N¹-(4-(2-((2S,3S,5S)-2-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl)-1,3-dithian-2-yl)phenyl)-N⁸-hydroxyoctanediamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: N¹-(4-(2-((2S,3S,5S)-2-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl)-1,3-dithian-2-yl)phenyl)-N⁸-hydroxyoctanediamide
• 英文别名: N-[4-[2-[(2S,3S,5S)-2-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]-1,3-dithian-2-yl]phenyl]-N'-hydroxyoctanediamide
• 化学式: C₃₄H₅₂N₄O₇S₂Si
• 分子量: 721.027
• InChiKey: OBLYOUHZDXWOHW-DURBRWELSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.28
• 重原子数：
  48
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  197
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (5S)-5-(tert-butyldimethylsilanyloxymethyl)-5H-furan-2-one 在 2,6-二甲基吡啶 、 正丁基锂 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 盐酸羟胺 、 palladium diacetate 、 双(2-氧代-3-恶唑烷基)次磷酰氯 、 sodium hydride 、 二异丁基氢化铝 、 caesium carbonate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 2-二环己基磷-2,4,6-三异丙基联苯 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 1,2-二氯乙烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 21.5h， 生成 N¹-(4-(2-((2S,3S,5S)-2-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl)-1,3-dithian-2-yl)phenyl)-N⁸-hydroxyoctanediamide
  参考文献：
  名称：

  组蛋白脱乙酰基酶和DNA拓扑异构酶II靶向抑制剂的合成和生物学评估

  摘要：

  HDAC抑制剂可使组蛋白保持高度乙酰化。染色质DNA产生的较松散状态可以增加DNA药物靶标的可及性，从而提高靶向DNA的抗癌药物（如Topo II抑制剂）的效率。基于拓扑异构酶II和组蛋白脱乙酰基酶抑制剂的协同抗肿瘤作用，设计和合成了一类新型的核苷-SAHA衍生物。评估了它们对组蛋白脱乙酰基酶和Topo II的抑制活性，以及​​它们在癌细胞系中的细胞毒性。在合成的杂化化合物中，化合物16b在低纳摩尔水平下显示出有效的HDAC抑制活性，并在低微摩尔水平下表现出对癌细胞系（包括MCF-7（乳腺癌），HCT-116（结肠）和DU-145（前列腺）癌细胞）的抗增殖活性。此外，化合物16a的HDAC6-选择性是HDAC1的20倍。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2018.02.042

文献信息

• Synthesis and biological evaluation of histone deacetylase and DNA topoisomerase II-Targeted inhibitors
  作者：Mitsuaki Yamashita、Teruyuki Tahara、Shinya Hayakawa、Hironobu Matsumoto、Shun-ichi Wada、Kiyoshi Tomioka、Akira Iida

  DOI：10.1016/j.bmc.2018.02.042

  日期：2018.5

  topoisomerase II and histone deacetylase inhibitors. Their inhibitory activities toward histone deacetylases and Topo II, and their cytotoxicities in cancer cell lines, were evaluated. Among the synthesized hybrid compounds, compound 16b showed the potent HDAC inhibitory activity at a low nanomolar level and exhibited antiproliferative activity toward cancer cell lines including MCF-7 (breast), HCT-116

  HDAC抑制剂可使组蛋白保持高度乙酰化。染色质DNA产生的较松散状态可以增加DNA药物靶标的可及性，从而提高靶向DNA的抗癌药物（如Topo II抑制剂）的效率。基于拓扑异构酶II和组蛋白脱乙酰基酶抑制剂的协同抗肿瘤作用，设计和合成了一类新型的核苷-SAHA衍生物。评估了它们对组蛋白脱乙酰基酶和Topo II的抑制活性，以及​​它们在癌细胞系中的细胞毒性。在合成的杂化化合物中，化合物16b在低纳摩尔水平下显示出有效的HDAC抑制活性，并在低微摩尔水平下表现出对癌细胞系（包括MCF-7（乳腺癌），HCT-116（结肠）和DU-145（前列腺）癌细胞）的抗增殖活性。此外，化合物16a的HDAC6-选择性是HDAC1的20倍。