroxymethyl-3-((2-N-isobutyrylguanin-9-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane after isobutyryl protection of the 2-amino purine group and subsequent substitution of 1-methanesulfonyl with benzoate, debenzoylation and debenzylation.

  本发明涉及一种用于合成嘌呤LNA（Locked Nucleic Acid）类似物的新方法，该方法提供了更高的总产率。该方法包括选择性区域9-N嘌呤糖基化反应，然后是在嘌呤环中的6-取代基上进行一锅核亲电芳香取代反应，同时核亲电引发的C-支链碳水化合物的分子内环闭合，形成新的嘌呤LNA类似物。新策略通过合成新化合物（1S,3R,4R,7S）-7-苄氧基-1-甲磺酰甲基-3-(鸟嘌呤-9-基)-2,5-二氧杂二环［2.2.1］庚烷来加以说明，该化合物易于转化为（1S,3R,4R,7S）-7-羟基-1-羟甲基-3-((2-N-异丁酰鸟嘌呤-9-基)-2,5-二氧杂二环［2.2.1］庚烷，经过对2-氨基嘌呤基的异丁酰保护和随后的1-甲磺酰与苯甲酸苄酯取代、去苯甲酰和去苄基化反应。